BMKCloud Log in
条形 ब्यानर-03

उत्पादनहरू

बल्क सेग्रेगेन्ट विश्लेषण

बल्केड सेग्रेगेन्ट एनालिसिस (BSA) एक प्रविधि हो जुन फिनोटाइप सम्बन्धित आनुवंशिक मार्करहरू छिटो पहिचान गर्न प्रयोग गरिन्छ।BSA को मुख्य कार्यप्रवाहले अत्यन्तै विरोधी फेनोटाइपहरू भएका व्यक्तिहरूको दुई समूहहरू चयन गर्ने, सबै व्यक्तिहरूको DNA लाई दुईवटा थोक DNA बनाउन, दुई पोखरीहरू बीचको भिन्नता अनुक्रमहरू पहिचान गर्ने समावेश गर्दछ।यो प्रविधिलाई वनस्पति/जनावरको जीनोमहरूमा लक्षित जीनहरूद्वारा जोडिएको आनुवंशिक मार्करहरू पहिचान गर्न व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ।


सेवा विवरण

डेमो परिणामहरू

मामला अध्ययन

सेवा लाभहरू

१२

Takagi et al।, प्लान्ट जर्नल, 2013

● सटीक स्थानीयकरण: पृष्ठभूमि शोर कम गर्न 30+30 देखि 200+200 व्यक्तिहरूसँग बल्कहरू मिश्रण गर्दै;गैर-सार्थक mutatants आधारित उम्मेद्वार क्षेत्र भविष्यवाणी।

● व्यापक विश्लेषण: NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, आदि सहितको गहन उम्मेद्वार जीन प्रकार्य एनोटेसन।

● छिटो टर्नअराउन्ड समय: 45 कार्य दिन भित्र द्रुत जीन स्थानीयकरण।

● व्यापक अनुभव: BMK ले बाली, जलीय उत्पादन, वन, फूल, फलफूल, आदि जस्ता विविध प्रजातिहरूलाई समेटेर हजारौं विशेषताहरू स्थानीयकरणमा योगदान गरेको छ।

सेवा विशिष्टताहरू

जनसंख्या:
विरोधी phenotypes संग आमाबाबुको सन्तान अलग।
जस्तै F2 सन्तान, ब्याकक्रसिङ (BC), रिकम्बिनेन्ट इनब्रेड लाइन (RIL)

मिश्रण पोखरी
गुणात्मक विशेषताहरूको लागि: 30 देखि 50 व्यक्तिहरू (न्यूनतम 20) / थोक
मात्रात्मक ट्राटिसका लागि: सम्पूर्ण जनसंख्यामा चरम फेनोटाइप भएका शीर्ष 5% देखि 10% व्यक्तिहरू (न्यूनतम 30+30)।

सिफारिस गरिएको अनुक्रम गहिराई
कम्तिमा 20X/अभिभावक र 1X/संतति व्यक्ति (उदाहरणका लागि 30+30 व्यक्तिको सन्तान मिश्रण पूलको लागि, अनुक्रम गहिराई 30X प्रति बल्क हुनेछ)

बायोइन्फर्मेटिक्स विश्लेषण

● सम्पूर्ण जीनोम अनुकरण
 
● डाटा प्रशोधन
 
● SNP/Indel कलिङ
 
● उम्मेदवार क्षेत्र स्क्रिनिङ
 
● उम्मेदवार जीन प्रकार्य एनोटेसन

流程图-BS-A1

नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी

नमूना आवश्यकताहरू:

न्यूक्लियोटाइड्स:

gDNA नमूना

ऊतक नमूना

एकाग्रता: ≥30 ng/μl

बिरुवा: 1-2 ग्राम

रकम: ≥2 μg (भोलम ≥15 μl)

जनावरहरू: 0.5-1 ग्राम

शुद्धता: OD260/280= 1.6-2.5

सम्पूर्ण रगत: 1.5 एमएल

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना QC

प्रयोग डिजाइन

नमूना वितरण

नमूना वितरण

पायलट प्रयोग

आरएनए निकासी

पुस्तकालय तयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रम

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

डाटा विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू

बिक्री पछि सेवाहरू


  • अघिल्लो:
  • अर्को:

  • 1. उम्मेद्वार क्षेत्र पहिचान गर्न युक्लिडियन दूरी (ED) मा एसोसिएशन विश्लेषण आधार।निम्न चित्रमा

