条形 ब्यानर-03

उत्पादनहरू

मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिङ-TGS

图片67

मेटाजेनोम भनेको वातावरणीय र मानव मेटाजेनोम जस्ता जीवहरूको मिश्रित समुदायको आनुवंशिक सामग्रीको संग्रह हो। यसमा खेतीयोग्य र अखेतीयोग्य दुवै सूक्ष्मजीवहरूको जीनोमहरू हुन्छन्। मेटाजेनोमिक सिक्वेन्सिङले वर्गीकरण प्रोफाइलिङ भन्दा बढी प्रदान गरेर पारिस्थितिक नमूनाहरूमा एम्बेड गरिएका यी जटिल जीनोमिक परिदृश्यहरूको अध्ययनलाई सक्षम बनाउँछ। यसले एन्कोडेड जीनहरू र वातावरणीय प्रक्रियाहरूमा तिनीहरूको पुटेटिभ भूमिकाहरू अन्वेषण गरेर कार्यात्मक जीनोमिक्स परिप्रेक्ष्य पनि प्रदान गर्दछ। इलुमिना सिक्वेन्सिङको साथ परम्परागत शटगन दृष्टिकोणहरू मेटाजेनोमिक अध्ययनहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ, नानोपोर र प्याकबायो लामो-पढ्ने अनुक्रमको आगमनले क्षेत्र परिवर्तन गरेको छ। नानोपोर र प्याकबायो प्रविधिले डाउनस्ट्रीम बायोइन्फॉर्मेटिक विश्लेषणहरू बढाउँछ, विशेष गरी मेटाजेनोम एसेम्बली, थप निरन्तर एसेम्बलीहरू सुनिश्चित गर्दै। रिपोर्टहरूले संकेत गर्दछ कि नानोपोर-आधारित र प्याकबायो-आधारित मेटाजेनोमिक्सले जटिल माइक्रोबायोमहरूबाट पूर्ण र बन्द ब्याक्टेरिया जीनोमहरू सफलतापूर्वक उत्पन्न गरेको छ (मोस, ईएल, एट अल।, नेचर बायोटेक, २०२०)। इल्युमिना रिडहरूसँग नानोपोर रिडहरू एकीकृत गर्नाले त्रुटि सुधारको लागि रणनीतिक दृष्टिकोण प्रदान गर्दछ, नानोपोरको अन्तर्निहित कम शुद्धतालाई कम गर्दछ। यो सिनर्जिस्टिक संयोजनले प्रत्येक अनुक्रम प्लेटफर्मको शक्तिहरूको लाभ उठाउँछ, सम्भावित सीमितताहरू पार गर्न र मेटाजेनोमिक विश्लेषणहरूको शुद्धता र विश्वसनीयतालाई अगाडि बढाउन एक बलियो समाधान प्रदान गर्दछ।

प्लेटफर्म: नानोपोर प्रोमेथियॉन ४८, इलुमिया र प्याकबायो रेभियो


सेवा विवरणहरू

बायोइन्फर्मेटिक्स

डेमो परिणामहरू

विशेष प्रकाशनहरू

सेवा सुविधाहरू

● Nanopore P48 (१०Kb लाइब्रेरी); PacBio Revio (८Kb लाइब्रेरी) मा लामो पढ्ने अनुक्रमण

● त्रुटि-सुधार: Illumina NovaSeq (PE150 पुस्तकालय) मा अनुक्रमण

सेवाका फाइदाहरू

उच्च-गुणस्तरको मेटाजेनोम असेंबली:कम कन्टिगहरू भएको जसमा निरन्तरता बढी हुन्छ।

उच्च शुद्धता:प्रजाति पहिचान र कार्यात्मक जीन भविष्यवाणी।

सुधारिएको असेंबली: ब्याक्टेरिया जीनोम पृथकीकरण र तुलनात्मक मेटाजेनोम विश्लेषणलाई सहजीकरण गर्ने।

