पूर्ण-लम्बाइ mRNA अनुक्रमण-नानोपोर
विशेषताहरू
● पोलि-ए mRNA को क्याप्चर र त्यसपछि cDNA संश्लेषण र पुस्तकालय तयारी
● पूर्ण-लम्बाइका ट्रान्सक्रिप्टहरूको अनुक्रमण
● सन्दर्भ जीनोममा पङ्क्तिबद्धताको आधारमा जैविक सूचनात्मक विश्लेषण
● जैविक सूचना विश्लेषणमा जीन र आइसोफर्म-स्तरमा अभिव्यक्ति मात्र समावेश हुँदैन तर lncRNA, जीन फ्युजन, पोलि-एडेनिलेसन र जीन संरचनाको विश्लेषण पनि समावेश हुन्छ।
सेवाका फाइदाहरू
●आइसोफर्म स्तरमा अभिव्यक्तिको परिमाण निर्धारण: विस्तृत र सटीक अभिव्यक्ति विश्लेषण सक्षम पार्दै, सम्पूर्ण जीन अभिव्यक्तिको विश्लेषण गर्दा लुकाउन सकिने परिवर्तनको पर्दाफास गर्दै
●घटेको डेटा माग:नेक्स्ट-जेनेरेसन सिक्वेन्सिङ (NGS) को तुलनामा, नानोपोर सिक्वेन्सिङले कम डेटा आवश्यकताहरू प्रदर्शन गर्दछ, जसले गर्दा सानो डेटाको साथ जीन अभिव्यक्ति परिमाणीकरण संतृप्तिको बराबर स्तरहरू प्राप्त गर्न अनुमति दिन्छ।
●अभिव्यक्ति परिमाण निर्धारणको उच्च शुद्धता: जीन र आइसोफर्म दुवै स्तरमा
●थप ट्रान्सक्रिप्टोमिक जानकारीको पहिचान: वैकल्पिक पोलिएडेनिलेसन, फ्युजन जीन र lcnRNA र तिनीहरूका लक्षित जीनहरू
●व्यापक विशेषज्ञता: हाम्रो टोलीले हरेक परियोजनामा प्रशस्त अनुभव ल्याउँछ, ८५० भन्दा बढी नानोपोर पूर्ण-लम्बाइको ट्रान्सक्रिप्टोम परियोजनाहरू पूरा गरिसकेको छ र ८,००० भन्दा बढी नमूनाहरू प्रशोधन गरिसकेको छ।
●बिक्री पछिको समर्थन: हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तारित छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा | गुणस्तर नियन्त्रण |
| पोलि ए समृद्ध | न्यानोपोर प्रोमेथियॉन ४८ | ६/१२ जीबी | औसत गुणस्तर स्कोर: Q10 |
नमूना आवश्यकताहरू:
न्यूक्लियोटाइड्स:
| संक्षेप (ng/μl) | मात्रा (μg) | शुद्धता | निष्ठा |
| ≥ १०० | ≥ १.० | OD260/280=1.7-2.5 को कीवर्डहरू OD260/230=0.5-2.5 को कीवर्डहरू जेलमा सीमित वा कुनै प्रोटिन वा डीएनए प्रदूषण देखाइएको छैन। | बिरुवाहरूको लागि: RIN≥७.०; जनावरहरूको लागि: RIN≥७.५; ५.०≥२८सेकेन्ड/१८सेकेन्ड≥१.०; सीमित वा कुनै आधारभूत उचाइ छैन |
● बिरुवाहरू:
जरा, डाँठ वा पत्रदल: ४५० मिलीग्राम
पात वा बीउ: ३०० मिलीग्राम
फलफूल: १.२ ग्राम
● जनावर:
मुटु वा आन्द्रा: ३०० मिलीग्राम
भिसेरा वा मस्तिष्क: २४० मिलीग्राम
मांसपेशी: ४५० मिलीग्राम
हड्डी, कपाल वा छाला: १ ग्राम
● अर्थ्रोपोडहरू:
कीराहरू: ६ ग्राम
क्रस्टेसिया: ३०० मिलीग्राम
● सम्पूर्ण रगत: १ ट्यूब
● कक्षहरू: १०6 कोषहरू
सिफारिस गरिएको नमुना डेलिभरी
