-
Sekwenzar Metaġenomika (NGS)
Metagenome jirreferi għal ġabra ta 'materjal ġenetiku totali ta' komunità mħallta ta 'organiżmi, bħal metaġenomu ambjentali, metaġenomu uman, eċċ. Fih ġenomi ta' mikro-organiżmi kemm kultivabbli kif ukoll mhux kultivabbli.Is-sekwenzjar metaġenomika hija għodda molekulari użata biex tanalizza l-materjali ġenomiċi mħallta estratti minn kampjuni ambjentali, li tipprovdi informazzjoni dettaljata fid-diversità u l-abbundanza tal-ispeċi, l-istruttura tal-popolazzjoni, ir-relazzjoni filoġenetika, il-ġeni funzjonali u n-netwerk ta 'korrelazzjoni ma' fatturi ambjentali.
Pjattaforma:Illumina NovaSeq6000
-
Sekwenzar Metagenomic-Nanopore
Metagenomics hija għodda molekulari użata biex tanalizza l-materjali ġenomiċi mħallta estratti minn kampjuni ambjentali, li tipprovdi informazzjoni dettaljata fid-diversità u l-abbundanza tal-ispeċi, l-istruttura tal-popolazzjoni, ir-relazzjoni filoġenetika, ġeni funzjonali u netwerk ta 'korrelazzjoni ma' fatturi ambjentali, eċċ. Pjattaformi ta 'sekwenzjar ta' Nanopore introduċew reċentement għal studji metaġenomika.Il-prestazzjoni eċċellenti tagħha fit-tul tal-qari tejbet l-analiżi metaġenomika downstream, speċjalment l-assemblaġġ tal-metaġenomu.Filwaqt li tieħu vantaġġi ta 'qari-tul, studju metagenomic ibbażat fuq Nanopore huwa kapaċi jikseb assemblaġġ aktar kontinwu meta mqabbel ma' metagenomics shot-gun.Ġie ppubblikat li l-metaġenomika bbażata fuq Nanopore ġġenerat b'suċċess ġenomi batteriċi kompluti u magħluqa minn mikrobijomi (Moss, EL, et. al,Natura Biotech, 2020)
Pjattaforma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Is-subunità fuq 16S u 18S rRNA li fiha kemm reġjuni kkonservati ħafna kif ukoll iper-varjabbli hija marka tas-swaba 'molekulari perfetta għall-identifikazzjoni ta' organiżmi prokarjotiċi u ewkarjotiċi.Filwaqt li jieħdu vantaġġ mis-sekwenzjar, dawn l-amplicons jistgħu jiġu mmirati bbażati fuq il-partijiet konservati u r-reġjuni iper-varjabbli jistgħu jiġu kkaratterizzati bis-sħiħ għall-identifikazzjoni tal-mikrobi li jikkontribwixxu għal studji li jkopru analiżi tad-diversità tal-mikrobi, tassonomija, filoġenija, eċċ. Molekula waħda f'ħin reali (SMRT). ) is-sekwenzjar tal-pjattaforma PacBio jippermetti l-kisba ta' qari twal preċiżi ħafna, li jistgħu jkopru amplikons ta' tul sħiħ (madwar 1.5 Kb).Il-fehma wiesgħa tal-qasam ġenetiku tejbet ħafna r-riżoluzzjoni fl-annotazzjoni tal-ispeċi fil-komunità tal-batterji jew tal-fungi.
Pjattaforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Is-sekwenzjar tal-amplikon 16S/18S/ITS għandu l-għan li jiżvela l-filoġenija, it-tassonomija u l-abbundanza tal-ispeċi f'komunità mikrobjali billi jinvestiga prodotti PCR ta 'markaturi ġenetiċi ta' manutenzjoni li fihom partijiet kemm konversati ħafna kif ukoll ipervarjabbli.L-introduzzjoni ta 'dawn il-marki tas-swaba' molekulari perfetti minn Woeses et al, (1977) tagħti s-setgħa lill-profiling tal-mikrobijoma mingħajr iżolament.Is-sekwenzjar ta '16S (batterji), 18S (fungi) u spacer traskritt Intern (ITS, fungi) jippermetti l-identifikazzjoni ta' kemm speċi abbundanti kif ukoll speċi rari u mhux identifikati.Din it-teknoloġija qed issir għodda applikata b'mod wiesa 'u maġġuri fl-identifikazzjoni tal-kompożizzjoni mikrobjali differenzjali f'diversi ambjenti, bħal ħalq tal-bniedem, imsaren, ħmieġ, eċċ.
Pjattaforma:Illumina NovaSeq6000
-
Sekwenzar mill-ġdid tal-Ġenoma Sħiħ Batterjali u Fungali
Is-sekwenzjar mill-ġdid tal-ġenoma kollu batterjali u fungali huwa għodda kritika biex jitlestew il-ġenomi ta 'batterji u fungi magħrufa, kif ukoll biex jitqabblu ġenomi multipli jew biex jiġu mmappjati ġenomi ta' organiżmi ġodda.Huwa ta 'importanza kbira li jiġu sekwenzati ġenomi sħaħ ta' batterju u fungi sabiex jiġu ġġenerati ġenomi ta 'referenza preċiżi, biex isiru identifikazzjoni mikrobjali u studji komparattivi oħra tal-ġenoma.
Pjattaforma:Illumina NovaSeq 6000
-
Ġenoma fungali
Teknoloġiji tal-Bijomarkaturi jipprovdu stħarriġ tal-ġenoma, ġenoma fin u ġenoma pene-komplet tal-fungali skont l-għan speċifiku tar-riċerka.Is-sekwenzjar tal-ġenoma, l-assemblaġġ u l-annotazzjoni funzjonali jistgħu jinkisbu billi tikkombina Sekwenzar tal-ġenerazzjoni li jmiss + Sekwenzar tat-tielet ġenerazzjoni biex jinkiseb assemblaġġ tal-ġenoma ta 'livell għoli.It-teknoloġija Hi-C tista' tintuża wkoll biex tiffaċilita l-assemblaġġ tal-ġenoma fil-livell tal-kromożomi.
Pjattaforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Batterji Ġenoma Tlesti
Biomarker Technologies tipprovdi servizz ta' sekwenzar fuq il-kostruzzjoni ta' ġenoma komplut ta' batterji b'vojt żero.Il-fluss tax-xogħol ewlieni tal-kostruzzjoni sħiħa tal-ġenoma tal-batterja jinkludi sekwenzar tat-tielet ġenerazzjoni, assemblaġġ, annotazzjoni funzjonali u analiżi bijoinformatika avvanzata li tissodisfa għanijiet speċifiċi ta 'riċerka.Profil aktar komprensiv tal-ġenoma tal-batterja jagħti s-setgħa li jiżvelaw mekkaniżmi fundamentali sottostanti l-proċessi bijoloġiċi tagħhom, li jistgħu wkoll jipprovdu referenza siewja għal riċerki ġenomiċi fi speċi ewkarjotiċi ogħla.
Pjattaforma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
