ဘက်တီးရီးယားနှင့် ဖန်းဂတ်စ် တကိုယ်လုံး ဂျီနိုမ် ပြန်လည် စီစစ်ခြင်း။
ဘက်တီးရီးယားနှင့် မှိုများ ဂျီနိုမ် တစ်ခုလုံးကို ပြန်လည် စီစစ်ခြင်း ပရောဂျက်များသည် အဏုဇီဝ ဂျီနိုမ်များ ပြီးစီးမှုနှင့် နှိုင်းယှဉ်မှုကို ဖွင့်ပေးခြင်းဖြင့် အဏုဇီဝ မျိုးဗီဇများ တိုးတက်လာစေရန်အတွက် အဓိက အချက်ဖြစ်သည်။ ၎င်းသည် ကစော်ဖောက်ခြင်း အင်ဂျင်နီယာ၊ စက်မှုလုပ်ငန်း စဉ်များကို ပိုမိုကောင်းမွန်အောင် ပြုလုပ်ခြင်းနှင့် ဒုတိယ ဇီဝြဖစ်ပျက်မှု လမ်းကြောင်းများကို ရှာဖွေရေးတို့ကို ပံ့ပိုးပေးသည်။ ထို့အပြင်၊ မှိုနှင့် ဘက်တီးရီးယားများကို ပြန်လည်ပေါင်းစပ်ခြင်းသည် သဘာဝပတ်ဝန်းကျင်ကို လိုက်လျောညီထွေဖြစ်အောင် နားလည်ရန်၊ မျိုးကွဲများကို ပိုမိုကောင်းမွန်အောင်ပြုလုပ်ရန်နှင့် ဆေးပညာ၊ စိုက်ပျိုးရေးနှင့် သဘာဝပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာ သိပ္ပံပညာတို့တွင် ကျယ်ပြန့်သောသက်ရောက်မှုများနှင့်အတူ မျိုးရိုးဗီဇဆင့်ကဲဖြစ်စဉ်များကို ဖော်ထုတ်ရန် အရေးကြီးပါသည်။
ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ
●Bioinformatic Analysis တွင် မူကွဲခေါ်ဆိုခြင်း ပါဝင်သည်-ပြန်လည်စီတန်းထားသော ဂျီနိုမ်များအကြောင်း လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများကို ပံ့ပိုးပေးခြင်း။
● ကျယ်ပြန့်သော ကျွမ်းကျင်မှု: နှစ်စဉ်ပြုလုပ်သော ထောင်နှင့်ချီသော microbial re-sequency ပရောဂျက်များဖြင့်၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် ဆယ်စုနှစ်တစ်ခုကျော် အတွေ့အကြုံ၊ ကျွမ်းကျင်သော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအဖွဲ့၊ ပြည့်စုံသော အကြောင်းအရာနှင့် အလွန်ကောင်းမွန်သော ရောင်းပြီးနောက်ပိုင်း ပံ့ပိုးမှုတို့ကို ကျွန်ုပ်တို့ ယူဆောင်လာပါသည်။
●အရောင်းအပြီး ပံ့ပိုးမှု-ကျွန်ုပ်တို့၏ကတိကဝတ်သည် 3-လရောင်းပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုကာလနှင့်အတူ ပရောဂျက်ပြီးစီးမှုထက် ကျော်လွန်ပါသည်။ ဤအချိန်အတောအတွင်း၊ ကျွန်ုပ်တို့သည် ရလဒ်များနှင့်သက်ဆိုင်သည့် မည်သည့်မေးခွန်းများကိုမဆို ဖြေရှင်းရန်အတွက် ပရောဂျက်နောက်ဆက်တွဲ၊ ပြဿနာဖြေရှင်းခြင်းအကူအညီနှင့် အမေးအဖြေကဏ္ဍများကို ပေးဆောင်ပါသည်။
ဝန်ဆောင်မှုသတ်မှတ်ချက်များ
| Sequencing platform | Sequencing ဗျူဟာ | ဒေတာအကြံပြုထားသည်။ | အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု |
| Illumina NovaSeq | PE150 | အတိမ်အနက် 100x | Q30≥85% |
နမူနာလိုအပ်ချက်များ
| အာရုံစူးစိုက်မှု (ng/µL) | စုစုပေါင်းပမာဏ (ng) | ပမာဏ (µL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
ဘက်တီးရီးယား- ≥1x107 ဆဲလ်များ
Unicellular မှို- ≥5x106-1x107 ဆဲလ်များ
Macro မှို: ≥4g
Service Work Flow
နမူနာပေးပို့ခြင်း။
စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ရေး
Sequencing
ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ
ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ
အောက်ပါ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပါဝင်သည်-
- ဒေတာအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု စီစစ်ခြင်း။
- အကိုးအကား Genome သို့ ချိန်ညှိခြင်း။
- ခေါ်ဆိုမှုပုံစံ- SNP နှင့် InDel
- မူကွဲ မှတ်ချက်
ခေါ်ဆိုမှုပုံစံ- SNP အမျိုးအစားများ
မူကွဲခေါ်ဆိုခြင်း- InDel အရှည် ဖြန့်ဖြူးမှု
BMKGene ၏ အဏုဇီဝမျိုးရိုးဗီဇကို ပြန်လည်စီတန်းခြင်းဝန်ဆောင်မှုများမှ ပံ့ပိုးပေးထားသည့် တိုးတက်မှုများကို စူးစမ်းလေ့လာပါ။
Jia, Y. et al. (2023) 'Wheat Dwarf Bunt အတွက် ရောဂါခံနိုင်ရည်ရှိသော မျိုးဗီဇများကို စမ်းသပ်ရန် Transcriptome နှင့် Whole Genome ပေါင်းစပ်ခြင်း'၊နိုင်ငံတကာမော်လီကျူးသိပ္ပံဂျာနယ်၊ ၂၄(၂၄)။ doi- 10.3390/IJMS242417356။
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-controlled glucose ဇီဝြဖစ်ပျက်မှုကို ခံနိုင်ရည်မှ ဘက်တီးရီးယား၌ ခံနိုင်ရည်သို့ ကူးပြောင်းခြင်း'၊သိပ္ပံပညာ တိုးတက်လာသည်၉(၁၀)။ doi- 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF
Yang, M. et al. (၂၀၂၂) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. နို၀င်ဘာလ၊ တရုတ်နိုင်ငံ၊ Inner Mongolia ကိုယ်ပိုင်အုပ်ချုပ်ခွင့်ရဒေသရှိ ဆိုဒါအိုင်မှ ခွဲထုတ်ထားသော haloalkaliphilic ဘက်တီးရီးယား J. Syst ဆင့်ကဲ။Microbiol, 72, p ။ 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263။
Zhu၊ Z.၊ Wu၊ R. နှင့် Wang၊ G.-H။ (2024) 'Nasonia vitripennis မှခွဲထုတ်ထားသော Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a ၏ Genome sequence'၊အဏုဇီဝဗေဒ အရင်းအမြစ် ကြေညာချက်များ. doi: 10.1128/MRA.00802-23။
