-
Metagenomic Sequencing (NGS)
မက်တာဂျီနိုမီ ဆိုသည်မှာ ပတ်ဝန်းကျင် ဇီဝမျိုးဇုံ၊ လူသားမျိုးရိုးဗီဇ စသည်တို့ကဲ့သို့ ရောနှောထားသော သက်ရှိများ၏ မျိုးရိုးဗီဇ အစုအဝေးကို ရည်ညွှန်းသည်။ ၎င်းတွင် စိုက်ပျိုးနိုင်သော နှင့် မမွေးမြူနိုင်သော အဏုဇီဝမျိုးရိုးများ နှစ်မျိုးလုံးပါရှိသည်။Metagenomic sequencing သည် မျိုးစိတ်ကွဲပြားမှုနှင့် ပေါများကြွယ်ဝမှု၊ လူဦးရေဖွဲ့စည်းပုံ၊ ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဆက်ဆံရေး၊ လုပ်ဆောင်နိုင်သော မျိုးဗီဇများနှင့် ပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာအချက်များနှင့် ဆက်စပ်မှုကွန်ရက်တို့ရှိ အသေးစိတ်အချက်အလက်များကို ပံ့ပိုးပေးသည့် ရောစပ်မျိုးဗီဇပစ္စည်းများကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန် အသုံးပြုသည့် မော်လီကျူးကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သည်။
ပလပ်ဖောင်း-Illumina NovaSeq6000
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Metagenomics သည် မျိုးစိတ်ကွဲပြားမှုနှင့် ပေါများကြွယ်ဝမှု၊ လူဦးရေဖွဲ့စည်းပုံ၊ ဇီဝမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ ဆက်ဆံရေး၊ လုပ်ဆောင်နိုင်သော မျိုးဗီဇများနှင့် ပတ်ဝန်းကျင်ဆိုင်ရာအချက်များနှင့် ဆက်နွယ်မှုကွန်ရက်စသည်တို့အတွက် အသေးစိတ်အချက်အလက်များကို ပံ့ပိုးပေးသည့် ပတ်ဝန်းကျင်နမူနာများမှ ထုတ်ယူထားသော ရောစပ်မျိုးဗီဇပစ္စည်းများကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာရန် အသုံးပြုသည့် မော်လီကျူးကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သည်။ Nanopore sequencing ပလပ်ဖောင်းများကို မကြာသေးမီက မိတ်ဆက်ပေးခဲ့သည်။ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာလေ့လာမှုများ။ဖတ်ရှုမှုအလျားတွင် ၎င်း၏ထူးခြားသောစွမ်းဆောင်ရည်သည် စီးဆင်းမှုအောက်ရှိ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု အထူးသဖြင့် ဇီဝမျိုးကွဲပေါင်းစပ်မှုအား ပိုမိုကောင်းမွန်စေသည်။Read-length ၏ အားသာချက်များကို အသုံးပြု၍၊ Nanopore-based metagenomic လေ့လာမှုသည် shot-gun metagenomics နှင့် နှိုင်းယှဉ်လျှင် ပိုမို စဉ်ဆက်မပြတ် စုဝေးမှုကို ရရှိနိုင်သည်။Nanopore-based metagenomics သည် microbiomes များမှ ပြီးပြည့်စုံသော နှင့် ပိတ်ထားသော ဘက်တီးရီးယား ဂျီနိုမ်များ (Moss, EL, et. al.သဘာဝဇီဝနည်းပညာ2020)
ပလပ်ဖောင်း-Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
16S နှင့် 18S rRNA ပေါ်ရှိ subunit သည် အလွန်ထိန်းသိမ်းထားသော နှင့် hyper-variable regions နှစ်ခုလုံးပါရှိသော subunit သည် prokaryotic နှင့် eukaryotic organisms ခွဲခြားသတ်မှတ်ခြင်းအတွက် ပြီးပြည့်စုံသော မော်လီကျူးလက်ဗွေတစ်ခုဖြစ်သည်။စီစစ်ခြင်း၏ အကျိုးကျေးဇူးကို အသုံးပြု၍ ထိန်းသိမ်းထားသော အစိတ်အပိုင်းများပေါ်တွင် အခြေခံ၍ ဤ amplicons များကို ပစ်မှတ်ထားနိုင်ပြီး အဏုဇီဝကွဲပြားမှုဆိုင်ရာ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ ခွဲခြားသတ်မှတ်မှု၊ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ လေ့လာမှုများတွင် ပါဝင်သော လေ့လာမှုများအတွက် ပံ့ပိုးပေးသည့် အဏုဇီဝမျိုးကွဲများဆိုင်ရာ ခွဲခြားသတ်မှတ်မှုအတွက် အပြည့်အဝ လက္ခဏာရပ်ပြနိုင်သည်။ တစ်ခုတည်း-မော်လီကျူး ) PacBio ပလပ်ဖောင်းကို စီစစ်ခြင်းဖြင့် အရှည် amplicons (1.5 Kb ခန့်) လွှမ်းခြုံနိုင်သော အလွန်တိကျသော ရှည်လျားသော ဖတ်ရှုနိုင်မှုကို ရရှိစေပါသည်။မျိုးရိုးဗီဇနယ်ပယ်၏ ကျယ်ပြန့်သောအမြင်သည် ဘက်တီးရီးယား သို့မဟုတ် မှိုအသိုင်းအဝိုင်းရှိ မျိုးစိတ်ဖော်ပြချက်တွင် ပြတ်သားမှုကို ပိုမိုကောင်းမွန်စေသည်။
ပလပ်ဖောင်း-PacBio နောက်ဆက်တွဲ II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
16S/18S/ITS amplicon sequencing သည် အလွန်စကားပြောဆိုနိုင်သော အစိတ်အပိုင်းများနှင့် ကွဲပြားနိုင်သော ကွဲပြားနိုင်သော အစိတ်အပိုင်းများ နှစ်ခုလုံးပါရှိသော အိမ်တွင်းရေးမျိုးဗီဇဆိုင်ရာ PCR ထုတ်ကုန်များကို စုံစမ်းစစ်ဆေးခြင်းဖြင့် အဏုဇီဝအသိုက်အဝန်းအတွင်း ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ၊ အမျိုးအစားအလိုက် နှင့် မျိုးစိတ်များ ပေါကြွယ်ဝမှုကို ထုတ်ဖော်ပြသရန် ရည်ရွယ်သည်။Woeses et al,(1977) မှ ပြီးပြည့်စုံသော မော်လီကျူးလက်ဗွေကို မိတ်ဆက်ခြင်းသည် အထီးကျန်-ကင်းစင်သော မိုက်ခရိုဇီဝပရိုဖိုင်ကို အားကောင်းစေသည်။16S (ဘက်တီးရီးယား)၊ 18S (မှို) နှင့် Internal transcribed spacer (ITS၊ မှို) တို့ကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် ပေါများသောမျိုးစိတ်များနှင့် ရှားပါးပြီး အမည်မသိမျိုးစိတ်နှစ်မျိုးလုံးကို ဖော်ထုတ်နိုင်မည်ဖြစ်သည်။ဤနည်းပညာသည် လူ့ပါးစပ်၊ အူလမ်းကြောင်း၊ မစင်စသည့် ပတ်ဝန်းကျင်အမျိုးမျိုးတွင် ကွဲပြားသော အဏုဇီဝဖွဲ့စည်းမှုကို ဖော်ထုတ်ရာတွင် တွင်ကျယ်စွာ အသုံးချပြီး အဓိကကိရိယာတစ်ခု ဖြစ်လာခဲ့သည်။
ပလပ်ဖောင်း-Illumina NovaSeq6000
