१६S/१८S/ITS एम्पलिकन सिक्वेन्सिङ-NGS
सेवा सुविधाहरू
● अनुक्रमण प्लेटफर्म: इलुमिना नोभासेक।
● १६S, १८S र ITS का छोटो क्षेत्रहरूको प्रवर्धन, अन्य प्रवर्धन लक्ष्यहरू सहित।
● एम्प्लिकनको लचिलो विकल्पहरू।
● धेरै प्रवर्धन लक्ष्यहरूसँग अघिल्लो परियोजना अनुभव।
सेवाका फाइदाहरू
●आइसोलेसन-मुक्त:वातावरणीय नमूनाहरूमा सूक्ष्मजीव संरचनाको द्रुत पहिचान।
●उच्च रिजोल्युसन: वातावरणीय नमूनाहरूमा कम-प्रचुर मात्रामा घटकहरूमा।
●व्यापक रूपमा लागू हुने: विविध सूक्ष्मजीव समुदाय अध्ययन।
●व्यापक जैविक सूचना विश्लेषण: डाटाबेस, एनोटेसन, OTU/ASV को सन्दर्भमा विविध विश्लेषणहरू सहितको नवीनतम QIIME2 प्याकेज (माइक्रोबियल पारिस्थितिकीमा मात्रात्मक अन्तर्दृष्टि)।
●व्यापक विशेषज्ञता: वार्षिक रूपमा १५० हजार एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरू सञ्चालन गर्दै, BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछिको समर्थन ल्याउँछ।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा |
| एम्प्लिकन | इलुमिना PE250 | ५०/१००/३०० हजार ट्यागहरू (जोडाहरू पढ्नुहोस्) |
सेवा आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल रकम (एनजी) | भोल्युम (µL) |
| ≥१ | ≥२०० | ≥२० |
● माटो/हिलो: १-२ ग्राम
● जनावरको आन्द्रामा हुने मात्रा: ०.५-२ ग्राम
● आन्द्राको सामग्री-कीरा: ०.१-०.२५ ग्राम
● बिरुवाको सतह (समृद्ध तलछट): ०.१-०.५ ग्राम
● किण्वन शोरबा समृद्ध तलछट): ०.१-०.५ ग्राम
● दिसा (ठूला जनावरहरू): ०.५-२ ग्राम
● दिसा (मुसा): ३-५ दाना
● पल्मोनरी एल्भिओलर ल्याभेज फ्लुइड: फिल्टर पेपर
● योनि स्वाब: ५-६ स्वाब
● छाला/जननांग स्वाब/र्याल/मौखिक नरम तन्तु/फ्यारेन्जियल स्वाब/रेक्टल स्वाब: २-३ स्वाब
● सतह सूक्ष्मजीवहरू: फिल्टर पेपर
● पानीको शरीर/वायु/बायोफिल्म: फिल्टर पेपर
● एन्डोफाइट्स: १-२ ग्राम
● डेन्टल प्लाक: ०.५-१ ग्राम
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
- कच्चा डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
- OTU क्लस्टरिङ / De-noise(ASV)
- OTU एनोटेसन
- अल्फा विविधता विश्लेषण: श्यानन, सिम्पसन र ACE सहित धेरै अनुक्रमणिकाहरू।
- बिटा विविधता विश्लेषण
- अन्तर-समूह विश्लेषण
- सहसम्बन्ध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र OUT संरचना र विविधता बीच
- १६S कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी
वर्गीकरण वितरणको हिस्टोग्राम
वर्गीकरण प्रचुरता समूहीकरण ताप नक्सा
अल्फा विविधता विश्लेषण: दुर्लभता वक्र
बिटा विविधता विश्लेषण: NMDS
अन्तरसमूह विश्लेषण: LEFSE बायोमार्कर खोज
प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत इलुमिनासँग BMKGene को एम्प्लिकन सिक्वेन्सिङ सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
डोङ, सी. एट अल. (२०२२) 'एसेम्बली, कोर माइक्रोबायोटा, र युकोमिया उल्मोइड्समा राइजोस्फियर माटो र बार्क माइक्रोबायोटाको कार्य', फ्रन्टियर्स इन माइक्रोबायोलोजी, १३. doi: १०.३३८९/FMICB.२०२२.८५५३१७/FULL।
ली, वाई. एट अल. (२०२३) 'मुसामा गार्डनेरेला योनिलिस-प्रेरित ब्याक्टेरियल योनिनोसिसको उपचारको लागि सिंथेटिक ब्याक्टेरियल कन्सोर्टिया प्रत्यारोपण', माइक्रोबायोम, ११(१), पृ. १–१४। doi: १०.११८६/s४०१६८-०२३-०१४९७-y
याङ, जे., फु, वाई. र लिउ, एच. (२०२२) 'भूमिमा आधारित बन्द जैविक पुनर्जन्म जीवन समर्थन प्रयोग "चन्द्र दरबार ३६५" को समयमा सङ्कलन गरिएको हावाको धुलोको सूक्ष्मजीवहरू, वातावरणीय सूक्ष्मजीवहरू, १७(१), पृष्ठ १–२०। doi: १०.११८६/S40793-022-00399-0/FIGURES/8।
यिन, एस. एट अल. (२०२२) 'नाइट्रोजन रूपान्तरणसँग सम्बन्धित कार्यात्मक जीनहरूको फिडस्टक-निर्भर प्रशस्तताले कम्पोस्टिङमा नाइट्रोजन हानि नियन्त्रण गर्दछ', बायोरिसोर्स टेक्नोलोजी, ३६१, पृष्ठ १२७६७८। doi: १०.१०१६/J.BIORTECH.२०२२.१२७६७८।