    X-अक्ष: क्रोमोजोम संख्या;प्रत्येक डटले SNP को ED मान प्रतिनिधित्व गर्दछ।कालो रेखा फिट गरिएको ED मानसँग मेल खान्छ।उच्च ईडी मानले साइट र फेनोटाइप बीचको अधिक महत्त्वपूर्ण सम्बन्धलाई संकेत गर्दछ।रातो ड्यास रेखाले महत्त्वपूर्ण सम्बन्धको थ्रेसहोल्ड प्रतिनिधित्व गर्दछ।

    mRNA-FLNC-पढ्ने-लम्बाइ-वितरण

     

    2. कुनै SNP-सूचकाङ्कमा आधारित एसोसिएशन विश्लेषण

    X-अक्ष: क्रोमोजोम संख्या;प्रत्येक थोप्लाले SNP-सूचकांक मानलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ।कालो रेखा फिट गरिएको SNP-सूचकांक मानको लागि खडा हुन्छ।जति ठूलो मूल्य हुन्छ, त्यति नै महत्त्वपूर्ण संघ हुन्छ।

    mRNA-पूर्ण-ORF-लम्बाइ-वितरण

     

    BMK केस

    प्रमुख-प्रभाव मात्रात्मक विशेषता लोकस Fnl7.1 ले काकडीमा फलफूलको घाँटी लम्बाइसँग सम्बन्धित ढिलो भ्रूण उत्पन्न प्रचुर मात्रामा प्रोटिनलाई एन्कोड गर्छ।

    प्रकाशित: प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल, २०२०

    अनुक्रम रणनीति:

    अभिभावक (Jin5-508, YN): 34× र 20× को लागि सम्पूर्ण जीनोम रिक्वेन्सिङ।

    DNA पूलहरू (50 लामो घाँटी र 50 छोटो घाँटी): 61x र 52x को लागि अनुकरण

    प्रमुख परिणामहरू

    यस अध्ययनमा, पृथक जनसंख्या (F2 र F2:3) लामो घाँटी काकम्बर लाइन Jin5-508 र छोटो घाँटी YN क्रस गरेर उत्पन्न गरिएको थियो।दुईवटा डीएनए पोखरी ५० चरम लामो घाँटी भएका व्यक्ति र ५० चरम छोटो घाँटी भएका व्यक्तिहरूद्वारा निर्माण गरिएका थिए।प्रमुख-प्रभाव QTL Chr07 मा BSA विश्लेषण र परम्परागत QTL म्यापिङ द्वारा पहिचान गरिएको थियो।उम्मेदवार क्षेत्रलाई फाइन-म्यापिङ, जीन एक्सप्रेशन क्वान्टिफिकेशन र ट्रान्सजेनिक प्रयोगहरूद्वारा थप संकुचित गरिएको थियो, जसले गर्दन-लम्बाइ, CsFnl7.1 नियन्त्रण गर्ने मुख्य जीन प्रकट गर्‍यो।थप रूपमा, CsFnl7.1 प्रवर्तक क्षेत्रमा बहुरूपता सम्बन्धित अभिव्यक्तिसँग सम्बन्धित भएको पाइयो।थप फाइलोजेनेटिक विश्लेषणले सुझाव दियो कि Fnl7.1 लोकस भारतबाट उत्पन्न भएको धेरै सम्भावना छ।

    PB-पूर्ण-लम्बाइ-RNA-अनुक्रमण-केस-अध्ययन

    ककम्बर घाँटी लम्बाइसँग सम्बन्धित उम्मेद्वार क्षेत्र पहिचान गर्न BSA विश्लेषणमा QTL- म्यापिङ

    PB-पूर्ण-लम्बाइ-RNA-वैकल्पिक-स्प्लिसिङ

    काकडी नेक-लम्बाइ QTL को LOD प्रोफाइलहरू Chr07 मा पहिचान गरियो

     
    सन्दर्भ

    Xu, X, et al।"मुख्य-प्रभाव मात्रात्मक विशेषता लोकस Fnl7.1 ले काकडीमा फलफूलको घाँटीको लम्बाइसँग सम्बन्धित ढिलो भ्रूण जेनेसिस प्रचुर मात्रामा प्रोटीन एन्कोड गर्दछ।"प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल १८.७(२०२०)।

    एक उद्धरण प्राप्त

    यहाँ आफ्नो सन्देश लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्

    हामीलाई आफ्नो सन्देश पठाउनुहोस्: