Idħol fil-BMKCloud

Prodotti

Sekwenzar tal-Metatraskrittoma

Immaġni Dehru tas-Sekwenzjar tal-Metatraskrittoma

Bl-użu tat-teknoloġija tas-sekwenzjar Illumina, is-servizz tas-sekwenzjar tal-metatraskrittomi ta' BMKGENE jiżvela l-espressjoni dinamika tal-ġeni ta' firxa diversa ta' mikrobi, li tkopri l-ewkarjoti għall-prokarjoti u l-vajrusis, f'ambjenti naturali bħall-ħamrija, l-ilma, il-baħar, l-ippurgar, u l-imsaren. Is-servizz komprensiv tagħna jagħti s-setgħa lir-riċerkaturi biex jidħlu fil-fond fil-profili kompluti tal-espressjoni tal-ġeni ta' komunitajiet mikrobjali kumplessi. Lil hinn mill-analiżi tassonomika, is-servizz tas-sekwenzjar tal-metatraskrittomi tagħna jiffaċilita l-esplorazzjoni fl-arrikkiment funzjonali, u jitfa' dawl fuq ġeni espressi b'mod differenzjali u r-rwoli tagħhom. Skopri għadd kbir ta' għarfien bijoloġiku hekk kif tinnaviga l-pajsaġġi kumplessi tal-espressjoni tal-ġeni, id-diversità tassonomika, u d-dinamika funzjonali f'dawn in-niċeċ ambjentali diversi.

Ikkuntattjana

Dettalji tas-Servizz

Bijinformatika

Riżultati tad-Demo

Pubblikazzjonijiet Dehru

Karatteristiċi tas-Servizz

● Tnaqqis tal-rRNA segwit minn preparazzjoni ta' librerija direzzjonali tal-mRNA.

● Sekwenzar fuq Illumina NovaSeq.

Vantaġġi tas-Servizz

●Studja l-Bidliet tal-Komunitajiet Mikrobjali Kumplessi:Dan jiġri fil-livell traskrizzjonali u jesplora ġeni ġodda potenzjali.

●Spjegazzjoni tal-Interazzjonijiet tal-Komunità Mikrobjali mal-Ospitanti jew l-Ambjent.

●Analiżi Bijoinformatika KomprensivaDan jipprovdi għarfien dwar il-kompożizzjonijiet tassonomiċi u funzjonali tal-komunità, kif ukoll analiżi differenzjali tal-espressjoni tal-ġeni.

●Annotazzjoni Estensiva tal-Ġeni:L-użu ta' databases aġġornati dwar il-funzjoni tal-ġeni għal informazzjoni informattiva dwar l-espressjoni tal-ġeni ta' komunitajiet mikrobjali.

●Appoġġ ta' wara l-bejgħ:L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta' servizz ta' wara l-bejgħ ta' 3 xhur. Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza għas-soluzzjoni tal-problemi, u sessjonijiet ta' mistoqsijiet u tweġibiet biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.

Speċifikazzjonijiet tas-Servizz

Pjattaforma tas-sekwenzar	Strateġija ta' Sekwenzar	Dejta rakkomandata	Kontroll tal-Kwalità tad-Data
Illumina NovaSeq	PE150	12Gb	Q30≥85%

Rekwiżiti tal-Kampjun

Konċentrazzjoni (ng/µL)	Ammont totali (µg)	Volum (µL)	OD260/280	OD260/230	RIN
≥50	≥1.0	≥20	1.8-2.0	1.0-2.5	≥6.5

Fluss tax-Xogħol tas-Servizz

Kunsinna tal-kampjun

Kostruzzjoni tal-librerija

Sekwenzar

Analiżi tad-dejta

Servizzi ta' wara l-bejgħ

Preċedenti: Assemblea De novo tal-Ġenoma Fungali

Li jmiss: Sekwenzar tal-RNA Prokarjotiku

Jinkludi l-analiżi li ġejja:

● Kontroll tal-Kwalità tad-Data tas-Sekwenzjar

● Assemblea tat-Traskrizzjoni

● Annotazzjoni Tassonomika u Abbundanza

● Annotazzjoni u Abbundanza Funzjonali

● Kwantifikazzjoni tal-Espressjoni u Analiżi Differenzjali

Distribuzzjoni tassonomika ta' kull kampjun:

Analiżi tad-diversità beta: UPGMA

Annotazzjoni funzjonali – abbundanza ta' GO

Abbundanza tat-tassonomija differenzjali – LEFSE

Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizzi ta' sekwenzjar meta-traskrittomika ta' BMKGene permezz ta' ġabra kkurata ta' pubblikazzjonijiet.

Lu, Z. et al. (2023) 'It-tolleranza għall-aċidu tal-batterji li jużaw il-lattate tal-ordni Bacteroidales tikkontribwixxi għall-prevenzjoni tal-aċidożi ruminali fil-mogħoż adattati għal dieta b'konċentrazzjoni għolja',Nutrizzjoni tal-Annimali, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/J.ANINU.2023.05.006.

Song, Z. et al. (2017) 'L-iżvelar tal-mikrobijota funzjonali ewlenija fil-fermentazzjoni tradizzjonali fi stat solidu permezz ta' amplikoni b'rendiment għoli u sekwenzar metatranskriptomiku',Fruntieri fil-Mikrobijoloġija, 8(LUL). doi: 10.3389/FMICB.2017.01294/SĦIĦ.

Wang, W. et al. (2022) 'Mikoviruses Ġodda Skoperti minn Stħarriġ Metatraskriptomiku tal-Fungus Alternaria Fitopatoġeniku',Viruses, 14(11), p. 2552. doi: 10.3390/V14112552/S1.

Wei, J. et al. (2022) 'Analiżi parallela tal-metatraskrittoma tiżvela d-degradazzjoni tal-metaboliti sekondarji tal-pjanti mill-ħanfus u s-simbjonti tal-imsaren tagħhom',Molekulari Ekoloġija, 31(15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/MEC.16557.