BMKCloud Idħol

Prodotti

Is-Sekwenzar tal-Metatranscriptome

Metatrascriptome Sequencing Dehru Immaġni

Billi juża t-teknoloġija ta' sekwenzar Illumina, is-servizz ta' sekwenzar tal-metatranscriptome ta 'BMKGENE jiżvela l-espressjoni tal-ġeni dinamika ta' firxa diversa ta 'mikrobi, li jkopru ewkarjoti sa prokarjoti u viruses, f'ambjenti naturali bħall-ħamrija, l-ilma, il-baħar, l-ippurgar u l-imsaren. Is-servizz komprensiv tagħna jagħti s-setgħa lir-riċerkaturi biex jidħlu fil-profili kompluti tal-espressjoni tal-ġeni tal-komunitajiet mikrobjali kumplessi. Lil hinn mill-analiżi tassonomika, is-servizz tagħna ta 'sekwenzjar tal-metatraskriptomi jiffaċilita l-esplorazzjoni fl-arrikkiment funzjonali, u jitfa' dawl fuq il-ġeni espressi b'mod differenzjali u r-rwoli tagħhom. Skopri minjiera ta 'għarfien bijoloġiku hekk kif tinnaviga l-pajsaġġi kumplessi ta' espressjoni tal-ġeni, diversità tassonomika, u dinamika funzjonali fi ħdan dawn in-niċeċ ambjentali diversi.

Ikkuntattjana

Dettalji tas-Servizz

Bijoinformatika

Riżultati Demo

Pubblikazzjonijiet dehru

Karatteristiċi tas-Servizz

● Tnaqqis tal-rRNA segwit minn preparazzjoni direzzjonali tal-librerija tal-mRNA.

● Sekwenzar fuq Illumina NovaSeq.

Vantaġġi tas-Servizz

●Studja l-Bidliet tal-Komunitajiet Mikrobiċi Kumpless:Dan jiġri fil-livell tat-traskrizzjoni u jesplora ġeni ġodda potenzjali.

●Jispjega l-Interazzjonijiet tal-Komunità Mikrobjali mal-Ospitanti jew l-Ambjent.

●Analiżi Bijoinformatika Komprensiva: Dan jipprovdi għarfien dwar kompożizzjonijiet tassonomiċi u funzjonali tal-komunità, kif ukoll analiżi differenzjali tal-espressjoni tal-ġeni.

●Annotazzjoni estensiva tal-ġeni:Użu ta 'databases aġġornati tal-funzjoni tal-ġeni għal informazzjoni informattiva dwar l-espressjoni tal-ġeni ta' komunitajiet mikrobjali.

●Appoġġ ta' wara l-bejgħ:L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' wara l-bejgħ ta '3 xhur. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza għas-soluzzjoni tal-problemi, u sessjonijiet ta’ Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.

Speċifikazzjonijiet tas-Servizz

Pjattaforma tas-sekwenzjar	Strateġija ta' Sekwenzar	Data rakkomandata	Kontroll tal-Kwalità tad-Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Rekwiżiti tal-Kampjun

Konċentrazzjoni (ng/µL)	Ammont totali (µg)	Volum (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Fluss tax-Xogħol tas-Servizz

Kunsinna tal-kampjun

Kostruzzjoni ta' librerija

Sekwenzar

Analiżi tad-dejta

Servizzi ta' wara l-bejgħ

Preċedenti: Assemblea De novo tal-Ġenoma Fungali

Li jmiss: Sekwenzar ta' RNA prokarjotiku

Jinkludi l-analiżi li ġejja:

● Sekwenzar tal-Kontroll tal-Kwalità tad-Dejta

● Assemblea Traskrizzjoni

● Annotazzjoni Tassonomika u Abbundanza

● Annotazzjoni Funzjonali u Abbundanza

● Kwantifikazzjoni tal-Espressjoni u Analiżi Differenzjali

Distribuzzjoni tassonomika ta' kull kampjun:

Analiżi tad-diversità Beta: UPGMA

Annotazzjoni funzjonali – abbundanza GO

Abbundanza tassonomija differenzjali – LEFSE

Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta’ sekwenzar meta traskriptomika ta’ BMKGene permezz ta’ kollezzjoni ta’ pubblikazzjonijiet ikkurata.

Lu, Z. et al. (2023) “It-tolleranza għall-aċidu ta’ batterji li jużaw il-laktat tal-ordni Bacteroidales tikkontribwixxi għall-prevenzjoni tal-aċidożi fir-ruminal fil-mogħoż adattati għal dieta b’konċentrazzjoni għolja”,Nutrizzjoni tal-Annimali, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Kanzunetta, Z. et al. (2017) "Tħaffir tal-mikrobijota funzjonali tal-qalba fil-fermentazzjoni tradizzjonali ta' l-istat solidu permezz ta' amplicons ta' prestazzjoni għolja u sekwenzar ta' metatraskriptomiċi",Fruntieri fil-Mikrobijoloġija, 8(LUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/FULL.

Wang, W. et al. (2022) "Mikoviruses ġodda Skoperti minn Stħarriġ ta' Metatranscriptomics tal-Fungus Phytopathogenic Alternaria",Viruses, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Analiżi parallela tal-metatraskriptomi tiżvela degradazzjoni tal-metaboliti sekondarji tal-pjanti mill-ħanfus u s-simbjoti tal-imsaren tagħhom',Molekulari Ekoloġija, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.