mRNA-seq (NGS) – De novo

Penjujukan mRNA membolehkan pemprofilan semua transkrip mRNA dalam sel di bawah keadaan tertentu dan merupakan teknologi yang digunakan secara meluas dalam pelbagai bidang penyelidikan. Saluran paip mRNA-seq de novo BMKCloud direka bentuk untuk menganalisis pustaka penjujukan yang diperkaya poli-A apabila tiada genom rujukan tersedia. Saluran paip bermula dengan kawalan kualiti, diikuti dengande novopemasangan transkrip dan pemilihan set unigen. Analisis struktur unigen meramalkan jujukan pengekodan (CDS) dan ulangan jujukan mudah (SSR). Seterusnya, analisis ekspresi pembezaan menemui gen yang diekspresikan secara berbeza (DEG) antara keadaan yang diuji, diikuti dengan anotasi fungsi dan pengayaan DEG untuk mengekstrak pandangan biologi.