उत्पादनहरू

१०x जीनोमिक्स भिजियम स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोम

स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स एक अत्याधुनिक प्रविधि हो जसले अनुसन्धानकर्ताहरूलाई तिनीहरूको स्थानिक सन्दर्भलाई सुरक्षित राख्दै तन्तुहरू भित्र जीन अभिव्यक्ति ढाँचाहरूको अनुसन्धान गर्न अनुमति दिन्छ। यस डोमेनमा एउटा शक्तिशाली प्लेटफर्म १०x जेनोमिक्स भिजियम हो जुन इलुमिना अनुक्रमणसँग जोडिएको छ। १०X भिजियमको सिद्धान्त तोकिएको क्याप्चर क्षेत्र भएको विशेष चिपमा हुन्छ जहाँ तन्तु खण्डहरू राखिन्छन्। यो क्याप्चर क्षेत्रमा बारकोड गरिएका स्पटहरू हुन्छन्, प्रत्येक तन्तु भित्रको एक अद्वितीय स्थानिक स्थानसँग मेल खान्छ। तन्तुबाट क्याप्चर गरिएका आरएनए अणुहरूलाई त्यसपछि रिभर्स ट्रान्सक्रिप्शन प्रक्रियाको क्रममा अद्वितीय आणविक पहिचानकर्ताहरू (UMIs) ले लेबल गरिन्छ। यी बारकोड गरिएका स्पटहरू र UMI ले एकल-कोशिका रिजोल्युसनमा जीन अभिव्यक्तिको सटीक स्थानिक म्यापिङ र परिमाणीकरण सक्षम बनाउँछन्। स्थानिक बारकोड गरिएका नमूनाहरू र UMI हरूको संयोजनले उत्पन्न डेटाको शुद्धता र विशिष्टता सुनिश्चित गर्दछ। यो स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स प्रविधि प्रयोग गरेर, अनुसन्धानकर्ताहरूले कोशिकाहरूको स्थानिक संगठन र तन्तुहरू भित्र हुने जटिल आणविक अन्तरक्रियाको गहिरो बुझाइ प्राप्त गर्न सक्छन्, जसले ओन्कोलोजी, न्यूरोसाइन्स, विकासात्मक जीवविज्ञान, इम्युनोलोजी, र वनस्पति अध्ययनहरू सहित धेरै क्षेत्रहरूमा अन्तर्निहित जैविक प्रक्रियाहरूको संयन्त्रहरूमा अमूल्य अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।

प्लेटफर्म: १०X जेनोमिक्स भिजियम र इलुमिना नोभासेक

हामीलाई सम्पर्क गर्नुहोस

सेवा विवरणहरू

बायोइन्फर्मेटिक्स

डेमो परिणामहरू

विशेष प्रकाशनहरू

प्राविधिक योजना

विशेषताहरू

● रिजोल्युसन: १०० µM

● स्पट व्यास: ५५ µM

● स्थान संख्या: ४९९२

● क्याप्चर क्षेत्र: ६.५ x ६.५ मिमी

● प्रत्येक बारकोड गरिएको ठाउँ ४ खण्डहरू मिलेर बनेको प्राइमरहरूले भरिएको हुन्छ:

- mRNA प्राइमिङ र cDNA संश्लेषणको लागि पोली(dT) टेल

- प्रवर्धन पूर्वाग्रह सच्याउन अद्वितीय आणविक पहिचानकर्ता (UMI)

- स्थानिय बारकोड

- आंशिक पठन १ अनुक्रमण प्राइमरको बाइन्डिङ अनुक्रम

● खण्डहरूको H&E रंग लगाउने

फाइदाहरू

●एक-स्टप सेवा: क्रायो-सेक्शनिङ, स्टेनिङ, टिस्यु अप्टिमाइजेसन, स्पेसियल बारकोडिङ, पुस्तकालय तयारी, अनुक्रमण र बायोइन्फर्मेटिक्स सहित सबै अनुभव र सीप-आधारित चरणहरू एकीकृत गर्दछ।

● उच्च-कुशल प्राविधिक टोली: २५० भन्दा बढी तन्तु प्रकारहरू र मानव, मुसा, स्तनधारी, माछा र बोटबिरुवाहरू सहित १००+ प्रजातिहरूमा अनुभव भएको।

●सम्पूर्ण परियोजनाको वास्तविक-समय अपडेट: प्रयोगात्मक प्रगतिको पूर्ण नियन्त्रणको साथ।

●व्यापक मानक जैव सूचना विज्ञान:प्याकेजमा २९ विश्लेषण र १००+ उच्च-गुणस्तरका तथ्याङ्कहरू समावेश छन्।

●अनुकूलित डेटा विश्लेषण र दृश्यावलोकन: विभिन्न अनुसन्धान अनुरोधहरूको लागि उपलब्ध।

●एकल-कोशिका mRNA अनुक्रमणको साथ वैकल्पिक संयुक्त विश्लेषण

निर्दिष्टीकरणहरू

नमूना आवश्यकताहरू

पुस्तकालय

अनुक्रम रणनीति

सिफारिस गरिएको डेटा

गुणस्तर नियन्त्रण

OCT-इम्बेडेड क्रायो नमूनाहरू

(इष्टतम व्यास: लगभग ६x६x६ मिमी³)

प्रति नमूना २ ब्लकहरू

१०X भिजियम cDNA पुस्तकालय

इलुमिना PE150

प्रति स्थान ५०K PE रिडहरू

(६० जीबी)

RIN > ७

नमूना तयारी मार्गदर्शन र सेवा कार्यप्रवाहको बारेमा थप विवरणहरूको लागि, कृपया एकसँग कुरा गर्न नहिचकिचाउनुहोस्BMKGENE विशेषज्ञ

सेवा कार्यप्रवाह

नमूना तयारी चरणमा, उच्च-गुणस्तरको आरएनए प्राप्त गर्न सकिन्छ भनेर सुनिश्चित गर्न प्रारम्भिक बल्क आरएनए निकासी परीक्षण गरिन्छ। तन्तु अनुकूलन चरणमा खण्डहरू दाग र दृश्यात्मक हुन्छन् र तन्तुबाट mRNA रिलीजको लागि पारगम्यता अवस्थाहरू अनुकूलित हुन्छन्। त्यसपछि अनुकूलित प्रोटोकल पुस्तकालय निर्माणको क्रममा लागू गरिन्छ, त्यसपछि अनुक्रमण र डेटा विश्लेषण गरिन्छ।

पूर्ण सेवा कार्यप्रवाहमा वास्तविक-समय अद्यावधिकहरू र ग्राहक पुष्टिकरणहरू समावेश हुन्छन् जसले गर्दा प्रतिक्रियाशील प्रतिक्रिया लूप कायम राखिन्छ, जसले गर्दा परियोजनाको सहज कार्यान्वयन सुनिश्चित हुन्छ।

अघिल्लो: पूर्ण-लम्बाइ mRNA अनुक्रमण-नानोपोर

अर्को: वनस्पति/जनावरको सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण

निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:

डाटा गुणस्तर नियन्त्रण:

o डाटा आउटपुट र गुणस्तर स्कोर वितरण

o प्रति स्थान जीन पत्ता लगाउने

o टिस्यु कभरेज

भित्री-नमूना विश्लेषण:

o जीन समृद्धि

o स्पट क्लस्टरिङ, कम आयाम विश्लेषण सहित

o क्लस्टरहरू बीचको भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण: मार्कर जीनहरूको पहिचान

o मार्कर जीनको कार्यात्मक एनोटेसन र संवर्धन

अन्तर-समूह विश्लेषण

o दुवै नमूनाहरू (जस्तै रोगग्रस्त र नियन्त्रण) बाट दागहरूको पुन: संयोजन र पुन: क्लस्टर

o प्रत्येक क्लस्टरको लागि मार्कर जीनको पहिचान

o मार्कर जीनको कार्यात्मक एनोटेसन र संवर्धन

o समूहहरू बीच एउटै क्लस्टरको भिन्न अभिव्यक्ति

भित्री-नमूना विश्लेषण

स्पट क्लस्टरिङ

१०x (१०)

मार्कर जीन पहिचान र स्थानिय वितरण

१०x (१२)

अन्तर-समूह विश्लेषण

दुवै समूह र पुन: क्लस्टरबाट डेटा संयोजन

नयाँ क्लस्टरहरूको मार्कर जीनहरू

१०X भिजियम द्वारा BMKGene को स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स सेवा द्वारा सहजीकरण गरिएको प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस् यी विशेष प्रकाशनहरूमा:

चेन, डी. एट अल. (२०२३) 'स्तनधारी आसंजन GPCRs को सम्भावित ड्रोसोफिला समरूप, mthl1, झिंगाहरूमा इन्जेक्टेड ओन्कोजेनिक कोशिकाहरूमा एन्टीट्यूमर प्रतिक्रियाहरूमा संलग्न छ',संयुक्त राज्य अमेरिकाको राष्ट्रिय विज्ञान प्रतिष्ठानको कार्यवाही, १२०(३०), पृष्ठ. e२३०३४६२१२०. doi: /१०.१०७३/pnas.२३०३४६२१२०

चेन, वाई. एट अल. (२०२३) 'स्टीलले स्पेसियोटेम्पोरल ट्रान्सक्रिप्टोमिक डेटाको उच्च-रिजोल्युसन रेखांकन सक्षम बनाउँछ',बायोइन्फर्मेटिक्समा ब्रीफिङहरू, २४(२), पृ. १–१०। doi: १०.१०९३/BIB/BBAD068।

लिउ, सी. एट अल. (२०२२) 'अर्किड फूलहरूको विकासमा अर्गानोजेनेसिसको एक स्पेसियोटेम्पोरल एटलस',न्यूक्लिक एसिड अनुसन्धान, ५०(१७), पृष्ठ ९७२४–९७३७। doi: 10.1093/NAR/GKAC773।

वाङ, जे. एट अल. (२०२३) 'स्थानिक ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स र एकल-न्यूक्लियस आरएनए अनुक्रमणलाई एकीकृत गर्नाले गर्भाशय लियोमायोमाको लागि सम्भावित चिकित्सीय रणनीतिहरू प्रकट हुन्छ',जैविक विज्ञानको अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल, १९(८), पृ. २५१५–२५३०। doi: 10.7150/IJBS.83510।