Penjujukan Metatranskrip
Ciri Perkhidmatan
● pengurangan rRNA diikuti dengan penyediaan perpustakaan mRNA berarah.
● Penjujukan pada Illumina NovaSeq.
Kelebihan Perkhidmatan
●Kaji Perubahan Komuniti Mikrob Kompleks:Ini berlaku pada peringkat transkrip dan meneroka gen baharu yang berpotensi.
●Menjelaskan Interaksi Komuniti Mikrob dengan Hos atau Persekitaran.
●Analisis Bioinformatik Komprehensif: Ini memberikan pandangan tentang taksonomi komuniti dan komposisi fungsi, serta analisis ekspresi gen pembezaan.
●Anotasi Gen yang meluas:Menggunakan pangkalan data fungsi gen terkini untuk maklumat ekspresi gen bermaklumat komuniti mikrob.
●Sokongan Selepas Jualan:Komitmen kami melangkaui penyiapan projek dengan tempoh perkhidmatan selepas jualan selama 3 bulan. Pada masa ini, kami menawarkan susulan projek, bantuan penyelesaian masalah dan sesi Soal Jawab untuk menangani sebarang pertanyaan yang berkaitan dengan keputusan.
Spesifikasi Perkhidmatan
| Platform penjujukan | Strategi Penjujukan | Data disyorkan | Kawalan Kualiti Data |
| Illumina NovaSeq | PE150 | 12Gb | S30≥85% |
Keperluan Sampel
| Kepekatan (ng/µL) | Jumlah amaun (µg) | Isipadu (µL) | OD260/280 | OD260/230 | RIN |
| ≥50 | ≥1.0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6.5 |
Aliran Kerja Perkhidmatan
Contoh penghantaran
Pembinaan perpustakaan
Urutan
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
Termasuk analisis berikut:
● Menjujukan Kawalan Kualiti Data
● Perhimpunan Transkrip
● Anotasi Taksonomi dan Kelimpahan
● Anotasi Fungsian dan Kelimpahan
● Kuantifikasi Ungkapan dan Analisis Pembezaan
Taburan taksonomi setiap sampel:
Analisis kepelbagaian beta: UPGMA
Anotasi fungsian – kelimpahan GO
Kelimpahan taksonomi pembezaan – LEFSE
Terokai kemajuan yang difasilitasi oleh perkhidmatan penjujukan meta transkriptomi BMKGene melalui koleksi penerbitan yang dipilih susun.
Lu, Z. et al. (2023) 'Toleransi asid bakteria yang menggunakan laktat dari urutan Bacteroidales menyumbang kepada pencegahan asidosis ruminal dalam kambing yang disesuaikan dengan diet pekat tinggi',Pemakanan Haiwan, 14, ms 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.
Song, Z. et al. (2017) 'Merungkai mikrobiota fungsi teras dalam penapaian keadaan pepejal tradisional oleh amplikon pemprosesan tinggi dan penjujukan metatranskriptomics',Sempadan dalam Mikrobiologi, 8(JUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/PENUH.
Wang, W. et al. (2022) 'Mikovirus Novel Ditemui daripada Tinjauan Metatranskriptomi bagi Kulat Alternaria Fitopatogenik',Virus, 14(11), hlm. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.
Wei, J. et al. (2022) 'Analisis metatranskriptom selari mendedahkan kemerosotan metabolit sekunder tumbuhan oleh kumbang dan simbion ususnya',Molekul Ekologi, 31(15), ms 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.
