Prodotti

Sekwenzar tad-DNA/RNA -PacBio Sequencer

Sekwenzar tad-DNA/RNA -Immaġni Dehru tas-Sekwencer PacBio

Pjattaforma ta 'sekwenzjar PacBio hija pjattaforma ta' sekwenzar li tinqara fit-tul, li hija magħrufa wkoll bħala waħda mit-teknoloġiji tas-Sekwenzar tat-Tielet Ġenerazzjoni (TGS).It-teknoloġija ewlenija, single-molecule real-time (SMRT), tagħti s-setgħa lill-ġenerazzjoni ta 'qari b'għexieren ta' kilo-bażi fit-tul.Fuq il-bażi ta '"Sequencing-by-Synthesis", riżoluzzjoni ta' nukleotide waħda tinkiseb permezz ta 'waveguide Zero-mode (ZMW), fejn volum limitat biss fil-qiegħ (sit tas-sinteżi tal-molekula), huwa mdawwal.Barra minn hekk, is-sekwenzjar SMRT fil-biċċa l-kbira jevita preġudizzju speċifiku għas-sekwenza fis-sistema NGS, peress li ħafna mill-passi ta 'amplifikazzjoni tal-PCR mhumiex meħtieġa fil-proċess tal-kostruzzjoni tal-librerija.

Pjattaforma: Sequel II, Revio

Ikkuntatjana

Dettalji tas-Servizz

Riżultati Demo

Karatteristiċi

Żewġ modi ta’ sekwenzar fuq is-sekwenzjar PacBio: Qari fit-Tul Kontinwu (CLR) u Qari Ċirkolari ta’ Kunsensus (CCS)

Modalità Sekwenzar

Daqs tal-Librerija

Dejta TeoretikaRendiment (Kull Ċellula)

bażi waħdaEżattezza

Applikazzjonijiet

CLR

20Kb, 30Kb, eċċ.

80 Gb sa 130 Gb

Appross.85%

De novo, sejħa SV, eċċ.

CCS

15-20 Kb

14 sa 40 Gb/Ċellula (Sequel II)

70 sa 110 Gb/Ċellula (Revio)

Jiddependi fuq il-kampjuni

Appross.99%

De novo, SNP/Indel/SV calling, Iso-Seq,

Tqabbil tal-prestazzjoni u l-karatteristiċi ta 'Revio u Sequel II

Termini	Sistema Sequel II	Sistema Revio	Żid
Densità ogħla	8 miljun ZMWs	25 miljun ZMWs	3x
Stadji indipendenti	1	4	4x
Ħinijiet ta' ġiri iqsar	30 siegħa	24 siegħa	1.25x
30X HiFi ġenomi umani / sena	88	1,300	15x b'mod ġenerali

Vantaġġi tas-Servizz

● Aktar minn 8 snin esperjenza fuq il-pjattaforma tas-sekwenzjar PacBio b'eluf ta 'proġetti magħluqa b'diversi speċi.

● Mgħammar bis-sħiħ bl-aħħar pjattaformi PacBio Sequencing, Revio biex jiggarantixxi biżżejjed throughput tas-sekwenzjar.

● Ħin ta 'dawran aktar mgħaġġel, rendiment ta' data ogħla u data aktar preċiża.

● Ikkontribwixxa f'mijiet ta' pubblikazzjonijiet b'impatt għoli bbażati fuq PacBio.

Rekwiżiti tal-Kampjun

Tip ta' Kampjun

Ammont

Konċentrazzjoni （Qubit®）

Volum

Purità

Oħrajn

DNA ġenomika

Jiddependi fuq ir-Rekwiżit tad-Data

≥50 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230 = 1.8-2.5;
Il-quċċata ċara f'260 nm,ebda kontaminazzjoni

Il-konċentrazzjoni trid titkejjel b'Qubit u Qubit/Nanopore = 0.8-2.5

RNA totali

≥1.2μg

≥120 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230 = 0.5-2.5;ebda kontaminazzjoni

Valur RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

Fluss tax-Xogħol tas-Servizz

Preparazzjoni tal-kampjun

Kostruzzjoni ta' librerija

Sekwenzar

Analiżi tad-dejta

Twassil tal-proġett

Preċedenti: OEM manifattur Mrna Sequencing Service - Sekwenzar twil mhux kodifikat-Illumina - Biomarker

Li jmiss: Illumina u BGI

1.Rendiment tad-Data interna

Dejta ġġenerata minn 63 ċellula CCS (minn 26 speċi)

DEJTA-PacBio-CCS-15 Kb	Medja	Max	Min	Medjan
Rendiment - subreads (Gb)	421.12	544.27	221.38	426.58
Riżultat - CCS(Gb)	25.93	38.59	10.86	25.43
Polimerażi N50	145,651	175,430	118,118	144,689
Subreads N50	17,509	23,924	12,485	17,584
CCS N50	14,490	19,034	9,876	14,747
Tul medju-Polymerase	67,995	89,379	49,664	66,433
Tul medju-Subreads	15,866	21,036	11,657	16,012
Tul medju-CCS	14,489	19,074	8,575	14,655

Dejta ġġenerata minn 16-il ċellula CLR (minn 76 speċi)

DATA-PacBio-CLR-30Kb	Medja	Max	Min	Medjan
Rendiment - subreads (Gb)	142.20	291.40	50.55	142.49
Polimerażi N50	39,456	121,191	15,389	35,231
Subreads N50	28,490	41,012	14,430	29,063
Tul medju-Polymerase	22,063	48,886	8,747	21,555
Tul medju-Subreads	17,720	27,225	8,293	17,779

2.Data QC - DemoStatistika dwar ir-rendiment tad-data

Kampjun	ccs Qari Num	Bażijiet totali ta' ccs (bp)	ccs Qari N50 (bp)	ccs Tul medju (bp)	ccs l-itwal qari (bp)	subreads Bażijiet (bp)	rata ccs (%)
PB_BMKxxx	3,444,159	54,164,122,586	15,728	15,726	36,110	863,326,330,465	6.27