penjujukan circRNA-Illumina
ciri-ciri
● pengurangan rRNA diikuti dengan penyediaan perpustakaan berarah, membolehkan data penjujukan yang khusus helai.
● Aliran kerja bioinformatik membolehkan ramalan circRNA dan kuantifikasi ekspresi
Kelebihan Perkhidmatan
●Perpustakaan RNA yang lebih komprehensif:kami menggunakan pengurangan rRNA dan bukannya pengurangan RNA linear dalam penyediaan pra-perpustakaan kami, memastikan bahawa data penjujukan termasuk bukan sahaja circRNA tetapi juga mRNA dan lncRNA, yang membolehkan analisis bersama pada set data ini
●Analisis pilihan rangkaian RNA endogen (ceRNA) kompetitif: memberikan pandangan yang lebih mendalam tentang mekanisme pengawalseliaan selular
●Kepakaran Luas: dengan rekod prestasi memproses lebih 20,000 sampel di BMK, merangkumi pelbagai jenis sampel dan projek lncRNA, pasukan kami membawa banyak pengalaman kepada setiap projek.
●Kawalan Kualiti yang Teguh: kami melaksanakan titik kawalan teras merentas semua peringkat, daripada penyediaan sampel dan perpustakaan kepada penjujukan dan bioinformatik.Pemantauan yang teliti ini memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
● Sokongan Selepas Jualan: Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan.Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | QC Data |
| Poli A diperkaya | Illumina PE150 | 16-20 Gb | S30≥85% |
Keperluan Sampel:
Nukleotida:
| Conc.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Kesucian | Integriti |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA terhad atau tiada ditunjukkan pada gel. | Untuk tumbuhan: RIN≥6.5; Untuk haiwan: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; terhad atau tiada ketinggian garis dasar |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Seluruh darah:2 tiub
● Sel: 106 sel
● Serum dan Plasma: 6 mL
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: 2 ml tiub empar (Kerajang timah tidak disyorkan)
Pelabelan sampel: Kumpulan+replikasi cth A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan dikebumikan dalam ais kering.
2. Tiub RNAstable: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth RNAstable®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Contoh penghantaran
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Urutan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
ramalan circRNA: taburan kromosom
CircRNAs Diungkapkan Berbeza - Plot gunung berapi
circRNAs Diungkapkan Berbeza – pengelompokan hierarki
Pengayaan fungsi gen tuan rumah circRNA
Terokai kemajuan penyelidikan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan circRNA BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 mengawal pembentukan circRNA dan pembungkaman gen pengantara mikroRNA dalam karsinoma hepatoselular', Oncogene 2021 40:25, 40(25), ms 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) 'Transkriptom X oo-responsif mendedahkan peranan RNA133 pekeliling dalam rintangan penyakit dengan mengawal selia ekspresi OsARAB dalam beras', Penyelidikan Phytopathology, 5(1), ms 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/RAJAH/6.
Y, H. et al.(2023) 'CPSF3 memodulasi keseimbangan transkrip bulat dan linear dalam karsinoma hepatoselular'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Penilaian menyeluruh circRNAs dalam kardiomiopati sirosis sebelum dan selepas pemindahan hati', International Immunopharmacology, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
