Sekwenzar tat-traskriptome kollu – Illumina
Karatteristiċi
● Librerija doppja biex tissekwenza t-transcriptome komplut: it-tnaqqis tal-rRNA segwit minn preparazzjoni tal-librerija PE150 u għażla tad-daqs segwit minn preparazzjoni tal-librerija SE50
● Tlesti l-analiżi tal-bijoinformatika ta 'mRNA, lncRNA, circRNA u miRNA f'rapporti separati tal-bijoinformatika
● Analiżi konġunta tal-espressjoni kollha tal-RNA f'rapport magħqud, inkluża analiżi tan-netwerks ceRNA.
Vantaġġi tas-Servizz
●Analiżi fil-fond tan-netwerks regolatorji: l-analiżi tan-netwerk ceRNA hija ppermettiet mis-sekwenzjar konġunt ta 'mRNA, lncRNA, circRNA u miRNA u minn fluss tax-xogħol bijoinformatiku eżawrjenti.
●Annotazzjoni Komprensiva: nużaw databases multipli biex jannotaw funzjonalment il-Ġeni Espressi b'mod Differenzjali (DEGs) u nwettqu l-analiżi ta 'arrikkiment korrispondenti, billi nipprovdu għarfien dwar il-proċessi ċellulari u molekulari li huma sottostanti r-rispons tat-traskriptome.
●Kompetenza estensiva: b'rekord ta 'suċċess ta' l-għeluq ta 'aktar minn 2000 proġett sħiħ ta' transcriptome f'diversi dominji ta 'riċerka, it-tim tagħna jġib rikkezza ta' esperjenza għal kull proġett.
●Kontroll Riguż tal-Kwalità: nimplimentaw punti ta' kontroll ewlenin fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjuni u tal-libreriji sas-sekwenzjar u l-bijoinformatika.Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura l-kunsinna ta' riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
● Annotazzjoni Komprensiva: nużaw databases multipli biex jannotaw funzjonalment il-Ġeni Espressi b'mod Differenzjali (DEGs) u nwettqu l-analiżi ta 'arrikkiment korrispondenti, billi nipprovdu għarfien dwar il-proċessi ċellulari u molekulari li huma sottostanti r-rispons tat-traskriptome.
●Appoġġ wara l-Bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' wara l-bejgħ ta '3 xhur.Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza għas-soluzzjoni tal-problemi, u sessjonijiet ta’ Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati
Rekwiżiti tal-Kampjun u Kunsinna
| Librerija | Strateġija ta' sekwenzar | Data rakkomandata | Kontroll tal-Kwalità |
| rRNA eżawrit | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Daqs magħżul | Illumina SE50 | 10-20M jaqra |
Rekwiżiti tal-Kampjun:
Nukleotidi:
| Konċ.(ng/μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq il-ġel. | Pjanti: RIN≥6.5 Annimali: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazzjoni tal-linja bażi limitata jew l-ebda |
Kunsinna tal-Kampjun Rakkomandata
Kontenitur:
Tubu taċ-ċentrifuga ta' 2 ml (Fojl tal-landa mhux rakkomandat)
Tikkettjar tal-kampjun: Grupp+replika eż. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Konsenja:
1.Dry-silġ: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna fis-silġ niexef.
2. Tubi RNAstable: kampjuni RNA jistgħu jitnixxfu f'tubu ta 'stabbilizzazzjoni RNA (eż. RNAstable®) u jintbagħtu f'temperatura tal-kamra.
Fluss tax-Xogħol tas-Servizz
Disinn tal-esperimenti
Kunsinna tal-kampjun
Estrazzjoni tal-RNA
Kostruzzjoni ta' librerija
Sekwenzar
Analiżi tad-dejta
Servizzi ta' wara l-bejgħ
Bijoinformatika
Ħarsa ġenerali tal-espressjoni tal-RNA
Ġeni Espressi b'mod differenti
analiżi ceRNA
MiRNAs espressi b'mod differenti u RNAs relatati
Esplora l-avvanzi tar-riċerka ffaċilitati mis-servizzi sħaħ ta' sekwenzar tat-traskriptome ta' BMKGene permezz ta' kollezzjoni kkurata ta' pubblikazzjonijiet.
Dai, Y. et al.(2022) 'Profili ta' espressjoni komprensivi ta' mRNAs, lncRNAs u miRNAs fil-marda Kashin-Beck identifikati permezz ta' sekwenzar tal-RNA', Molecular Omics, 18 (2), pp. 154–166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
Liu, N. nan et al.(2022) 'Analiżi tat-traskriptomi ta' tul sħiħ tar-reżistenza għall-kesħa ta' Apis cerana fil-Muntanji Changbai matul il-perjodu tax-xitwa.', Gene, 830, pp. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
Wang, XJ et al.(2022) 'Prijoritizzazzjoni bbażata fuq l-Integrazzjoni Multi-Omics ta' Netwerks ta' Regolamentazzjoni ta' RNA Endoġenu Kompetituri f'Kanċer tal-Pulmun ta' Ċelloli Żgħar: Karatteristiċi Molekulari u Kandidati tad-Droga', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) 'Analiżi integrata tal-profili tal-espressjoni lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA tiżvela għarfien ġdid dwar mekkaniżmi potenzjali b'reazzjoni għal nematodi tal-għoqda tal-għeruq fil-karawett', BMC Genomics, 23 (1), pp. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURI/7.
Yan, Z. et al.(2022) "Is-sekwenzjar ta 'l-RNA tat-transcriptome sħiħ jenfasizza l-mekkaniżmi molekulari assoċjati mal-manutenzjoni tal-kwalità ta' wara l-ħsad fil-brokkoli permezz ta 'irradjazzjoni LED aħmar", Postharvest Biology and Technology, 188, p.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
