BMKCloud Log in
条形banner-03

Produk

10x Transkriptom Spatial Visium Genomics

Transkriptomi spatial ialah teknologi canggih yang membolehkan penyelidik menyiasat corak ekspresi gen dalam tisu sambil mengekalkan konteks spatialnya.Satu platform berkuasa dalam domain ini ialah 10x Genomics Visium ditambah dengan penjujukan Illumina.Prinsip 10X Visium terletak pada cip khusus dengan kawasan tangkapan yang ditetapkan di mana bahagian tisu diletakkan.Kawasan tangkapan ini mengandungi tempat berkod bar, setiap satu sepadan dengan lokasi spatial yang unik dalam tisu.Molekul RNA yang ditangkap daripada tisu kemudiannya dilabelkan dengan pengecam molekul unik (UMI) semasa proses transkripsi terbalik.Tempat berkod bar dan UMI ini membolehkan pemetaan spatial dan kuantifikasi ekspresi gen yang tepat pada resolusi sel tunggal.Gabungan sampel berkod bar ruang dan UMI memastikan ketepatan dan kekhususan data yang dijana.Dengan menggunakan teknologi Spatial Transcriptomics ini, penyelidik boleh memperoleh pemahaman yang lebih mendalam tentang organisasi ruang sel dan interaksi molekul kompleks yang berlaku dalam tisu, menawarkan pandangan yang tidak ternilai tentang mekanisme yang mendasari proses biologi dalam pelbagai bidang, termasuk onkologi, neurosains, biologi perkembangan, imunologi. , dan kajian botani.

Platform: 10X Genomics Visium dan Illumina NovaSeq


  • Harga FOB:US $0.5 - 9,999 / Sekeping
  • Kuantiti Pesanan Min:100 Keping/Keping
  • Keupayaan bekalan:10000 Keping/Keping setiap Bulan
  • Butiran Perkhidmatan

    Bioinformatik

    Keputusan Demo

    Penerbitan pilihan

    ciri-ciri

    ● Resolusi: 100 µM

    ● Diameter Titik: 55 µM

    ● Bilangan tempat: 4992

    ● Kawasan tangkapan: 6.5 x 6.5 mm

    ● Setiap tempat berkod bar dimuatkan dengan primer yang terdiri daripada 4 bahagian:

    - ekor poli(dT) untuk penyebuan mRNA dan sintesis cDNA

    - Pengecam Molekul Unik (UMI) untuk membetulkan bias amplifikasi

    - Kod bar ruang

    - Jujukan pengikatan buku asas jujukan 1 bacaan separa

    ● pewarnaan H&E bahagian

    Kelebihan

    Perkhidmatan sehenti: menyepadukan semua pengalaman dan langkah berasaskan kemahiran, termasuk pembahagian krio, pewarnaan, pengoptimuman tisu, pengekodan bar spatial, penyediaan perpustakaan, penjujukan dan bioinformatik .

    ● Pasukan teknikal yang berkemahiran tinggi: dengan pengalaman dalam lebih 250 jenis tisu dan 100+ spesies termasuk manusia, tikus, mamalia, ikan dan tumbuhan.

    Kemas kini masa nyata pada keseluruhan projek: dengan kawalan penuh kemajuan eksperimen.

    Bioinformatik standard yang komprehensif:pakej termasuk 29 analisis dan 100+ angka berkualiti tinggi.

    Analisis dan visualisasi data tersuai: tersedia untuk permintaan penyelidikan yang berbeza.

    Analisis bersama pilihan dengan penjujukan mRNA sel Tunggal

    Spesifikasi

    Keperluan Sampel

    Perpustakaan

    Strategi urutan

    Data disyorkan

    Kawalan kualiti

    Sampel cryo terbenam OCT, sampel FFPE

    (Diameter optimum: lebih kurang 6x6x6 mm3)

    3 blok setiap sampel

    10X Visium cDNA perpustakaan

    Illumina PE150

    50K bacaan PE setiap tempat

    ( 60Gb )

    RIN>7

    Untuk butiran lanjut tentang panduan penyediaan sampel dan aliran kerja perkhidmatan, sila hubungi a

    Aliran Kerja Perkhidmatan

    Dalam fasa penyediaan sampel, percubaan pengekstrakan RNA pukal awal dilakukan untuk memastikan RNA berkualiti tinggi boleh diperolehi.Dalam peringkat pengoptimuman tisu bahagian diwarnakan dan divisualisasikan dan keadaan permeabilisasi untuk pelepasan mRNA daripada tisu dioptimumkan.Protokol yang dioptimumkan kemudiannya digunakan semasa pembinaan perpustakaan, diikuti dengan penjujukan dan analisis data.

    Aliran kerja perkhidmatan yang lengkap melibatkan kemas kini masa nyata dan pengesahan pelanggan untuk mengekalkan gelung maklum balas yang responsif, memastikan pelaksanaan projek yang lancar.

    图片4

  • Sebelumnya:
  • Seterusnya:

  • 10x (9)

     

    Termasuk analisis berikut:

     Kawalan Kualiti Data:

    o Output data dan taburan skor kualiti

    o Pengesanan gen setiap tempat

    o Liputan tisu

     Analisis sampel dalaman:

    o Kekayaan gen

    o Pengelompokan titik, termasuk analisis dimensi yang dikurangkan

    o Analisis ekspresi pembezaan antara kelompok: pengenalpastian gen penanda

    o Anotasi fungsional dan pengayaan gen penanda

     Analisis antara kumpulan

    o Gabungan semula tompok daripada kedua-dua sampel (cth. berpenyakit dan kawalan) dan kelompok semula

    o Pengenalpastian gen penanda bagi setiap kelompok

    o Anotasi fungsional dan pengayaan gen penanda

    o Ungkapan Berbeza bagi kelompok yang sama antara kumpulan

    Analisis sampel dalaman

    Pengelompokan titik

    10x (10)

     

    Pengenalpastian gen penanda dan pengedaran spatial

     

    10x (12)

    10x (11)

     

    Analisis Antara Kumpulan

    Gabungan data daripada kedua-dua kumpulan dan kelompok semula

    10x (13)

     

     

    Gen penanda kluster baharu

    图片5

    Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan transkriptomi spatial BMKGene oleh 10X Visium Dalam penerbitan pilihan ini:

    Chen, D. et al.(2023) 'mthl1, homolog Drosophila yang berpotensi bagi GPCR lekatan mamalia, terlibat dalam tindak balas antitumor terhadap sel onkogenik yang disuntik dalam lalat', Prosiding Akademi Sains Kebangsaan Amerika Syarikat, 120(30), hlm.e2303462120.doi: /10.1073/pnas.2303462120

    Chen, Y. et al.(2023) 'STEEL membolehkan persempadanan tinggi data transkriptik spatiotemporal', Taklimat dalam Bioinformatik, 24(2), ms 1–10.doi: 10.1093/BIB/BBAD068.

    Liu, C. et al.(2022) 'A atlas spatiotemporal organogenesis dalam pembangunan bunga orkid', Penyelidikan Asid Nukleik, 50(17), ms 9724–9737.doi: 10.1093/NAR/GKAC773.

    Wang, J. et al.(2023) 'Mengintegrasikan Transkriptik Spatial dan Penjujukan RNA Nukleus Tunggal Mendedahkan Strategi Terapeutik Berpotensi untuk Leiomyoma Rahim', Jurnal Sains Biologi Antarabangsa, 19(8), ms 2515–2530.doi: 10.7150/IJBS.83510.

    mendapatkan sebut harga

    Tulis mesej anda di sini dan hantarkan kepada kami

    Hantar mesej anda kepada kami: