BMKCloud Log in
条形 ब्यानर-03

उत्पादनहरू

तुलनात्मक जीनोमिक्स

तुलनात्मक जीनोमिक्सको शाब्दिक अर्थ विभिन्न प्रजातिहरूको पूर्ण जीनोम अनुक्रम र संरचनाहरूको तुलना गर्नु हो।यस अनुशासनले विभिन्न प्रजातिहरूमा संरक्षण वा भिन्नता भएका अनुक्रम संरचना र तत्वहरू पहिचान गरेर प्रजातिहरूको विकास, जीन प्रकार्य, जीनोम स्तरमा जीन नियामक संयन्त्रलाई प्रकट गर्ने उद्देश्य राख्दछ।सामान्य तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययनले जीन परिवार, विकासवादी विकास, सम्पूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन, चयनात्मक दबाब, आदिमा विश्लेषणहरू समावेश गर्दछ।


सेवा विवरण

डेमो परिणामहरू

मामला अध्ययन

सेवा लाभहरू

1 तुलनात्मक जीनोमिक्स

● बृहत् विश्लेषण प्याकेज, जसमा आठ सबैभन्दा धेरै आवश्यक विश्लेषणहरू समावेश छन्

● परिणामहरूमा विस्तृत र सजिलै बुझ्न सकिने व्याख्याको साथ विश्लेषणमा उच्च विश्वसनीयता

● राम्रोसँग डिजाइन गरिएको तयार-प्रकाशित तथ्याङ्कहरू

● उच्च-दक्ष बायोइन्फर्मेटिक्स टोलीले विभिन्न व्यक्तिगत विश्लेषण मागहरू पूरा गर्दछ

● विश्लेषणमा उच्च सटीकताका साथ छोटो घुम्ने समय

● 900 भन्दा बढीको संचयी प्रकाशित प्रभाव कारकको साथ 90 भन्दा बढी सफल केसहरूसँग प्रचुर अनुभव

सेवा विशिष्टताहरू

अनुमानित घुमाउरो समय

प्रजातिहरूको संख्या

विश्लेषण गर्दछ

30 काम दिन

६ - १२

जीन परिवार क्लस्टरिंग

जीन परिवार विस्तार र संकुचन

फाइलोजेनेटिक रूख निर्माण

विचलन समय अनुमान (जीवाश्म क्यालिब्रेसन आवश्यक)

LTR सम्मिलन समय (बिरुवाहरूको लागि)

सम्पूर्ण जीनोम नक्कल (बिरुवाहरूको लागि)

चयनात्मक दबाब

सिन्टेनी विश्लेषण

बायोइन्फर्मेटिक्स विश्लेषण

● जीन परिवार

● फिलोजेनेटिक्स

● विचलन समय

● चयनात्मक दबाब

● सिन्टेनी विश्लेषण

流程图तुलनात्मक जीनोमिक्स

नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी

नमूना आवश्यकताहरू:

टिस्यु वा डीएनए जीनोम अनुक्रम र संयोजनको लागि

टिस्यु को लागी

प्रजाति

टिस्यु

सर्वेक्षण

PacBio CCS

जनावर

भिसेरल तन्तु

०.५ ~ १ ग्राम

≥ 3.5 ग्राम

मांसपेशी तन्तु

≥ ५.० ग्राम

≥ ५.० एमएल

स्तनधारी रगत

≥ ०.५ एमएल

कुखुरा/माछाको रगत

बिरुवा

ताजा पात

१ ~ २ ग्राम

≥ ५.० ग्राम

 

पंखुडी / स्टेम

१ ~ २ ग्राम

≥ 10.0 ग्राम

 

जरा/बीउ

१ ~ २ ग्राम

≥ २०.० ग्राम

कक्षहरू

सुसंस्कृत सेल

-

≥ १ x १०8

डाटा

जीनोम अनुक्रम फाइलहरू (.fasta) र एनोटेसन फाइलहरू (.gff3) नजिकको सम्बन्धित प्रजातिहरू

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना QC

प्रयोग डिजाइन

नमूना वितरण

नमूना वितरण

पुस्तकालय तयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रम

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

डाटा विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू

बिक्री पछि सेवाहरू


  • अघिल्लो:
  • अर्को:

  • *यहाँ देखाइएका डेमो परिणामहरू सबै बायोमार्कर टेक्नोलोजीहरूसँग प्रकाशित जीनोमहरूबाट हुन्

    1.LTR सम्मिलित समय अनुमान: चित्रले अन्य प्रजातिहरूको तुलनामा, Weining राई जीनोममा LTR-RTs सम्मिलित समयहरूमा एक अद्वितीय बिमोडल वितरण देखाएको छ।सबैभन्दा भर्खरको शिखर लगभग 0.5 मिलियन वर्ष पहिले देखा पर्‍यो।

    3LTR-सम्मिलन-समय-अनुमान-इन-वेनिङ-राई

    ली गुआंग एट अल।,प्रकृति जेनेटिक्स, २०२१

     

     

    2. च्यायोटे (सेचियम एड्युल) मा फाइलोजेनी र जीन परिवार विश्लेषण : जीन परिवारमा चायोटे र अन्य 13 सम्बन्धित प्रजातिहरूको विश्लेषण गर्दा, चायोटे सर्प (ट्राइकोस्यान्थेस एन्गुइना) सँग सबैभन्दा नजिकको सम्बन्ध भएको पाइयो।27-45 म्याको आसपासमा सर्पबाट व्युत्पन्न भएको चायोटे र 25±4 म्यामा चायोटेमा सम्पूर्ण जीनोम नक्कल (WGD) देखियो, जुन कुकुबिटासीमा तेस्रो WGD घटना हो।

