BMKCloud Log in
条形banner-၀၃

ထုတ်ကုန်များ

High Throughput Sequencing (ATAC-seq) ဖြင့် Transposase-Accessible Chromatin အတွက် စစ်ဆေးမှု

ATAC-seq သည် ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သော ခရိုမာတင် ဝင်ရောက်နိုင်မှုကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန် မြင့်မားသော ဆင့်ကဲဆင့်ပွားနည်းလမ်းတစ်ခုဖြစ်ပြီး၊ ၎င်းသည် ကမ္ဘာလုံးဆိုင်ရာ မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှု ထိန်းချုပ်မှုအတွက် အရေးကြီးသော ဂျီနိုမ်ကျယ်ပြန့်သော ခရိုမာတင်သုံးစွဲနိုင်မှုကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန်ဖြစ်သည်။ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်နေသော အဒက်တာများကို hyperactive Tn5 transposase ဖြင့် ဖွင့်ထားသော chromatin ဧရိယာများတွင် ထည့်သွင်းထားသည်။PCR ချဲ့ထွင်ပြီးနောက်၊ အတွဲလိုက် စာကြည့်တိုက်တစ်ခုကို တည်ဆောက်သည်။ဖွင့်ထားသော chromatin ဒေသများအားလုံးကို သီးခြားနေရာ-အချိန်အခြေအနေတစ်ခုအောက်တွင် ရရှိနိုင်သည်၊ စာသားမှတ်တမ်းတစ်ခု၏ binding sites များ သို့မဟုတ် အချို့ histone ပြုပြင်ထားသော ဒေသကို ကန့်သတ်ထားရုံသာမက၊


ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

ဇီဝအချက်အလက်

သရုပ်ပြရလဒ်များ

ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ

● ပြည့်စုံသော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း- စိတ်ကြိုက်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု လိုအပ်ချက်အမျိုးမျိုးကို ပြည့်မီရန် ပရော်ဖက်ရှင်နယ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပိုက်လိုင်း၊

● ကျယ်ပြန့်သောအတွေ့အကြုံ- တိရစ္ဆာန်နှင့် အပင်နမူနာများအပါအဝင် ပရောဂျက် ရာပေါင်းများစွာကို ယခုအချိန်အထိ အောင်မြင်စွာ ပြီးမြောက်ခဲ့ပါသည်။

ဝန်ဆောင်မှုသတ်မှတ်ချက်များ

ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း

စာကြည့်တိုက်အမျိုးအစား- ATAC-seq

အကြံပြုထားသည့် ဒေတာအထွက်- ≥20M ဖတ်သည်။

နမူနာလိုအပ်ချက်များ

နမူနာအမျိုးအစား- တစ်ရှူးများ၊ သက်ရှိဆဲလ်များ သို့မဟုတ် အေးခဲထားသောဆဲလ်များ စသည်တို့ဖြစ်သည်။

ဆဲလ်နံပါတ်- ≥ 5×105ဆဲလ်များ၊ တိကျသောဆဲလ်နံပါတ်သည် စမ်းသပ်မှုအောင်မြင်ရန် သော့ချက်ဖြစ်သည်။

တစ်ရှူးအလေးချိန်: ≥ 200mg လတ်ဆတ်သောတစ်ရှူး;

သွေး: ≥ 2 mL

Service Work Flow

နမူနာ QC

စမ်းသပ်ထားတာ

နမူနာပေးပို့ခြင်း။

နမူနာပေးပို့ခြင်း။

စမ်းသပ်မှု

DNA ထုတ်ယူခြင်း။

စာကြည့်တိုက်ပြင်ဆင်ခြင်း။

စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ရေး

Sequencing

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ

ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ


  • ယခင်-
  • နောက်တစ်ခု:

  • 表观-၀၂

    1.ATAC ရှိ အပူမြေပုံသည် TSS နှင့် ကပ်လျက် ဒေသများတွင် ဖြန့်ဖြူးမှုကို ဖတ်သည် (±3 kb)

    ၃ (၁)2. မတူညီသော genome အစိတ်အပိုင်းများတွင် open chromatin ဒေသကို ဖြန့်ဝေခြင်း။

    ၄ (၁)

    3. အုပ်စုများအကြား ကွဲပြားသော အထွတ်အထိပ်ခေါ်ဆိုမှု

    ၅ (၁)

    ကိုးကားရယူပါ။

    သင့်စာကို ဤနေရာတွင် ရေးပြီး ကျွန်ုပ်တို့ထံ ပေးပို့ပါ။

    သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-