DNA / RNA အစီအစဉ်များ - nanopore sequencer
ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်အင်္ဂါရပ်များ
| ဇါတ်စင် | စာကြည့်တိုက်အရွယ်အစား | သီအိုရီဆိုင်ရာအချက်အလက်အထွက်နှုန်း (ဆဲလ်နှုန်း) | တစ်ခုတည်း - အခြေစိုက်စခန်းတိကျမှန်ကန်မှု | လျှောက်လွှာများ |
| ကိန်းနာ | 8KB, 10KB, 20kB, 20kB, UltraNARY, CDNA-PCR | 70-90GB / ဆဲလ် | 85-92% | SV ခေါ်ဆိုမှု, de novo, အပြည့်အ 0 အစီအစဉ်များ, အပြည့်အ 0 အစီအစဉ်များ, |
ဝန်ဆောင်မှုအားသာချက်များ
● Pacboio Sequencing ပလက်ဖောင်းတွင် 5 နှစ်ကျော်အတွေ့အကြုံရှိသည်။
● BMKGENENE သည် Oxford Nanopore ၏တရားဝင်လုပ်ဖော်ကိုင်ဖက်တစ် ဦး ဖြစ်ပြီး,
●ပြီးပြည့်စုံသောပစ္စည်းကိရိယာများနှင့်လုံလောက်သောအစီအစဉ်များနှင့်အတူ sequency မော်ဒယ်များရှိသည်။
# tanopore platform ကို အခြေခံ. တိရိစ္ဆာန်နှင့်အပင် 10 ခုထက်ပိုသောသုတေသနပြုချက်များသည်နိုင်ငံတကာတွင်ကျော်ကြားသောဂျာနယ်များတွင်ထုတ်ဝေခဲ့သည်။
နမူနာလိုအပ်ချက်များ
| နမူနာအမျိုးအစား | စုပေါင်း | အာရုံစူးစိုက်မှု (QuBit ®) | အရွယ်အစား | သန့်ရှင်းြရဲ | အခြားသူများ |
| Genomic DNA | ဒေတာလိုအပ်ချက်ပေါ်မူတည်သည် | ≥207 / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.2; OD260 / 230≥1.5; 260 NM တွင် Clear Peak, အဘယ်သူမျှမညစ်ညမ်းမှု | အာရုံစူးစိုက်မှုကို quiit နှင့် quiit / nanopore မှတိုင်းတာရန်လိုအပ်သည် |
| စုစုပေါင်း RNA | ≥1.2μg | ≥100μg / μl | ≥15μl | OD260 / 280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; အဘယ်သူမျှမညစ်ညမ်းမှု | rin တန်ဖိုး≥7.5 |
ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းခွင်
နမူနာပြင်ဆင်မှု
စာကြည့်တိုက်ဆောက်လုပ်ရေး
အစီအစဉ်
ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ
စီမံကိန်းပေးပို့ခြင်း
DNA နမူနာ၏ဒေတာအရည်အသွေးအကဲဖြတ်
ဇယား 1 ။ သန့်ရှင်းရေးဒေတာအပေါ်စာရင်းဇယား။
| BMKid | Rawseqnum | Rawsumbase | သန့်ရှင်းရေး | သန့်ရှင်းရေး | သန့်ရှင်းရေး | သန့်ရှင်းရေး 90len | စင်ကြယ်သော | စင်ကြယ်သော | သန့်ရှင်းသော |
| dna_bmk01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
RNA နမူနာ၏ဒေတာအရည်အသွေးအကဲဖြတ်
ဇယား 1 ။ သန့်ရှင်းရေးဒေတာအပေါ်စာရင်းဇယား။
| ဖိုင်နာမည် | လူနာ၏ | ကေြးစာနား | Basenum | n50 | မင် | မက်ဆာမအလွန့် | ဆိုလိုတာက |
| rinna_bmk001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,20,083 | 398 | 452 | 129,227 | Q12 |
ပုံ 1 ။ အရှည်ဖြန့်ဝေဖတ်ပါ
ပုံ 2 ။ စင်ကြယ်သောဒေတာ၏အရည်အသွေးအရည်အသွေးရမှတ်ဖြန့်ဖြူး
ပုံ 3 ။ သန့်ရှင်းသောဒေတာ၏အရှည်နှင့်အရည်အသွေးရမှတ်ဖြန့်ဖြူး
