Settijiet ta' għodda

BMKCloud hija pjattaforma bijoinformatika ewlenija li tipprovdi soluzzjoni one-stop għal programmi ġenomiċi, li hija fdata ħafna minn riċerkaturi f'arena varji inklużi mediċi, agrikoli, ambjentali, eċċ. BMKCloud hija impenjata li tipprovdi servizzi integrati, affidabbli u effiċjenti inklużi pjattaformi u għodod ta' analiżi bijoinformatika , riżorsi tal-kompjuters, database pubblika, korsijiet online bijoinformatiċi, eċċ. BMKCloud għandu diversi għodod bijoinformatiċi użati ta 'spiss li jinkludu annotazzjoni tal-ġeni, għodod ġenetiċi evoluzzjonarji, ncRNA, kontroll tal-kwalità tad-dejta, assemblaġġ, allinjament, estrazzjoni tad-dejta, mutazzjonijiet, statistika, ġeneratur tal-figura, sekwenza analiżi, eċċ.

Ikkuntatjana

Dettalji tas-Servizz

Kexxun tal-mappa tas-sħana

Il-kexxun tal-mappa tas-sħana jintuża għat-tpinġija tal-mappa tas-sħana, li jista 'jiffiltra, jinnormalizza u d-data tal-matriċi tal-cluster. Huwa użat l-aktar għall-analiżi tal-gruppi tal-livell tal-espressjoni tal-ġeni bejn kampjuni differenti.

Annotazzjoni tal-Ġene

It-twaħħil ta' funzjonijiet bijoloġiċi ma' sekwenzi fil-fajl FASTA billi tallinja s-sekwenzi mad-database, inklużi NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.

BLAST

BLAST (Għodda ta 'Tiftix ta' Allinjament Lokali Bażiku) huwa algoritmu u programm biex jinstabu reġjuni b'sekwenzi bijoloġiċi simili.Hija tqabbel dawn is-sekwenzi ma 'databases ta' sekwenzi u tikkalkula s-sinifikat statistiku.BLAST jikkonsisti f'erba 'tipi ta' għodod ibbażati fuq it-tip ta 'sekwenza: blastn, lastp, blastx u tblastn.