● Nanopore P48 (१०Kb लाइब्रेरी); PacBio Revio (८Kb लाइब्रेरी) मा लामो पढ्ने अनुक्रमण
● त्रुटि-सुधार: Illumina NovaSeq (PE150 पुस्तकालय) मा अनुक्रमण
●उच्च-गुणस्तरको मेटाजेनोम असेंबली:कम कन्टिगहरू भएको जसमा निरन्तरता बढी हुन्छ।
●उच्च शुद्धता:प्रजाति पहिचान र कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी।
●सुधारिएको असेंबली: ब्याक्टेरिया जीनोम पृथकीकरण र तुलनात्मक मेटाजेनोम विश्लेषणलाई सहजीकरण गर्ने।
●व्यापक जैविक सूचना विज्ञान विश्लेषण:हाम्रो विश्लेषण केवल वर्गीकरण विविधतामा मात्र केन्द्रित छैन तर समुदायको कार्यात्मक विविधतामा पनि केन्द्रित छ।
●व्यापक अनुभव: हाम्रो टोलीले प्रत्येक परियोजनामा प्रशस्त अनुभव ल्याउँछ, विभिन्न अनुसन्धान क्षेत्रहरूमा धेरै मेटाजेनोमिक्स परियोजनाहरू सफलतापूर्वक बन्द गर्ने र २००,००० भन्दा बढी नमूनाहरू प्रशोधन गर्ने ट्र्याक रेकर्डको साथ, हाम्रो टोलीले प्रत्येक परियोजनामा प्रशस्त अनुभव ल्याउँछ।
| अनुक्रमण प्लेटफर्म | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा |
| इलुमिना नोभासेक | PE150 को परिचय | ६ जिबी |
| नानोपोर P48 | १० केबी | ६ / १० जीबी |
| प्याकबायो रेभियो | ८ केबी | १० / २० जीबी |
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल मात्रा (µg) | भोल्युम (µL) | |
| इलुमिना PE150 पुस्तकालय | ≥१ | ≥०.०३ | ≥२० |
| नानोपोर १० केबी पुस्तकालय | ≥४० | ≥२ | ≥२० |
| प्याकबायो ८ केबी पुस्तकालय | ≥५० | १० µg/कोष | ≥२० |
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● अनुक्रमण डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
● मेटाजेनोम एसेम्बली र जीन भविष्यवाणी
● जीन एनोटेसन
● वर्गीकरण अल्फा विविधता विश्लेषण
● समुदायको कार्यात्मक विश्लेषण: जैविक कार्य, मेटाबोलिक, एन्टिबायोटिक प्रतिरोध
● कार्यात्मक र वर्गीकरण विविधता दुवैको विश्लेषण:
बिटा विविधता विश्लेषण
अन्तर-समूह विश्लेषण
सहसम्बन्ध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र OUT संरचना र विविधता बीच
गैर-अनावश्यक जीन सेट वितरण:
जीन एनोटेसन: KEGG मार्ग
जीन एनोटेसन: eggNOG
जीन एनोटेसन: CAZY कार्बोहाइड्रेट
प्रजाति सहसम्बन्ध सञ्जाल:
यस विशेष प्रकाशनको साथ BMKGene को मेटाजेनोमिक्स सिक्वेन्सिङ सेवा Nanopore + Illumina सँगको सहकार्यमा भएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्:
जिन, एच. एट अल. (२०२३) 'इनर मङ्गोलियनहरूको मानव पेटको माइक्रोबायोमको उच्च-गुणस्तरको जीनोम कम्पेन्डियम', नेचर माइक्रोबायोलोजी २०२३ ८:१, ८(१), पृ. १५०–१६१। doi: १०.१०३८/s४१५६४-०२२-०१२७०-१।