-
प्लान्ट/एनिमल डे नोवो जीनोम सिक्वेन्सिङ
नयाँअनुक्रमणले सन्दर्भ जीनोमको अनुपस्थितिमा अनुक्रमण प्रविधिहरू, जस्तै PacBio, Nanopore, NGS, आदि प्रयोग गरी प्रजातिको सम्पूर्ण जीनोमको निर्माणलाई जनाउँछ।तेस्रो पुस्ताको सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजीहरूको पढ्ने लम्बाइमा भएको उल्लेखनीय सुधारले जटिल जीनोमहरू जम्मा गर्ने नयाँ अवसरहरू ल्याएको छ, जस्तै उच्च हेटरोजाइगोसिटी, दोहोरिने क्षेत्रहरूको उच्च अनुपात, पोलीप्लोइडहरू, आदि। दसौं किलोबेस स्तरमा पढ्ने लम्बाइका साथ, यी सिक्वेन्सिङ रिडहरूले सक्षम बनाउँछ। दोहोरिने तत्वहरूको समाधान, असामान्य GC सामग्री भएका क्षेत्रहरू र अन्य अत्यधिक जटिल क्षेत्रहरू।
प्लेटफर्म: PacBio सिक्वेल II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq6000
-
हाई-सी आधारित जीनोम असेंबली
हाई-सी प्रोबिङ प्रोक्सिमिटी-आधारित अन्तरक्रिया र उच्च-थ्रुपुट अनुक्रम संयोजन गरेर क्रोमोजोम कन्फिगरेसन क्याप्चर गर्न डिजाइन गरिएको विधि हो।यी अन्तरक्रियाहरूको तीव्रता क्रोमोजोमहरूमा भौतिक दूरीसँग नकारात्मक रूपमा सहसंबद्ध भएको विश्वास गरिन्छ।तसर्थ, हाई-सी डाटाले ड्राफ्ट जीनोममा जम्मा गरिएका अनुक्रमहरूको क्लस्टरिङ, अर्डरिङ र अभिमुखीकरण र ती निश्चित संख्यामा क्रोमोजोमहरूमा एंकरिङ गर्न मार्गदर्शन गर्न सक्छ।यो प्रविधिले जनसंख्यामा आधारित आनुवंशिक नक्साको अनुपस्थितिमा क्रोमोजोम-स्तरको जीनोम एसेम्बलीलाई सशक्त बनाउँछ।प्रत्येक एकल जीनोमलाई हाई-सी चाहिन्छ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq6000 / DNBSEQ
-
इभोलुसनरी जेनेटिक्स
इभोलुसनरी आनुवंशिकी SNPs, InDels, SVs र CNVs लगायत आनुवंशिक भिन्नताहरूमा आधारित दिइएका सामग्रीहरूको विकाससम्बन्धी जानकारीको विस्तृत व्याख्या प्रदान गर्न डिजाइन गरिएको प्याक गरिएको अनुक्रमण सेवा हो।यसले विकासवादी परिवर्तनहरू र जनसंख्याको आनुवंशिक विशेषताहरू, जस्तै जनसंख्या संरचना, आनुवंशिक विविधता, फाइलोजेनी सम्बन्धहरू, आदि वर्णन गर्न आवश्यक सबै आधारभूत विश्लेषणहरू प्रदान गर्दछ। यसले जीन प्रवाहमा अध्ययनहरू पनि समावेश गर्दछ, जसले प्रभावकारी जनसंख्या आकार, विचलन समयको अनुमानलाई सशक्त बनाउँछ।
-
तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्सको शाब्दिक अर्थ विभिन्न प्रजातिहरूको पूर्ण जीनोम अनुक्रम र संरचनाहरू तुलना गर्नु हो।यस अनुशासनको उद्देश्य विभिन्न प्रजातिहरूमा संरक्षण वा भिन्नता भएका अनुक्रम संरचना र तत्वहरू पहिचान गरेर प्रजातिहरूको विकास, जीन प्रकार्य, जीन नियामक संयन्त्रलाई जीनोम स्तरमा प्रकट गर्ने हो।सामान्य तुलनात्मक जीनोमिक्स अध्ययनले जीन परिवार, विकासवादी विकास, सम्पूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन, चयनात्मक दबाब, आदिमा विश्लेषणहरू समावेश गर्दछ।
-
बल्क सेग्रेगेन्ट विश्लेषण
बल्केड सेग्रेगेन्ट एनालिसिस (BSA) एक प्रविधि हो जुन फिनोटाइप सम्बन्धित आनुवंशिक मार्करहरू छिटो पहिचान गर्न प्रयोग गरिन्छ।BSA को मुख्य कार्यप्रवाहले अत्यन्तै विरोधी फेनोटाइपहरू भएका व्यक्तिहरूको दुई समूहहरू चयन गर्ने, सबै व्यक्तिहरूको DNA लाई दुईवटा थोक DNA बनाउन, दुई पूलहरू बीचको भिन्नता अनुक्रमहरू पहिचान गर्ने समावेश गर्दछ।यो प्रविधिलाई वनस्पति/जनावरको जीनोमहरूमा लक्षित जीनहरूद्वारा कडा रूपमा सम्बन्धित आनुवंशिक मार्करहरू पहिचान गर्न व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ।
