Penjujukan Bisulfit Perwakilan Terkurang (RRBS)
Spesifikasi Perkhidmatan
Platform: Platform NovaSeq, PE150
Jenis perpustakaan: 200-400bp masukkan perpustakaan DNA yang dirawat bisulfit
Strategi penjujukan: Berpasangan-Tamat 150 bp
Mengesyorkan output data: 10 Gb data mentah/sampel
Keperluan Sampel
Kuantiti DNA: ≥ 2ug
Kepekatan DNA: ≥ 20ng/μl.
Ketulenan: OD260/280 = 1.8 hingga 2.0 tanpa degradasi atau pencemaran RNA
Analisis bioinformatik
Aliran Kerja Perkhidmatan
Contoh penghantaran
Pembinaan perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Perkhidmatan selepas jualan
a.Rujukan statistik penjajaran genom
Statistik bacaan pemetaan
Sstatistik kedalaman penjujukan dan liputan tapak C
Aliputan terkumpul
Dkecekapan penghadaman setiap sampel
b.Pengesanan tapak metilasi
Senarai tahap metilasi di tapak C
BS penukaran
Msitosin tertilasi
Pengagihan tahap metilasi
c.Peta metilasi
Genome-wide
Gunsur enome
d.Perbandingan tahap metilasi antara sampel
PKorelasi melalui udara metilasi CG
PMetilasi CA-CG
Ckilauan metilasi CG
d.Analisis metilasi secara berbeza
Sstatistik DMR
Pengagihan panjang DMR
Hpeta makan
DPengedaran MR di kawasan sasaran