व्यापक जैविक सूचना विज्ञान विश्लेषण:हाम्रो विश्लेषण केवल वर्गीकरण विविधतामा मात्र केन्द्रित छैन तर समुदायको कार्यात्मक विविधतामा पनि केन्द्रित छ।

व्यापक अनुभव: हाम्रो टोलीले प्रत्येक परियोजनामा ​​प्रशस्त अनुभव ल्याउँछ, विभिन्न अनुसन्धान क्षेत्रहरूमा धेरै मेटाजेनोमिक्स परियोजनाहरू सफलतापूर्वक बन्द गर्ने र २००,००० भन्दा बढी नमूनाहरू प्रशोधन गर्ने ट्र्याक रेकर्डको साथ, हाम्रो टोलीले प्रत्येक परियोजनामा ​​प्रशस्त अनुभव ल्याउँछ।

सेवा निर्दिष्टीकरणहरू

अनुक्रमण प्लेटफर्म

अनुक्रम रणनीति

सिफारिस गरिएको डेटा

इलुमिना नोभासेक

PE150 को परिचय

६ जिबी

नानोपोर P48

१० केबी

६ / १० जीबी

प्याकबायो रेभियो

८ केबी

१० / २० जीबी

नमूना आवश्यकताहरू

 

एकाग्रता (ng/µL)

कुल मात्रा (µg)

भोल्युम (µL)

इलुमिना PE150 पुस्तकालय

≥१

≥०.०३

≥२०

नानोपोर १० केबी पुस्तकालय

≥४०

≥२

≥२०

प्याकबायो ८ केबी पुस्तकालय

≥५०

१० µg/कोष ≥२०

सेवा कार्य प्रवाह

नमुना डेलिभरी

नमुना डेलिभरी

पुस्तकालय तयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रमण

अनुक्रमण

तथ्याङ्क विश्लेषण

तथ्याङ्क विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू

बिक्री पछि सेवाहरू


  • अघिल्लो:
  • अर्को:

  • 流程图 贝贝第三版-02

    निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:

    ● अनुक्रमण डेटा गुणस्तर नियन्त्रण

    ● मेटाजेनोम एसेम्बली र जीन भविष्यवाणी

    ● जीन एनोटेसन

    ● वर्गीकरण अल्फा विविधता विश्लेषण

    ● समुदायको कार्यात्मक विश्लेषण: जैविक कार्य, मेटाबोलिक, एन्टिबायोटिक प्रतिरोध

    ● कार्यात्मक र वर्गीकरण विविधता दुवैको विश्लेषण:

    बिटा विविधता विश्लेषण

    अन्तर-समूह विश्लेषण

    सहसम्बन्ध विश्लेषण: वातावरणीय कारकहरू र OUT संरचना र विविधता बीच

    गैर-अनावश्यक जीन सेट वितरण:

    图片68 

    जीन एनोटेसन: KEGG मार्ग

    图片69 

    जीन एनोटेसन: eggNOG

     图片70

     

    जीन एनोटेसन: CAZY कार्बोहाइड्रेट

     图片71

    प्रजाति सहसम्बन्ध सञ्जाल:

     图片72

    यस विशेष प्रकाशनको साथ BMKGene को मेटाजेनोमिक्स सिक्वेन्सिङ सेवा Nanopore + Illumina सँगको सहकार्यमा भएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्:

    जिन, एच. एट अल. (२०२३) 'इनर मङ्गोलियनहरूको मानव पेटको माइक्रोबायोमको उच्च-गुणस्तरको जीनोम कम्पेन्डियम', नेचर माइक्रोबायोलोजी २०२३ ८:१, ८(१), पृ. १५०–१६१। doi: १०.१०३८/s४१५६४-०२२-०१२७०-१।

    उद्धरण प्राप्त गर्नुहोस्

    आफ्नो सन्देश यहाँ लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्।

    हामीलाई आफ्नो सन्देश पठाउनुहोस्: