ထုတ်ကုန်များ

Single- nucleus RNA Sequencing

ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဖမ်းယူခြင်းနှင့် တစ်ဦးချင်း စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်မှုနည်းပညာတွင် မြင့်မားသော ဆင့်ကဲဆင့်ကဲမှုဖြင့် ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် ဗီဇဖော်ပြမှုကို ဆဲလ်တစ်ခုချင်းအလိုက် ဆဲလ်အလိုက် လေ့လာမှုများကို ခွင့်ပြုသည်။၎င်းသည် ဆဲလ်အားလုံး၏ ပျမ်းမျှအားယူခြင်းဖြင့် ၎င်းတို့၏ မျိုးရိုးဗီဇကို ဖုံးကွယ်ထားခြင်းကို ရှောင်ရှားနိုင်စေမည့် ရှုပ်ထွေးသောဆဲလ်လူဦးရေအပေါ် ပိုမိုနက်နဲပြီး ပြီးပြည့်စုံသော စနစ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို လုပ်ဆောင်နိုင်စေပါသည်။

သို့သော်လည်း အချို့သောဆဲလ်များသည် ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဆိုင်းငံ့ခြင်းအဖြစ် ပြုလုပ်ရန် မသင့်လျော်သောကြောင့် အခြားနမူနာပြင်ဆင်မှုနည်းလမ်းများ - တစ်ရှူးများမှ နျူကလိယကို ထုတ်ယူရန် လိုအပ်သည်၊ ဆိုလိုသည်မှာ နျူကလိယအား တစ်ရှူးများ သို့မဟုတ် ဆဲလ်များမှ တိုက်ရိုက်ထုတ်ယူပြီး single-nucleus suspension အဖြစ် ပြင်ဆင်သည်။ ဆဲလ် စီစစ်ခြင်း။

BMK သည် 10× Genomics ChromiumTM အခြေပြု ဆဲလ်တစ်ခုတည်း RNA စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ဤဝန်ဆောင်မှုကို ခုခံအားဆဲလ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ အကျိတ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ တစ်သျှူးများ ဖွံ့ဖြိုးခြင်းစသည့် ရောဂါဆိုင်ရာ လေ့လာမှုများတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အသုံးပြုခဲ့သည်။

Spatial transcriptome ချစ်ပ်- 10× Genomics

ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း

ကြှနျုပျတို့ကိုဆကျသှယျရနျ

ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

ဇီဝအချက်အလက်

သရုပ်ပြရလဒ်များ

နည်းပညာနိယာမ

နျူကလိယ၏ အထီးကျန်မှုကို 10× Genomics ChromiumTM ဖြင့် ရရှိပြီး လမ်းကြောင်းနှစ်ထပ်ရှိသော microfluidics စနစ်ပါ၀င်သည်။ဤစနစ်တွင်၊ ဘားကုဒ်များနှင့် primer၊ အင်ဇိုင်းများနှင့် နျူကလိယတစ်ခုပါရှိသော ဂျယ်ပုတီးစေ့များကို နာနိုလီတာအရွယ် အဆီတစ်စက်တွင် ဖုံးအုပ်ထားပြီး Gel Bead-in-Emulsion (GEM) ကို ထုတ်ပေးပါသည်။GEM ကိုဖွဲ့စည်းပြီးသည်နှင့် GEM တစ်ခုစီတွင် cell lysis နှင့် barcode များထုတ်လွှတ်ခြင်းကိုလုပ်ဆောင်သည်။mRNA သည် 10× ဘားကုဒ်များနှင့် UMI ပါရှိသော cDNA မော်လီကျူးများအဖြစ် ပြောင်းပြန်ကူးယူဖော်ပြသည်၊၊ ၎င်းသည် စံချိန်စံညွှန်းစီခြယ်ထားသော စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်မှုတွင် နောက်ထပ်အကြောင်းအရာများဖြစ်သည်။

တစ်ရှူးတစ်ခုတည်း ဆဲလ်ဆိုင်းထိန်းပြင်ဆင်မှုအတွက် မသင့်လျော်ပါ။

ဆဲလ်/တစ်ရှူး	အကြောင်းပြချက်
အေးခဲနေသော တစ်ရှူးများကို မလန်းဆန်းပါ။	လတ်ဆတ်သော သို့မဟုတ် တာရှည်သိမ်းဆည်းထားသော အဖွဲ့အစည်းများကို ရယူ၍မရပါ။
ကြွက်သားဆဲလ်၊ Megakaryocyte၊ အဆီ...	တူရိယာကို ထည့်သွင်းရန် ဆဲလ်အချင်းသည် ကြီးလွန်းသည်။
အသည်း…	ဆဲလ်တစ်ခုတည်းကို မခွဲခြားနိုင်လောက်အောင် ကွဲလွယ်သည်။
အာရုံကြောဆဲလ်၊ ဦးနှောက်...	ပိုမိုထိခိုက်လွယ်သော၊ ဖိစီးရန်လွယ်ကူသည်၊ ဆက်တိုက်ရလဒ်များကို ပြောင်းလဲပေးလိမ့်မည်။
ပန်ကရိယ၊ သိုင်းရွိုက်...	endogenous အင်ဇိုင်းများ ကြွယ်ဝစွာပါဝင်ပြီး single cell suspension ထုတ်လုပ်မှုကို ထိခိုက်စေပါသည်။

Single-nucleus နှင့် Single-cell

လုံးချင်းတို့ဖြစ်သည်။	ဆဲလ်တစ်ခုတည်း
အကန့်အသတ်မရှိ ဆဲလ်အချင်း	ဆဲလ်အချင်း: 10-40 μm
အဆိုပါပစ္စည်းကိုအေးခဲတစ်ရှူးနိုင်ပါတယ်။	ပစ္စည်းသည် လတ်ဆတ်သော တစ်ရှူးဖြစ်ရမည်။
အေးခဲနေသောဆဲလ်များ၏ ဖိအားနည်းသည်။	အင်ဇိုင်းကုသမှုသည် ဆဲလ်ဖိစီးမှုတုံ့ပြန်မှုကို ဖြစ်စေနိုင်သည်။
သွေးနီဥတွေကို ဖယ်ရှားဖို့ မလိုအပ်ပါဘူး။	သွေးနီဥတွေကို ဖယ်ရှားဖို့ လိုပါတယ်။
Nuclear သည် ဇီဝအချက်အလက်များကို ဖော်ပြသည်။	ဆဲလ်တစ်ခုလုံးသည် ဇီဝအချက်အလက်များကို ဖော်ပြသည်။