    4फाइलोजेनेटिक-ट्री-अफ-चायोट

    फु ए एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

     

     

    3. सिन्टेनी विश्लेषण: फलफूलको विकासमा फाइटोहर्मोन्ससँग सम्बन्धित केही जीनहरू चायोटे, सर्प र स्क्वासमा पाइयो।चायोटे र स्क्वैस बीचको सम्बन्ध चायोटे र सर्पको बीचको भन्दा अलि बढी छ।

    4फाइलोजेनेटिक-ट्री-अफ-चायोट

    फु ए एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

     

     

    4.Gene परिवार विश्लेषण: G.thurberi र G.davidsonii जीनोमहरूमा जीन परिवार विस्तार र संकुचनमा KEGG संवर्धनले स्टेरोइड बायोसिन्थेसिस र ब्रासिनोस्टेरोइड बायोसिन्थेसिस सम्बन्धित जीनहरू विस्तार गरिएको देखाएको छ।

    4फाइलोजेनेटिक-ट्री-अफ-चायोट

    याङ जेड एट अल।,BMC जीवविज्ञान, २०२१

     

     

    5. सम्पूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन विश्लेषण: 4DTV र Ks वितरण विश्लेषणले सम्पूर्ण जीनोम नक्कल घटना देखाइएको छ।intraspecies को शिखरहरु नक्कल घटनाहरु देखाइएको छ।अन्तरप्रजातिहरूको शिखरहरूले विशिष्टता घटनाहरू देखाइयो।विश्लेषणले संकेत गर्‍यो कि अन्य तीन नजिकका प्रजातिहरूसँग तुलना गर्दा, O. Europaea ले हालसालै ठूलो मात्रामा जीन डुप्लिकेशनबाट गुज्र्यो।

    4फाइलोजेनेटिक-ट्री-अफ-चायोट

    राव जी एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

    BMK केस

    काँटा बिनाको गुलाब: नमी अनुकूलनसँग जोडिएको जीनोमिक अन्तर्दृष्टि

    प्रकाशित: राष्ट्रिय विज्ञान समीक्षा, २०२१

    अनुक्रम रणनीति:

    'बासीकोकाँडारहित' (आर।विचुरैननजीनोम:
    लगभग।93 X PacBio + लगभग।90 X Nanopore + 267 X Illumina

    प्रमुख परिणामहरू

    1. उच्च गुणस्तरको R.wichuraiana जीनोम लामो-पढ्ने क्रमबद्ध प्रविधिहरू प्रयोग गरेर निर्माण गरिएको थियो, जसले 530.07 Mb को एसेम्बली दिन्छ (अनुमानित जीनोम आकार लगभग 525.9 Mb प्रवाह cytometry द्वारा र 525.5 जीनोम सर्वेक्षण द्वारा थियो; लगभग 3% heterozy थियो)।BUSCO अनुमानित स्कोर 93.9% थियो।"पुरानो ब्लश" (haploOB) सँग तुलना गर्दा, यस जीनोमको गुणस्तर र पूर्णता आधार एकल-आधार सटीकता र LTR असेंबली सूचकांक (LAI=20.03) द्वारा पुष्टि गरिएको थियो।R.wichuraiana जीनोममा 32,674 प्रोटीन कोडिङ जीनहरू छन्।

    2. बहु-ओमिक्स संयुक्त विश्लेषण, तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स, आनुवंशिक जनसंख्याको QTL विश्लेषण, R. wichuraiana र Rosa chinensis बीचको महत्वपूर्ण विशिष्टता प्रकट भयो।साथै, QTL मा सम्बन्धित जीनको अभिव्यक्ति भिन्नता स्टेम प्रिकल ढाँचासँग सम्बन्धित हुन सक्छ।

    7KEGG-संवर्धन-मा-जीन-परिवार-विस्तार-र-संकुचन

    सिन्टेनी विश्लेषण, जीन परिवार क्लस्टर, विस्तार र संकुचन विश्लेषण सहित Basye;s Thornless र Rosa chinensis बीचको तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषणले धेरै संख्यामा भिन्नताहरू प्रकट गर्यो, जुन गुलाबमा महत्त्वपूर्ण विशेषताहरूसँग सम्बन्धित छ।NAC र FAR1/FRS जीन परिवारमा भएको अनौठो विस्तार ब्ल्याक स्पटको प्रतिरोधसँग सम्बन्धित हुने सम्भावना धेरै थियो।

    81 तुलनात्मक-जीनोमिक्स-विश्लेषण-बिच-बीटी-र-ओबी 82 तुलनात्मक-जीनोमिक्स-विश्लेषण-बिच-बीटी-र-ओबी 83 तुलनात्मक-जीनोमिक्स-विश्लेषण-बिच-बीटी-र-ओबी

    BT र haploOB जीनोमहरू बीच तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषण।

    सन्दर्भ

    Zhong, M., et al।"चोटा बिनाको गुलाब: आर्द्रता अनुकूलनसँग जोडिएको जीनोमिक अन्तर्दृष्टि"राष्ट्रिय विज्ञान समीक्षा, 2021;, nwab092।

    एक उद्धरण प्राप्त

    यहाँ आफ्नो सन्देश लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्

    हामीलाई आफ्नो सन्देश पठाउनुहोस्: