条形 Banner-03

Prodotti

Sekwenzar Metagenomic-TGs

图片 67

Metagenome huwa ġabra tal-materjal ġenetiku ta 'komunità mħallta ta' organiżmi, bħal metagenomi ambjentali u umani. Fih ġenomi ta 'mikro-organiżmi kemm cultivatable kif ukoll inkultivabbli. Is-sekwenzar metagenomiku jippermetti l-istudju ta 'dawn il-pajsaġġi ġenomiċi kkomplikati inkorporati f'kampjuni ekoloġiċi billi jipprovdu aktar minn profil tassonomiku. Huwa joffri wkoll perspettiva ta 'ġenomika funzjonali billi jesplora l-ġeni kodifikati u r-rwoli putattivi tagħhom fil-proċessi ambjentali. Filwaqt li l-approċċi tas-senter tradizzjonali bis-sekwenzar ta 'Illumina intużaw ħafna fi studji metagenomiċi, il-miġja ta' sekwenzar ta 'nanopore u pacbio li qari fit-tul biddlu l-qasam. It-teknoloġija Nanopore u Pacbio jtejbu l-analiżi bijoinformatiċi 'l isfel, b'mod partikolari l-assemblaġġ tal-metagenome, li jiżgura assemblaġġi aktar kontinwi. Ir-rapporti jindikaw li metagenomics ibbażati fuq in-nanopore u bbażati fuq il-pacbio ġġeneraw b'suċċess ġenomi batteriċi kompluti u magħluqa minn mikrobiomi kumplessi (Moss, El, et al., Nature Biotech, 2020). L-integrazzjoni ta 'Nanopore Reads ma' Illumina Reads tipprovdi approċċ strateġiku għall-korrezzjoni ta 'żbalji, li jtaffi l-eżattezza baxxa inerenti ta' Nanopore. Din il-kombinazzjoni sinerġistika tħaddem is-saħħiet ta 'kull pjattaforma ta' sekwenzar, li toffri soluzzjoni robusta biex tingħeleb il-limitazzjonijiet potenzjali u tavvanza l-preċiżjoni u l-affidabbiltà ta 'analiżi metagenomiċi.

Pjattaforma: Nanopore Promethion 48, Illumia u Pacbio Revio


Dettalji tas-Servizz

Bijoinformatika

Riżultati demo

Pubblikazzjonijiet dehru

Karatteristiċi tas-servizz

● Sekwenzar ta 'Aqra fit-tul fuq Nanopore P48 (librerija 10kb); Pacbio Revio (8kb librerija)

● Korrezzjoni ta 'Żball: Sekwenzar fuq Illumina Novaseq (Librerija PE150)

Vantaġġi tas-Servizz

Assemblea ta 'metagenome ta' kwalità għolja:B'inqas kontigs li għandhom kontinwità ogħla.

Eżattezza ogħla:Identifikazzjoni tal-ispeċi u tbassir tal-ġene funzjonali.

Assemblaġġ imtejjeb: Faċilitazzjoni ta 'iżolament tal-ġenoma tal-batterja u analiżi komparattiva ta' metagenome.

Analiżi komprensiva tal-bijoinformatika:L-analiżi tagħna hija ffokata mhux biss fuq id-diversità tassonomika iżda wkoll fuq id-diversità funzjonali tal-komunità.

Esperjenza estensiva: It-tim tagħna jġib ħafna esperjenza għal kull proġett, b'rekord ta 'għeluq b'suċċess ta' proġetti ta 'metagenomics multipli f'diversi oqsma ta' riċerka u jipproċessa aktar minn 200,000 kampjun, it-tim tagħna jġib numru kbir ta 'esperjenza għal kull proġett.

Speċifikazzjonijiet tas-Servizz

Pjattaforma tas-sekwenzar

Strateġija ta 'sekwenzar

Dejta rakkomandata

Illumina Novaseq

PE150

6 GB

Nanopore P48

10 kb

6/10 GB

Pacbio revio

8 kb

10/20 GB

Rekwiżiti tal-kampjun

 

Konċentrazzjoni (ng / µl)

Ammont totali (µg)

Volum (µL)

Librerija Illumina PE150

≥1

≥0.03

≥20

Nanopore 10 kb librerija

≥40

≥2

≥20

Pacbio 8 kb librerija

≥50

10 µg / ċellola ≥20

Fluss tax-xogħol tas-servizz

Kunsinna tal-kampjun

Kunsinna tal-kampjun

Preparazzjoni tal-librerija

Kostruzzjoni tal-librerija

Sekwenzar

Sekwenzar

Analiżi tad-Dejta

Analiżi tad-Dejta

Servizzi ta 'wara l-bejgħ

Servizzi ta 'wara l-bejgħ


  • Preċedenti:
  • Li jmiss:

  • 流程图 贝贝第三版 -02

    Tinkludi l-analiżi li ġejja:

    ● Sekwenzar tal-Kontroll tal-Kwalità tad-Dejta

    ● Assemblea tal-Metagenome u Tbassir tal-Ġene

    ● Annotazzjoni tal-ġeni

    ● Analiżi tad-Diversità Alfa Tassonomika

    ● Analiżi funzjonali tal-komunità: funzjoni bijoloġika, metabolika, reżistenza għall-antibijotiċi

    ● Analiżi kemm fuq diversità funzjonali kif ukoll tassonomika:

    Analiżi tad-Diversità Beta

    Analiżi bejn il-gruppi

    Analiżi tal-Korrelazzjoni: Bejn il-Fatturi Ambjentali u l-Kompożizzjoni u d-Diversità

    Distribuzzjoni ta 'Ġeni mhux Redundant:

    图片 68 

    Annotazzjoni tal-Ġeni: Pathway Kegg

    图片 69 

    Annotazzjoni tal-Ġene: Eggnog

     图片 70

     

    Annotazzjoni tal-Ġeni: Karboidrati Cazy

     图片 71

    Netwerk ta 'Korrelazzjoni ta' Speċi:

     图片 72

    Esplora l-avvanzi ffaċilitati mis-servizz ta 'sekwenzar ta' metagenomics ta 'BMKGene ma' Nanopore + Illumina b'din il-pubblikazzjoni dehru:

    Jin, H. et al. (2023) "Ġenoma ta 'kwalità għolja Kompendju tal-mikrobioma tal-musrana tal-bniedem ta' Mongoljani ta 'ġewwa", Mikrobijoloġija tan-Natura 2023 8: 1, 8 (1), pp. 150-161. doi: 10.1038 / s41564-022-01270-1.

    Ikseb kwotazzjoni

    Ikteb il-messaġġ tiegħek hawn u ibgħatilna

    Ibgħatilna l-messaġġ tiegħek: