-
Sekwenzar tal-Immunopreċipitazzjoni tal-Kromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq jipprovdi profili madwar il-ġenoma tal-miri tad-DNA għall-modifika tal-histone, fatturi ta 'traskrizzjoni, u proteini oħra assoċjati mad-DNA.Tgħaqqad is-selettività tal-immuno-preċipitazzjoni tal-kromatina (ChIP) biex tirkupra kumplessi speċifiċi ta 'proteina-DNA, bil-qawwa tas-sekwenzjar tal-ġenerazzjoni li jmiss (NGS) għal sekwenzar ta' produzzjoni għolja tad-DNA rkuprat.Barra minn hekk, minħabba li l-kumplessi proteina-DNA huma rkuprati minn ċelloli ħajjin, is-siti ta 'rbit jistgħu jitqabblu f'tipi ta' ċelluli u tessuti differenti, jew taħt kundizzjonijiet differenti.L-applikazzjonijiet ivarjaw minn regolamentazzjoni tat-traskrizzjoni għal mogħdijiet ta 'żvilupp għal mekkaniżmi ta' mard u lil hinn.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwenzar bisulfit tal-ġenoma kollu
Il-metilazzjoni tad-DNA fil-ħames pożizzjoni fiċ-ċitosina (5-mC) għandha influwenza fundamentali fuq l-espressjoni tal-ġeni u l-attività ċellulari.Mudelli anormali ta 'metilazzjoni ġew assoċjati ma' bosta kundizzjonijiet u mard, bħall-kanċer.WGBS sar l-istandard tad-deheb għall-istudju tal-metilazzjoni mal-ġenoma kollu f'riżoluzzjoni bażi waħda.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq6000
-
Assaġġ għal Transposase-Accessibbli Chromatin b'Sekwenzar ta' Throughput Għoli (ATAC-seq)
ATAC-seq huwa metodu ta 'sekwenzjar ta' produzzjoni għolja għall-analiżi tal-aċċessibbiltà tal-kromatina mal-ġenoma kollu, li huwa importanti għall-kontroll epiġenetiku globali tal-espressjoni tal-ġeni.L-adapters tas-sekwenzjar huma mdaħħla f'reġjuni tal-kromatina miftuħa permezz tat-transposase Tn5 iperattiva.Wara l-amplifikazzjoni tal-PCR, tinbena librerija tas-sekwenzjar.Ir-reġjuni miftuħa kollha tal-kromatin jistgħu jinkisbu taħt kundizzjoni speċifika ta 'spazju-ħin, mhux biss limitati għas-siti ta' rbit ta 'fattur ta' traskrizzjoni, jew ċertu reġjun modifikat ta 'histone.
-
Sekwenzar tal-Bisulfite b'Rappreżentanza Mnaqqsa (RRBS)
Ir-riċerka dwar il-metilazzjoni tad-DNA dejjem kienet suġġett jaħraq fir-riċerka tal-mard, u hija relatata mill-qrib mal-espressjoni tal-ġeni u l-karatteristiċi fenotipiċi.RRBS huwa metodu preċiż, effiċjenti u ekonomiku għar-riċerka tal-metilazzjoni tad-DNA.L-arrikkiment tar-reġjuni tal-gżejjer promotur u CpG permezz ta 'qsim enżimatiku (Msp I), flimkien ma' sekwenzar tal-Bisulfite, jipprovdi skoperta ta 'metilazzjoni tad-DNA b'riżoluzzjoni għolja.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
