नानोपोर पूर्ण-लम्बाइको ट्रान्सक्रिप्टोम

नानोपोर ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ पूर्ण-लम्बाइको cDNA हरू अनुक्रमण गर्न, ट्रान्सक्रिप्ट आइसोफर्महरू सही रूपमा पहिचान गर्न र परिमाण निर्धारण गर्नको लागि एक शक्तिशाली विधि हो। BMKCloud नानोपोर फुल-लेन्थ ट्रान्सक्रिप्टोम पाइपलाइन उच्च-गुणस्तरको राम्रो-एनोटेटेड सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध नानोपोर प्लेटफर्ममा उत्पन्न RNA-Seq डेटा विश्लेषण गर्न डिजाइन गरिएको हो, जसले जीन र ट्रान्सक्रिप्ट दुवै स्तरमा गुणात्मक र मात्रात्मक विश्लेषण प्रदान गर्दछ। गुणस्तर नियन्त्रण पछि, पूर्ण-लम्बाइको गैर-काइमेरिक (FLNC) अनुक्रमहरू प्राप्त गरिन्छ र अनावश्यक ट्रान्सक्रिप्टहरू हटाउन सन्दर्भ जीनोममा सहमति अनुक्रमहरू म्याप गरिन्छ। यस ट्रान्सक्रिप्ट सेटबाट, अभिव्यक्ति परिमाणित गरिन्छ र भिन्न रूपमा व्यक्त गरिएको जीनहरू र ट्रान्सक्रिप्टहरू पहिचान गरिन्छ र कार्यात्मक रूपमा एनोटेट गरिन्छ। पाइपलाइनमा वैकल्पिक पोलीएडेनिलेसन (APA) विश्लेषण, वैकल्पिक स्प्लिसिङ विश्लेषण, सरल अनुक्रम दोहोरिने (SSR) विश्लेषण, lncRNA र सम्बन्धित लक्ष्यहरूको भविष्यवाणी, कोडिङ अनुक्रमहरूको भविष्यवाणी (CDS), जीन परिवार विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन कारक विश्लेषण, उपन्यास जीनको भविष्यवाणी र ट्रान्सक्रिप्टहरूको कार्यात्मक एनोटेसन पनि समावेश छ।