Sekwenzar-Illumina twila mhux kodifika
Vantaġġi tas-Servizz
●Analiżi konġunta ta 'mRNA u lncRNA: billi tgħaqqad il-kwantifikazzjoni tat-traskrizzjonijiet tal-mRNA mal-istudju tal-lncRNA u l-miri tagħhom, huwa possibbli li tinkiseb ħarsa ġenerali fil-fond tal-mekkaniżmu regolatorju sottostanti r-rispons ċellulari.
●Kompetenza estensiva: It-tim tagħna jġib ħafna esperjenza għal kull proġett, b'rekord ta 'proċessar ta' aktar minn 23,000 kampjun f'BMK li jkopru diversi tipi ta 'kampjuni u proġetti lncRNA.
●Kontroll Riguż tal-Kwalità: Aħna nimplimentaw punti ta' kontroll ewlenin fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjuni u tal-libreriji sas-sekwenzjar u l-bijoinformatika. Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura l-kunsinna ta' riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
●Appoġġ ta' wara l-bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' wara l-bejgħ ta '3 xhur. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza għas-soluzzjoni tal-problemi, u sessjonijiet ta’ Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.
Rekwiżiti tal-Kampjun u Kunsinna
| Librerija | Pjattaforma | Dejta rakkomandata | Data QC |
| Librerija direzzjonali mnaqqsa rRNA | Illumina PE150 | 10-16 Gb | Q30≥85% |
Nukleotidi:
| Konċ.(ng/μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq il-ġel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazzjoni tal-linja bażi limitata jew l-ebda |
● Pjanti:
Għeruq, Zokk jew Petali: 450 mg
Weraq jew Żerriegħa: 300 mg
Frott: 1.2 g
● Annimali:
Qalb jew Imsaren: 450 mg
Vixxri jew Moħħ: 240 mg
Muskolu: 600 mg
Għadam, Xagħar jew Ġilda: 1.5g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Krustaċji: 450 mg
● Demm sħiħ:2 tubi
● Ċelloli: 106 ċelluli
● Serum u Plażma: 6 mL
Kunsinna tal-Kampjun Rakkomandata
Kontenitur: 2 ml tubu taċ-ċentrifuga (Fojl tal-landa mhux rakkomandat)
Tikkettjar tal-kampjun: Grupp+replika eż. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Konsenja:
1. Is-silġ niexef: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna fis-silġ niexef.
2. Tubi RNAstable: kampjuni RNA jistgħu jitnixxfu f'tubu ta 'stabbilizzazzjoni RNA (eż. RNAstable®) u jintbagħtu f'temperatura tal-kamra.
Fluss tax-Xogħol tas-Servizz
Disinn tal-esperimenti
Kunsinna tal-kampjun
Estrazzjoni tal-RNA
Kostruzzjoni ta' librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-dejta
Servizzi ta’ wara l-bejgħ
Bijoinformatika
Analiżi tal-Espressjoni tal-Ġene Differenzjali (DEGs).
Kwantifikazzjoni tal-espressjoni tal-lncRNA - raggruppament
Arrikkiment tal-ġeni fil-mira lncRNA
Analiżi konġunta tal-pożizzjoni tal-mRNA u l-lncRNA - Plott taċ-Ċirkos (iċ-ċirku tan-nofs huwa mRNA u ċ-ċirkolazzjoni interna hija lncRNA)
Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta’ ekwenzar tal-lncRNA ta’ BMKGene permezz ta’ ġabra ta’ pubblikazzjonijiet ikkurata.
Ji, H. et al. (2020) "Identifikazzjoni, tbassir funzjonali, u verifika ewlenija tal-lncRNA ta 'lncRNAs relatati mal-istress kiesaħ fil-fwied tal-firien", Rapporti Xjentifiċi 2020 10: 1, 10 (1), pp. 1–14. doi: 10.1038/s41598-020-57451-7.
Jia, Z. et al. (2021) 'Analiżi Transcriptomic Integrativa Tiżvela l-Mekkaniżmu Immune għal Razza Komuni tal-Karpjun Reżistenti CyHV-3', Frontiers in Immunology, 12, p. 687151. doi: 10.3389/FIMMU.2021.687151/BIBTEX.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prijoritizzazzjoni bbażata fuq l-Integrazzjoni Multi-Omics ta' Netwerks ta' Regolamentazzjoni ta' RNA Endoġenu Kompetituri f'Kanċer tal-Pulmun ta' Ċelloli Żgħar: Karatteristiċi Molekulari u Kandidati tad-Droga', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xiao, L. et al. (2020) 'Dissezzjoni ġenetika tan-netwerk ta' koespressjoni tal-ġeni sottostanti għall-fotosintesi f'Populus', Plant Biotechnology Journal, 18(4), pp. 1015–1026. doi: 10.1111/PBI.13270.
Zheng, H. et al. (2022) 'Netwerk Regolatorju Globali għall-Espressjoni tal-Ġene Disregolata u Sinjali Metaboliċi Anormali f'Ċelloli Immune fil-Mikroambjent tal-Marda ta' Graves' u Tirojdite ta' Hashimoto', Frontiers in Immunology, 13, p. 879824. doi: 10.3389/FIMMU.2022.879824/BIBTEX.