-
ဘက်တီးရီးယားနှင့် ဖန်းဂတ်စ် တကိုယ်လုံး ဂျီနိုမ် ပြန်လည် စီစစ်ခြင်း။
ဘက်တီးရီးယားနှင့် မှိုများအားလုံးကို ဂျီနိုမ်ပြန်လည် စီစစ်ခြင်းသည် လူသိများသော ဘက်တီးရီးယားနှင့် မှိုများ၏ ဂျီနိုမ်များကို ပြီးမြောက်စေသည့်အပြင် များစွာသော ဂျီနိုမ်များကို နှိုင်းယှဉ်ရန် သို့မဟုတ် သက်ရှိအသစ်များ၏ ဂျီနိုမ်များကို မြေပုံထုတ်ရန် အရေးကြီးသောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သည်။တိကျသောရည်ညွှန်းဂျီနိုမ်များထုတ်လုပ်ရန်၊ အဏုဇီဝခွဲခြားသတ်မှတ်ခြင်းနှင့် အခြားနှိုင်းယှဉ်ထားသောဂျီနိုမ်လေ့လာမှုများပြုလုပ်ရန်အတွက် ဘက်တီးရီးယားနှင့်မှိုများ၏ ဂျီနိုအာတစ်ခုလုံးကို စီတန်းရန် အရေးကြီးပါသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq 6000
-
Fungal Genome
Biomarker Technologies သည် တိကျသော သုတေသနပန်းတိုင်ပေါ်မူတည်၍ ဂျီနိုမ်စစ်တမ်း၊ ကောင်းမွန်သော ဂျီနိုမ်နှင့် pene-ပြီးပြည့်စုံသော မှိုဂျီနိုမ်များကို ပေးဆောင်ပါသည်။အဆင့်မြင့် ဂျီနိုမ်စည်းဝေးပွဲကို ရရှိရန်အတွက် ဂျီနိုမ်စည်းလုံးခြင်း၊ စုဝေးမှုနှင့် လုပ်ဆောင်မှုဆိုင်ရာ မှတ်ချက်များကို မျိုးဆက်သစ်ဆက်စီကိန်း + တတိယမျိုးဆက် စီစစ်ခြင်းတို့ကို ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် အောင်မြင်နိုင်သည်။ခရိုမိုဆုန်းအဆင့်တွင် ဂျီနိုမ်စုဝေးမှုကို လွယ်ကူချောမွေ့စေရန် Hi-C နည်းပညာကိုလည်း အသုံးပြုနိုင်သည်။
ပလပ်ဖောင်း-PacBio နောက်ဆက်တွဲ II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bacteria Complete Genome
Biomarker Technologies သည် လုံးဝကွာဟမှုမရှိသော ဘက်တီးရီးယားများ၏ ဗီဇအပြည့်အစုံကို တည်ဆောက်ရာတွင် စီတန်းခြင်းဝန်ဆောင်မှုကို ဆောင်ရွက်ပေးပါသည်။ဘက်တီးရီးယားများ၏ ပင်မလုပ်ငန်းအသွားအလာတွင် ဂျီနိုမ်တည်ဆောက်မှုပြီးမြောက်ခြင်းတွင် တတိယမျိုးဆက် sequencing၊ စုဝေးမှု၊ လုပ်ဆောင်နိုင်သော မှတ်ချက်များနှင့် တိကျသောသုတေသနပန်းတိုင်များကို ဖြည့်ဆည်းပေးသည့် အဆင့်မြင့် bioinformatic analysis တို့ပါဝင်သည်။ဘက်တီးရီးယား ဂျီနိုမ်၏ ပိုမိုပြည့်စုံသော ပရိုဖိုင်းသည် ၎င်းတို့၏ ဇီဝဖြစ်စဉ်များကို အရင်းခံသည့် အခြေခံ ယန္တရားများကို ဖော်ထုတ်နိုင်စေသည်၊ ၎င်းသည် မြင့်မားသော eukaryotic မျိုးစိတ်များတွင် မျိုးဗီဇဆိုင်ရာ သုတေသနများအတွက် တန်ဖိုးရှိသော ကိုးကားချက်ကိုလည်း ပေးစွမ်းနိုင်သည်
ပလပ်ဖောင်း-Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio နောက်ဆက်တွဲ II
