BMKCloud Log in
条形banner-၀၃

ထုတ်ကုန်များ

DNA/RNA စည်းမျဥ်း - နာနိုပရီဆက်ခံခြင်း

ONT sequencing သည် nanopores များကို အခြေခံ၍ အချိန်နှင့်တပြေးညီ လျှပ်စစ်အချက်ပြမှုဆိုင်ရာ မော်လီကျူးတစ်ခုတည်းကို ပေါင်းစပ်ခြင်းနည်းပညာဖြစ်ပြီး၊ ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုစီ၏ စီစစ်ခြင်းနိယာမသည် အတူတူပင်ဖြစ်သည်။နှစ်ထပ်သောင်တင်ထားသော DNA/RNA သည် biofilm တွင်ထည့်သွင်းထားသော nanoporous ပရိုတင်းများနှင့် ချိတ်ဆက်မည်ဖြစ်ပြီး၊ မော်တာပရိုတင်း၏ဦးဆောင်မှုအောက်တွင် ဖြည်လိုက်မည်ဖြစ်ပြီး၊ biofilm ၏နှစ်ဖက်စလုံးမှဗို့အားကွာခြားချက်ဖြင့်၊ DNA/RNA ကြိုးများသည် အချို့သောအချိန်တွင် nanopore channel ပရိုတင်းမှတဆင့်ဖြတ်သန်းသွားမည်ဖြစ်သည်။ နှုန်း။DNA/RNA strand ပေါ်ရှိ မတူညီသော အခြေခံများ၏ ဓာတုဂုဏ်သတ္တိများ ကွဲပြားမှုကြောင့်၊ တစ်ခုတည်းသော အခြေခံ သို့မဟုတ် DNA မော်လီကျူးသည် နာနိုပရီချန်နယ်ကို ဖြတ်သွားသောအခါ၊ ၎င်းသည် မတူညီသော လျှပ်စစ်အချက်ပြမှုများ အပြောင်းအလဲကို ဖြစ်စေသည်။ဤအချက်ပြမှုများကို ထောက်လှမ်းပြီး ဆက်စပ်ခြင်းဖြင့် သက်ဆိုင်သော အခြေခံအမျိုးအစားများကို တွက်ချက်နိုင်ပြီး sequence ၏ အချိန်နှင့်တစ်ပြေးညီ သိရှိမှုကို ပြီးမြောက်နိုင်ပါသည်။


ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

သရုပ်ပြရလဒ်

ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်အင်္ဂါရပ်များ

ပလပ်ဖောင်း

စာကြည့်တိုက်အရွယ်အစား

သီအိုရီဒေတာ အထွက်နှုန်း (ဆဲလ်တစ်ခုစီ)

Single-base တိကျမှု

လျှောက်လွှာများ

နာနိုပီးယား

8Kb၊ 10kb၊ 20kb၊ Ultralong၊ cDNA-PCR

70-90Gb/Cell

၈၅-၉၂%

SV ခေါ်ဆိုမှု၊ De novo၊ အရှည်လျား စီစစ်ခြင်း၊ Iso-Seq၊ ဗီဇဖော်ပြချက်၊ DNA မက်သွိုင်းရှင်းကို စစ်ဆေးခြင်း

ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ

● မျိုးစိတ်အမျိုးမျိုးဖြင့် ပိတ်ထားသော ပရောဂျက်ပေါင်း ထောင်ပေါင်းများစွာရှိသော PacBio စီစစ်ခြင်းပလပ်ဖောင်းတွင် 5 နှစ်ကျော်အတွေ့အကြုံ။
● BMKGENE သည် Dual Platform RNA/DNA အသိအမှတ်ပြုလက်မှတ်ဖြင့် Oxford Nanopore ၏တရားဝင်ပါတနာဖြစ်သည်။
● ကိရိယာအပြည့်အစုံနှင့် လုံလောက်သော စီစစ်ခြင်းဖြတ်သန်းမှုပါရှိသော ပင်မရေစီးကြောင်း မော်ဒယ်များ ရှိပါသည်။
● Nanopore ပလပ်ဖောင်းကို အခြေခံ၍ တိရစ္ဆာန်နှင့် အပင် Denovo သုတေသနပြုချက် 10 ကျော်ကို နိုင်ငံတကာ ကျော်ကြားသော ဂျာနယ်များတွင် ထုတ်ဝေခဲ့သည်။

နမူနာလိုအပ်ချက်များ


နမူနာအမျိုးအစား

ပမာဏ

အာရုံစူးစိုက်မှု(Qubit ®)

အတွဲ

သန့်ရှင်းစင်ကြယ်ခြင်း။

တခြားသူတွေ

မျိုးရိုးဗီဇ DNA

ဒေတာလိုအပ်ချက်အပေါ် မူတည်

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

260 nm တွင် ရှင်းလင်းသော အမြင့်ဆုံး၊ ညစ်ညမ်းမှု မရှိပါ။

အာရုံစူးစိုက်မှုကို Qubit နှင့် Qubit/Nanopore ≤ 2 ဖြင့် တိုင်းတာရန် လိုအပ်သည်။

စုစုပေါင်း RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; ညစ်ညမ်းမှုမရှိပါ။

RIN တန်ဖိုး ≥7.5

 

ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းအသွားအလာ

နမူနာပြင်ဆင်မှု

နမူနာပြင်ဆင်မှု

စာကြည့်တိုက်ပြင်ဆင်ခြင်း။

စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ရေး

Sequencing

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

နမူနာ QC

စီမံကိန်းပေးပို့ခြင်း။


  • ယခင်-
  • နောက်တစ်ခု:

  • DNA နမူနာ၏ ဒေတာအရည်အသွေး အကဲဖြတ်ခြင်း။

    ဇယား 1. သန့်ရှင်းသောဒေတာဆိုင်ရာ စာရင်းအင်းများ။

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    သန့်ရှင်းသောN50Len

    သန့်ရှင်းသောN90Len

    cleanMeanLen

    သန့်စင်သော MaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    ၁၊၂၁၈၊၂၃၉

    ၂၆၊၃၇

    ၁၊၁၂၁၊၇၃၆

    25.90

    ၂၈၊၀၁၄

    ၁၅.၇၆၄

    ၂၃,၀၉၀

    ၁၄၃။၁၈၁

    9

    RNA နမူနာ၏ ဒေတာအရည်အသွေး အကဲဖြတ်ခြင်း။

    ဇယား 1. သန့်ရှင်းသောဒေတာဆိုင်ရာ စာရင်းအင်းများ။

    ဖိုင်နာမည်

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    အရှည်

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    ၈.၉၄၇.၇၀၈

    ၄၊၀၄၇၊၂၃၀၊၀၈၃

    ၃၉၈

    ၄၅၂

    ၁၂၉၊၂၂၇

    Q12

    ပုံ 1. အရှည်ဖြန့်ချီမှုကို ဖတ်ပါ။

    A3

    ပုံ 2။ သန့်ရှင်းသောဒေတာ၏ အရည်အသွေးရမှတ်များ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။

    A4

    ပုံ 3။ သန့်ရှင်းသောဒေတာ၏ အရှည်နှင့် အရည်အသွေးရမှတ်များ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။

    A5

    ကိုးကားရယူပါ။

    သင့်စာကို ဤနေရာတွင် ရေးပြီး ကျွန်ုပ်တို့ထံ ပေးပို့ပါ။

    သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-