Penjujukan Tanpa Pengekodan Panjang-Illumina
Kelebihan Perkhidmatan
●Analisis bersama mRNA dan lncRNADengan menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan kajian lncRNA dan sasarannya, adalah mungkin untuk mendapatkan gambaran keseluruhan yang mendalam tentang mekanisme pengawalseliaan yang mendasari tindak balas selular.
●Kepakaran LuasKami telah memproses lebih 230,000 sampel, merangkumi pelbagai sampel dan objektif projek. Kami membawakan kepakaran yang luas kepada setiap projek.
●Analisis bersama mRNA dan lncRNAKami menggabungkan kuantifikasi transkrip mRNA dengan kajian lncRNA dan sasarannya, memungkinkan untuk mendapatkan gambaran keseluruhan yang mendalam tentang mekanisme pengawalseliaan yang mendasari tindak balas selular.
●Kawalan Kualiti yang KetatKami melaksanakan titik kawalan teras merentasi semua peringkat, daripada penyediaan sampel hinggalah penyediaan perpustakaan, penjujukan dan bioinformatik. Pemantauan teliti kami memastikan penyampaian hasil yang berkualiti tinggi secara konsisten.
●Anotasi KomprehensifKami menggunakan pelbagai pangkalan data untuk menganotasi Gen Terekspresi Secara Berbeza (DEG) secara berfungsi dan menjalankan analisis pengayaan yang sepadan. Pendekatan komprehensif ini memberikan pandangan tentang proses selular dan molekul yang mendasari tindak balas transkriptom, memastikan anda mendapat semua maklumat yang mungkin tentang data eksperimen anda.
●Sokongan Pasca JualanKami faham betapa pentingnya untuk hadir, sebab itu komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Dalam tempoh ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menjawab sebarang pertanyaan berkaitan keputusan.
Keperluan Sampel dan Penghantaran
| Perpustakaan | Platform | Data yang disyorkan | Kualiti Data |
| Perpustakaan berarah rRNA yang berkurangan | Illumina PE150 | 10-16 GB | Q30≥85% |
Nukleotida:
| Konk.(ng/μl) | Jumlah (μg) | Ketulenan | Integriti |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Pencemaran protein atau DNA yang terhad atau tiada langsung ditunjukkan pada gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian asas yang terhad atau tiada |
● Tumbuhan:
Akar, Batang atau Kelopak: 450 mg
Daun atau Biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Haiwan:
Jantung atau Usus: 450 mg
Viscera atau Otak: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Artropod:
Serangga: 9g
Krustasea: 450 mg
● Darah penuh:2 tiub
● Sel: 106 sel-sel
● Serum dan Plasma6 ml
Penghantaran Sampel yang Disyorkan
Bekas: Tiub emparan 2 ml (Kerajang timah tidak digalakkan)
Pelabelan sampel: Kumpulkan+replikasi contohnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Penghantaran:
1. Ais kering: Sampel perlu dibungkus dalam beg dan ditanam di dalam ais kering.
2. Tiub RNAstabil: Sampel RNA boleh dikeringkan dalam tiub penstabilan RNA (cth. RNAstabil®) dan dihantar dalam suhu bilik.
Aliran Kerja Perkhidmatan
Reka bentuk eksperimen
Penghantaran sampel
Pengekstrakan RNA
Pembinaan perpustakaan
Penjujukan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Bioinformatik
- Data mentah
- Kualiti Data
- Penjajaran genom
- Struktur gen (Penyambungan alternatif, pengoptimuman struktur gen dan ramalan gen baharu)
- Kuantifikasi ekspresi gen
- Analisis ekspresi pembezaan
- Anotasi dan pengayaan DEG + Gen sasaran lncRNA yang diekspresikan secara berbeza
- Pengenalpastian transkrip
- Pengenalpastian lncRNA (pemuliharaan lncRNA dan lncRNA yang diketahui)
- Ramalan gen sasaran lncRNA
- Kuantifikasi ekspresi lncRNA
- Analisis bersama dengan data mRNA
Analisis Ekspresi Gen Pembezaan (DEG)
Kuantifikasi ekspresi lncRNA – pengelompokan
Pengayaan gen sasaran lncRNA
Analisis kedudukan mRNA bersama dan lncRNA – Plot sirkos (bulatan tengah ialah mRNA dan sirkos dalam ialah lncRNA)
Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan lncRNA BMKGene melalui koleksi penerbitan yang disusun rapi.
Ji, H. et al. (2020) 'Pengenalpastian, ramalan fungsian dan pengesahan lncRNA utama bagi lncRNA berkaitan tekanan sejuk dalam hati tikus',Laporan Saintifik2020 10:1, 10(1), hlm. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analisis Transkriptomik Integratif Mendedahkan Mekanisme Imun untuk Strain Ikan Kap Biasa Tahan CyHV-3',Sempadan dalam Imunologi, 12, hlm. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ dkk. (2022) 'Pengutamaan Berasaskan Integrasi Multi-Omik bagi Rangkaian Pengawalaturan RNA Endogen Bersaing dalam Kanser Paru-paru Sel Kecil: Ciri-ciri Molekul dan Calon Ubat',Sempadan dalam Onkologi, 12, hlm. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Pembedahan genetik rangkaian koekspresi gen yang mendasari fotosintesis dalam Populus',Jurnal Bioteknologi Tumbuhan, 18(4), hlm. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Rangkaian Kawal Selia Global untuk Ekspresi Gen yang Tidak Terregulasi dan Isyarat Metabolik yang Tidak Normal dalam Sel Imun dalam Persekitaran Mikro Penyakit Graves dan Tiroiditis Hashimoto',Sempadan dalam Imunologi, 13, hlm. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
