हाई-सी आधारित क्रोमेटिन अन्तरक्रिया
सेवा सुविधाहरू
● PE150 सँग Illumina NovaSeq मा अनुक्रमण।
● सेवाको लागि फर्मल्डिहाइडसँग क्रस-लिङ्क गर्न र डीएनए-प्रोटिन अन्तरक्रियाहरू संरक्षण गर्न निकालिएको न्यूक्लिक एसिडको सट्टा तन्तु नमूनाहरू आवश्यक पर्दछ।
● हाई-सी प्रयोगमा बायोटिनको साथ टाँसिने छेउहरूको प्रतिबन्ध र अन्त्य मर्मत समावेश छ, त्यसपछि अन्तरक्रियाहरू सुरक्षित गर्दै परिणामस्वरूप ब्लन्ट छेउहरूको गोलाकारीकरण गरिन्छ। त्यसपछि डीएनएलाई स्ट्रेप्टाभिडिन मोतीहरूद्वारा तल तानिन्छ र पछिको पुस्तकालय तयारीको लागि शुद्ध गरिन्छ।
सेवाका फाइदाहरू
●इष्टतम प्रतिबन्ध इन्जाइम डिजाइन: ९३% सम्म मान्य अन्तरक्रिया जोडीहरूको साथ विभिन्न प्रजातिहरूमा उच्च हाई-सी दक्षता सुनिश्चित गर्न।
●व्यापक विशेषज्ञता र प्रकाशन रेकर्डहरू:BMKGene सँग ८०० विभिन्न प्रजातिहरू र विभिन्न पेटेन्टहरूबाट २००० भन्दा बढी हाई-सी सिक्वेन्सिङ परियोजनाहरूमा विशाल अनुभव छ। ९०० भन्दा बढीको संचयी प्रभाव कारक भएका १०० भन्दा बढी प्रकाशित केसहरू।
●उच्च-कुशल बायोइन्फर्मेटिक्स टोली:हाई-सी प्रयोगहरू र डेटा विश्लेषणको लागि आन्तरिक पेटेन्ट र सफ्टवेयर प्रतिलिपि अधिकार र स्व-विकसित दृश्य डेटा सफ्टवेयरको साथ।
●बिक्री पछिको समर्थन:हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तार हुन्छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
●विस्तृत एनोटेसन: हामी धेरै डाटाबेसहरू प्रयोग गर्छौं पहिचान गरिएका भिन्नताहरू भएका जीनहरूलाई कार्यात्मक रूपमा एनोटेट गर्न र सम्बन्धित संवर्धन विश्लेषण गर्न, धेरै अनुसन्धान परियोजनाहरूमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्न।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा आउटपुट | हाई-सी सिग्नल रिजोल्युसन |
| हाई-सी पुस्तकालय | इलुमिना PE150 | क्रोमेटिन लूप: १५०x TAD: ५०x | क्रोमेटिन लूप: १० केबी कम्तीमा: ४० केबी |
सेवा आवश्यकताहरू
| नमुना प्रकार | आवश्यक रकम |
| जनावरको तन्तु | ≥२ ग्राम |
| सम्पूर्ण रगत | ≥२ मिलिलिटर |
| ढुसी | ≥१ ग्राम |
| बिरुवा- युवा तन्तु | १ ग्राम/अलिक्वोट, २-४ अलिक्वोट सिफारिस गरिन्छ |
| संवर्धित कोषहरू | ≥१x१०7 |
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● कच्चा डेटा QC;
● म्यापिङ र हाई-सी लाइब्रेरी QC: मान्य अन्तरक्रिया जोडीहरू र अन्तरक्रिया क्षय घातांकहरू (IDEs);
● जीनोम-व्यापी अन्तरक्रिया प्रोफाइलिङ: cis/trans विश्लेषण र Hi-C अन्तरक्रिया नक्सा;
● A/B कम्पार्टमेन्ट वितरणको विश्लेषण;
● TAD र क्रोमेटिन लूपहरूको पहिचान;
● नमूनाहरू बीचको 3D क्रोमेटिन संरचना तत्वहरू र सम्बन्धित जीनहरूको सम्बन्धित कार्यात्मक एनोटेसनमा भिन्न विश्लेषण।
Cis र ट्रान्स अनुपात वितरण
नमूनाहरू बीचको क्रोमोसोमल अन्तरक्रियाको हिटम्याप
A/B कम्पार्टमेन्टहरूको जीनोम-व्यापी वितरण
क्रोमेटिन लूपहरूको जीनोम-व्यापी वितरण
TADs को दृश्यावलोकन
BMKGene को Hi-C सिक्वेन्सिङ सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका अनुसन्धान प्रगतिहरू प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत अन्वेषण गर्नुहोस्।
मेङ, टी. एट अल. (२०२१) 'तुलनात्मक एकीकृत बहु-ओमिक्स विश्लेषणले CA2 लाई कोर्डोमाको लागि एक नयाँ लक्ष्यको रूपमा पहिचान गर्दछ',न्यूरो-अन्कोलोजी, २३ (१०), पृ. १७०९–१७२२। doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156।
Xu, L. et al. (२०२१) 'जीनोमको थ्रीडी अव्यवस्था र पुनर्संरचनाले एकीकृत हाई-सी, न्यानोपोर, र आरएनए अनुक्रमणद्वारा NAFLD को रोगजननमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ',एक्टा फार्मास्युटिका सिनिका बी, 11(10), पृ. 3150-3164। doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022।