कन्टेनर: २ मिलिलिटर सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन पन्नी सिफारिस गरिँदैन)
नमुना लेबलिङ: समूह+प्रतिकृति जस्तै A1, A2, A3; B1, B2, B3।
ढुवानी:
१. सुख्खा बरफ: नमूनाहरूलाई झोलामा प्याक गर्नुपर्छ र सुख्खा बरफमा गाड्नुपर्छ।
२. आरएनए स्थिर ट्यूबहरू: आरएनए नमूनाहरू आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जस्तै आरएनए स्थिर®) मा सुकाउन सकिन्छ र कोठाको तापक्रममा पठाउन सकिन्छ।
सेवा कार्य प्रवाह
न्यूक्लियोटाइड्स:
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
सेवा कार्य प्रवाह
तन्तु:
प्रयोग डिजाइन
नमुना डेलिभरी
आरएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
● कच्चा डेटा प्रशोधन
● ट्रान्सक्रिप्ट पहिचान
● वैकल्पिक स्प्लिसिङ
● जीन स्तर र आइसोफर्म स्तरमा अभिव्यक्ति परिमाणीकरण
● भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण
● प्रकार्य एनोटेसन र समृद्धि (DEGs र DETs)
वैकल्पिक स्प्लिसिङ विश्लेषण
वैकल्पिक पोलिएडेनिलेसन विश्लेषण (APA)
lncRNA भविष्यवाणी
नयाँ जीनको एनोटेसन
DET हरूको समूहीकरण
DEGs मा प्रोटिन-प्रोटिन नेटवर्कहरू
BMKGene को Nanopore पूर्ण-लम्बाइको mRNA अनुक्रम सेवाहरू द्वारा प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत सहजीकरण गरिएको प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
गोंग, बी. एट अल. (२०२३) 'ग्लियोमामा ओन्कोजीनको रूपमा सेक्रेटरी काइनेज FAM20C को एपिजेनेटिक र ट्रान्सक्रिप्शनल सक्रियता', जर्नल अफ जेनेटिक्स एण्ड जीनोमिक्स, ५०(६), पृ. ४२२–४३३। doi: १०.१०१६/J.JGG.२०२३.०१.००८।
He, Z. et al. (२०२३) 'IFN-γ मा प्रतिक्रिया दिने लिम्फोसाइट्सको पूर्ण-लम्बाइको ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमणले फ्लाउन्डर (प्यारालिचथिस ओलिभेसियस) मा Th1-स्क्युड प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया प्रकट गर्दछ', माछा र शेलफिश इम्युनोलोजी, १३४, पृष्ठ १०८६३६। doi: १०.१०१६/J.FSI.२०२३.१०८६३६।
मा, वाई. एट अल. (२०२३) 'नेमोपिलेमा नोमुराई विष पहिचानको लागि प्याकबायो र ओएनटी आरएनए अनुक्रमण विधिहरूको तुलनात्मक विश्लेषण', जीनोमिक्स, ११५(६), पृष्ठ ११०७०९। doi: १०.१०१६/J.YGENO.२०२३.११०७०९।
यु, डी. एट अल. (२०२३) 'न्यानो-सेक विश्लेषणले hUMSC बाट व्युत्पन्न एक्सोसोम र माइक्रोभेसिकलहरू बीचको फरक कार्यात्मक प्रवृत्ति प्रकट गर्दछ', स्टेम सेल अनुसन्धान र थेरापी, १४(१), पृ. १–१३। doi: १०.११८६/S१३२८७-०२३-०३४९१-५/TABLES/६।
