-
Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-seq)
ChIP-Seq ले हिस्टोन परिमार्जन, ट्रान्सक्रिप्शन कारकहरू, र अन्य DNA-सम्बद्ध प्रोटीनहरूको लागि DNA लक्ष्यहरूको जीनोम-वाइड प्रोफाइलिङ प्रदान गर्दछ।यसले क्रोमेटिन इम्युनो-प्रेसिपिटेसन (ChIP) को विशिष्ट प्रोटीन-डीएनए कम्प्लेक्सहरू पुन: प्राप्ति गर्नको लागि, बरामद DNA को उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमणिका लागि नेक्स्ट-जेनरेशन सिक्वेन्सिङ (NGS) को शक्तिको साथ संयोजन गर्दछ।थप रूपमा, किनभने प्रोटीन-डीएनए कम्प्लेक्सहरू जीवित कोशिकाहरूबाट बरामद हुन्छन्, बाध्यकारी साइटहरू विभिन्न सेल प्रकारहरू र तन्तुहरूमा वा विभिन्न परिस्थितिहरूमा तुलना गर्न सकिन्छ।अनुप्रयोगहरू ट्रान्सक्रिप्शनल नियमनदेखि लिएर विकासका मार्गहरू रोग संयन्त्रहरू र त्यसभन्दा बाहिरका हुन्छन्।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq 6000
-
सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण
साइटोसिन (5-mC) मा पाँचौं स्थानमा DNA मेथिलेसनले जीन अभिव्यक्ति र सेलुलर गतिविधिमा मौलिक प्रभाव पार्छ।असामान्य मेथिलेसन ढाँचाहरू धेरै अवस्था र रोगहरूसँग सम्बन्धित छन्, जस्तै क्यान्सर।WGBS एकल आधार रिजोल्युसनमा जीनोम-वाइड मेथिलेसन अध्ययनको लागि सुनको मानक भएको छ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq6000
-
उच्च थ्रुपुट अनुक्रम (ATAC-seq) को साथ ट्रान्सपोसेस-पहुँचयोग्य क्रोमाटिनको लागि परख
ATAC-seq जीनोम-वाइड क्रोमाटिन पहुँचको विश्लेषणको लागि उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमण विधि हो, जुन जीन अभिव्यक्तिको विश्वव्यापी एपिजेनेटिक नियन्त्रणको लागि महत्त्वपूर्ण छ।सिक्वेन्सिङ एडेप्टरहरू हाइपरएक्टिभ Tn5 ट्रान्सपोसेजद्वारा खुला क्रोमाटिन क्षेत्रहरूमा घुसाइन्छ।पीसीआर प्रवर्द्धन पछि, एक अनुक्रम पुस्तकालय निर्माण गरिन्छ।सबै खुल्ला क्रोमाटिन क्षेत्रहरू एक ट्रान्सक्रिप्शन कारक, वा एक निश्चित हिस्टोन परिमार्जित क्षेत्रको बाध्यकारी साइटहरूमा मात्र सीमित नभई एक विशिष्ट स्पेस-टाइम अवस्था अन्तर्गत प्राप्त गर्न सकिन्छ।
-
रिड्युस्ड रिप्रेजेन्टेशन बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (RRBS)
डीएनए मेथिलेसन अनुसन्धान रोग अनुसन्धानमा सधैं तातो विषय भएको छ, र जीन अभिव्यक्ति र फेनो-टाइपिक लक्षणहरूसँग नजिकको सम्बन्ध छ।RRBS DNA मेथिलेसन अनुसन्धानको लागि सही, कुशल र किफायती विधि हो।प्रमोटर र CpG टापु क्षेत्रहरूको एन्जाइमेटिक क्लीभेज (Msp I) द्वारा संवर्धन, Bisulfite अनुक्रमण संग संयुक्त, उच्च रिजोल्युशन DNA मेथिलेसन पत्ता लगाउने प्रदान गर्दछ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq 6000
