Il-punti ewlenin
F'dan il-webinar ta' sagħtejn, huwa unur kbir tagħna li stieden sitt esperti fl-arena tal-ġenomika tal-uċuħ tar-raba'.Il-kelliema tagħna se jagħtu interpretazzjoni fil-fond dwar żewġ studji ġenomiċi tas-Segala, li ġew ippubblikati dan l-aħħar fuqĠenetika tan-Natura:
1. L-assemblaġġ tal-ġenoma fuq skala tal-kromożomi jipprovdi għarfien dwar il-bijoloġija tas-segala, l-evoluzzjoni u l-potenzjal agronomiku
2. Assemblaġġ tal-ġenoma ta 'kwalità għolja jenfasizza l-karatteristiċi ġenomiċi tas-segala u l-ġeni agronomikament importanti
Ukoll, aħna ferħanin li għandna Xjentist Anzjan ta 'R & D ta' Biomarker Technologies biex jaqsam l-esperjenza tiegħu fl-assemblaġġ tal-ġenoma de novo.
Aġenda
09:00am CET
Rimarki ta’ Merħba
Zheng Hong-kun
Fundatur u CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
President, Skola tax-Xjenzi Agrikoli Avvanzati Università ta 'Peking
09:15am
It-titjib tat-titjib tas-segala, it-triticale u l-qamħ permezz tal-użu ta' sekwenza tal-ġenoma ta' referenza ta' kwalità għolja
F'dan il-webinar, il-Prof. Wang tana aġġornamenti ġenerali dwar l-istatus attwali tar-riċerka ġenomika tat-triticeae u wera s-suċċess u l-avvanzi taż-żewġ xogħlijiet pendenti fuq studji tal-ġenoma tas-Segala, li ġew ippubblikati reċentement fuq Nature Genetics u jintroduċu r-riċerka kollha. gruppi li jmexxu u jikkontribwixxu fix-xogħlijiet.
09:25am
Ġenomika taċ-ċereali @ IPK Gatesleben
Il-ħaxix taċ-ċereali tat-tribù Triticeae kien sors ta 'ikel ewlieni f'reġjuni moderati, li ilu jitqies bħala hotspot fit-titjib u t-tnissil tal-uċuħ tar-raba'.Fost l-ispeċi kollha kkultivati, dan it-tribù huwa famuż għall-karatteristiċi ġenomiċi estremament kumplessi tagħhom inklużi daqsijiet kbar tal-ġenoma, kontenut għoli ta 'TEs, polyploidy, eċċ. F'din is-sessjoni, Prof Nils Stein tana introduzzjoni ġenerali dwar IPK Gatesleben u l-istatus attwali taċ-ċereali riċerka ġenomika@IPK Gatesleben.
09:35am
L-assemblaġġ tal-ġenoma fuq skala tal-kromożomi jipprovdi għarfien dwar il-bijoloġija tas-segala, l-evoluzzjoni u l-potenzjal agronomiku
Dr M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Is-Segala (Secale cereale L.) hija wiċċ taċ-ċereali eċċezzjonalment reżistenti għall-klima, użat b'mod estensiv biex jipproduċi varjetajiet imtejba ta' qamħ permezz ta' ibridizzazzjoni introgressiva, u li jippossjedi r-repertorju kollu ta' ġeni meħtieġ biex jippermetti t-tnissil ibridu.Is-segala hija allogama u reċentement domestikata biss, li tagħti lis-segala ikkultivata aċċess għal ġabra ta' ġeni selvaġġi divers u sfruttabbli.Biex intejbu aktar il-potenzjal agronomiku tas-segala, ipproduċejna assemblaġġ annotat fuq skala tal-kromożomi tal-ġenoma tas-segala ta '7.9 Mbp, u vvalidajna b'mod estensiv il-kwalità tagħha billi użaw sett ta' riżorsi ġenetiċi molekulari.Aħna nuru applikazzjonijiet ta 'din ir-riżorsa b'firxa wiesgħa ta' investigazzjonijiet.Aħna nippreżentaw sejbiet dwar iżolament ġenetiku mhux komplut tas-segala kkultivata minn qraba selvaġġi, mekkaniżmi ta 'evoluzzjoni strutturali tal-ġenoma, reżistenza għall-patoġeni, tolleranza ta' temperatura baxxa, sistemi ta 'kontroll tal-fertilità għat-tgħammir ibridu, u l-benefiċċji tar-rendiment ta' introgressjonijiet tas-segala-qamħ.
10:05am
Assemblaġġ tal-ġenoma ta 'kwalità għolja jenfasizza l-karatteristiċi ġenomiċi tas-segala u ġeni importanti agronomikament
Is-segala hija ikel u għelejjel tal-għalf siewi, riżorsa ġenetika importanti għat-titjib tal-qamħ u t-triticale, u materjal indispensabbli għal studji komparattivi effiċjenti tal-ġenomika fil-ħaxix.Hawnhekk, aħna sekwenzajna l-ġenoma tas-segala Weining, varjetà ta 'segala elite Ċiniża.Il-kontigs immuntati (7.74 Gb) ammontaw għal 98.47% tad-daqs tal-ġenoma stmat (7.86 Gb), b'93.67% tal-kontigs (7.25 Gb) assenjati għal seba 'kromożomi.Elementi ripetittivi kienu jikkostitwixxu 90.31% tal-ġenoma immuntat.Meta mqabbla ma 'ġenomi Triticeae sekwenzati qabel, Daniela, Sumaya u Sumana retrotransposons wrew espansjoni qawwija fis-segala.Analiżi ulterjuri tal-assemblaġġ ta 'Weining jitfgħu dawl ġdid fuq duplikazzjonijiet tal-ġeni madwar il-ġenoma u l-impatt tagħhom fuq il-ġeni tal-bijosintesi tal-lamtu, organizzazzjonijiet fiżiċi ta' loci prolamin kumplessi, karatteristiċi ta 'espressjoni tal-ġeni sottostanti karatteristika ta' intestatura bikrija, u reġjuni kromosomali assoċjati mad-domestikazzjoni putattivi u loci fis-segala.Din is-sekwenza tal-ġenoma twiegħed li tħaffef il-ġenomika u l-istudji tat-tnissil tas-segala u l-uċuħ taċ-ċereali relatati.
10:35am
Sfidi, soluzzjonijiet u futur għall-assemblaġġ de novo tal-ġenoma
Ġenoma ta 'kwalità għolja hija l-bażi ta' studju ġenomic.Għalkemm l-iżvilupp mgħaġġel fis-sekwenzjar u l-algoritmu ta s-setgħa assemblaġġ tal-ġenoma ħafna aktar sempliċi u effiċjenti, ir-rekwiżiti fl-eżattezza u l-kompletezza tal-assemblaġġ qed jiżdiedu wkoll bl-approfondiment tal-għanijiet tar-riċerka.F'din it-taħdita ser niddiskuti t-teknoloġiji popolari attwali fl-assemblaġġ tal-ġenoma b'diversi każijiet ta 'suċċess u nagħti ħarsa lejn l-iżvilupp futur.
Ħin tal-post: Jan-08-2022