ĊirkRNA

L-RNAs ċirkolari (circRNAs) huma RNAs mhux kodifikanti li jiffurmaw strutturi ċirkolari u għandhom rwoli regolatorji multipli, inkluż il-kompetizzjoni mal-miRNA għall-ġeni fil-mira u l-irbit tal-proteini. Il-pipeline BMKCloud circRNA huwa ddisinjat għall-analiżi ta' libreriji mnaqqsa mill-rRNA b'ġenoma ta' referenza annotata sew u ta' kwalità għolja. L-analiżi tibda bit-tirqim tal-qari u l-kontroll tal-kwalità, segwit minn allinjament tal-qari mal-ġenoma ta' referenza u tbassir ta' circRNAs ġodda, flimkien mal-identifikazzjoni ta' circRNAs magħrufa minn databases. Il-miri tal-miRNA korrispondenti u l-ospiti taċ-circRNA jiġu sussegwentement identifikati. L-analiżi tal-espressjoni differenzjali tiżvela circRNAs espressi b'mod differenzjali, u l-ospiti korrispondenti jiġu annotati funzjonalment biex jiġu estratti funzjonijiet bijoloġiċi arrikkiti.