-
PacBio-पूर्ण-लम्बाइ १६S/१८S/ITS एम्पलिकन सिक्वेन्सिङ
एम्पलिकन (१६एस/१८एस/आईटीएस) प्लेटफर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषणमा वर्षौंको अनुभवको साथ विकसित गरिएको हो, जसमा मानकीकृत आधारभूत विश्लेषण र व्यक्तिगत विश्लेषण समावेश छ: आधारभूत विश्लेषणले हालको माइक्रोबियल अनुसन्धानको मुख्यधारा विश्लेषण सामग्रीलाई समेट्छ, विश्लेषण सामग्री समृद्ध र व्यापक छ, र विश्लेषण परिणामहरू परियोजना रिपोर्टहरूको रूपमा प्रस्तुत गरिन्छ; व्यक्तिगत विश्लेषणको सामग्री विविध छ। नमूनाहरू चयन गर्न सकिन्छ र व्यक्तिगत आवश्यकताहरू पूरा गर्न आधारभूत विश्लेषण रिपोर्ट र अनुसन्धान उद्देश्य अनुसार लचिलो रूपमा प्यारामिटरहरू सेट गर्न सकिन्छ। विन्डोज अपरेटिङ सिस्टम, सरल र छिटो।
-
प्याकबायो-पूर्ण-लम्बाइको ट्रान्सक्रिप्टोम (सन्दर्भ नभएको)
प्यासिफिक बायोसाइन्सेस (प्याकबायो) आइसोफर्म सिक्वेन्सिङ डेटालाई इनपुटको रूपमा लिँदै, यो एपले पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्ट अनुक्रमहरू (एसेम्बली बिना) पहिचान गर्न सक्षम छ। सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध पूर्ण-लम्बाइ अनुक्रमहरू म्याप गरेर, ट्रान्सक्रिप्टहरूलाई ज्ञात जीन, ट्रान्सक्रिप्टहरू, कोडिङ क्षेत्रहरू, आदि द्वारा अनुकूलित गर्न सकिन्छ। यस अवस्थामा, वैकल्पिक स्प्लिसिङ, आदि जस्ता mRNA संरचनाहरूको थप सटीक पहिचान प्राप्त गर्न सकिन्छ। NGS ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ डेटासँगको संयुक्त विश्लेषणले ट्रान्सक्रिप्ट स्तरमा अभिव्यक्तिमा थप व्यापक एनोटेसन र थप सटीक परिमाणीकरण सक्षम बनाउँछ, जसले धेरै हदसम्म डाउनस्ट्रीम डिफरेंशियल अभिव्यक्ति र कार्यात्मक विश्लेषणलाई फाइदा पुर्याउँछ।
-
टुलकिटहरू
BMKCloud जीनोमिक कार्यक्रमहरूको लागि एक-स्टप समाधान प्रदान गर्ने एक अग्रणी बायोइन्फर्मेटिक प्लेटफर्म हो, जुन चिकित्सा, कृषि, वातावरणीय, आदि सहित विभिन्न क्षेत्रका अनुसन्धानकर्ताहरूद्वारा व्यापक रूपमा विश्वास गरिन्छ। BMKCloud जैवइन्फर्मेटिक विश्लेषण प्लेटफर्महरू र उपकरणहरू, कम्प्युटिङ स्रोतहरू, सार्वजनिक डाटाबेस, बायोइन्फर्मेटिक अनलाइन पाठ्यक्रमहरू, आदि सहित एकीकृत, भरपर्दो र कुशल सेवाहरू प्रदान गर्न प्रतिबद्ध छ। BMKCloud सँग जीन एनोटेसन, विकासवादी आनुवंशिक उपकरणहरू, ncRNA, डेटा गुणस्तर नियन्त्रण, एसेम्बली, पङ्क्तिबद्धता, डेटा निकासी, उत्परिवर्तन, तथ्याङ्क, फिगर जेनेरेटर, अनुक्रम विश्लेषण, आदि सहित विभिन्न बारम्बार प्रयोग हुने बायोइन्फर्मेटिक उपकरणहरू छन्।
-
सानो आरएनए
साना आरएनएहरू छोटो गैर-कोडिङ आरएनए हुन् जसको औसत लम्बाइ १८-३० एनटी हुन्छ, जसमा miRNA, siRNA र piRNA समावेश छन्। यी साना आरएनएहरू mRNA डिग्रेडेसन, ट्रान्सलेसन इन्हिबिसन, हेटेरोक्रोमेटिन गठन, आदि जस्ता विभिन्न जैविक प्रक्रियाहरूमा संलग्न भएको व्यापक रूपमा रिपोर्ट गरिएको छ। साना आरएनए सिक्वेन्सिङ विश्लेषणलाई जनावर/बिरुवा विकास, रोग, भाइरस, आदि अध्ययनहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ। साना आरएनए सिक्वेन्सिङ विश्लेषण प्लेटफर्ममा मानक विश्लेषण र उन्नत डेटा माइनिङ हुन्छ। RNA-seq डेटाको आधारमा, मानक विश्लेषणले miRNA पहिचान र भविष्यवाणी, miRNA लक्ष्य जीन भविष्यवाणी, एनोटेसन र अभिव्यक्ति विश्लेषण प्राप्त गर्न सक्छ। उन्नत विश्लेषणले अनुकूलित miRNA खोज र निकासी, भेन रेखाचित्र उत्पादन, miRNA र लक्ष्य जीन नेटवर्क निर्माण सक्षम बनाउँछ।
-
NGS-WGS (इलुमिना/BGI)
NGS-WGS एक सम्पूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण विश्लेषण प्लेटफर्म हो, जुन बायोमार्कर टेक्नोलोजीहरूमा समृद्ध अनुभवको आधारमा विकसित गरिएको हो। यो प्रयोग गर्न सजिलो प्लेटफर्मले केही आधारभूत प्यारामिटरहरू सेट गरेर एकीकृत विश्लेषण कार्यप्रवाहको द्रुत पेश गर्न अनुमति दिन्छ, जुन इल्युमिना प्लेटफर्म र BGI अनुक्रमण प्लेटफर्म दुवैबाट उत्पन्न DNA अनुक्रमण डेटाको लागि उपयुक्त हुन्छ। यो प्लेटफर्म उच्च प्रदर्शन कम्प्युटिङ सर्भरमा तैनाथ गरिएको छ, जसले धेरै सीमित समयमा अत्यधिक कुशल डेटा विश्लेषणलाई सशक्त बनाउँछ। उत्परिवर्तित जीन क्वेरी, PCR प्राइमर डिजाइन, आदि सहित मानक विश्लेषणको आधारमा व्यक्तिगत डेटा माइनिङ उपलब्ध छ।
-
mRNA(सन्दर्भ)
ट्रान्सक्रिप्टोम जीनोमिक आनुवंशिक जानकारी र जैविक कार्यको प्रोटियोम बीचको लिङ्क हो। ट्रान्सक्रिप्टल स्तर नियमन जीवहरूको सबैभन्दा महत्त्वपूर्ण र सबैभन्दा व्यापक रूपमा अध्ययन गरिएको नियमन मोड हो। ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमणले कुनै पनि समयमा वा कुनै पनि अवस्थामा ट्रान्सक्रिप्टोमलाई अनुक्रमण गर्न सक्छ, एकल न्यूक्लियोटाइडको लागि सही रिजोलुसनको साथ। यसले गतिशील रूपमा जीन ट्रान्सक्रिप्शनको स्तर प्रतिबिम्बित गर्न सक्छ, एकै साथ दुर्लभ र सामान्य ट्रान्सक्रिप्टहरू पहिचान र परिमाण गर्न सक्छ, र नमूना विशिष्ट ट्रान्सक्रिप्टहरूको संरचनात्मक जानकारी प्रदान गर्न सक्छ।
हाल, ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ प्रविधि कृषि विज्ञान, चिकित्सा र अन्य अनुसन्धान क्षेत्रहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ, जसमा पशु र वनस्पति विकास नियमन, वातावरणीय अनुकूलन, प्रतिरक्षा अन्तरक्रिया, जीन स्थानीयकरण, प्रजाति आनुवंशिक विकास र ट्युमर र आनुवंशिक रोग पत्ता लगाउने समावेश छ।
-
मेटाजेनोमिक्स (NGS)
यो विश्लेषण प्लेटफर्म वर्षौंको अनुभवको आधारमा शटगन मेटाजेनोमिक डेटा विश्लेषणको लागि डिजाइन गरिएको हो। यसमा डेटा प्रशोधन, प्रजाति-स्तर अध्ययन, जीन प्रकार्य-स्तर अध्ययन, मेटाजेनोम बिनिङ, आदि सहित सामान्य रूपमा आवश्यक पर्ने विभिन्न मेटाजेनोमिक्स विश्लेषणहरू समावेश गर्ने एकीकृत कार्यप्रवाह समावेश छ। थप रूपमा, अनुकूलित डेटा माइनिङ उपकरणहरू मानक विश्लेषण कार्यप्रवाहमा उपलब्ध छन्, जसमा जीन र प्रजाति क्वेरी, प्यारामिटर सेटिङ, व्यक्तिगत आंकडा उत्पादन, आदि समावेश छन्।
-
एलएनसीआरएनए
लामो नन-कोडिङ आरएनए (lncRNA) २०० एनटी भन्दा लामो लम्बाइ भएका ट्रान्सक्रिप्टहरूको एक प्रकार हो, जुन प्रोटीन कोड गर्न असमर्थ हुन्छन्। संचित प्रमाणहरूले सुझाव दिन्छ कि धेरैजसो lncRNA हरू कार्यात्मक हुने सम्भावना धेरै हुन्छ। उच्च-थ्रुपुट सिक्वेन्सिङ प्रविधिहरू र बायोइन्फर्मेटिक विश्लेषण उपकरणहरूले हामीलाई lncRNA अनुक्रमहरू र स्थिति जानकारीलाई अझ कुशलतापूर्वक प्रकट गर्न र महत्त्वपूर्ण नियामक कार्यहरू भएका lncRNA हरू पत्ता लगाउन नेतृत्व गर्न सशक्त बनाउँछन्। BMKCloud हाम्रा ग्राहकहरूलाई छिटो, भरपर्दो र लचिलो lncRNA विश्लेषण प्राप्त गर्न lncRNA अनुक्रमण विश्लेषण प्लेटफर्म प्रदान गर्न पाउँदा गर्व गर्दछ।
-
GWAS का थप वस्तुहरू
जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन (GWAS) ले विशिष्ट विशेषताहरू (फेनोटाइप) सँग सम्बन्धित आनुवंशिक भेरियन्टहरू (जीनोटाइप) पहिचान गर्ने लक्ष्य राख्छ। GWA अध्ययनहरूले ठूलो संख्यामा व्यक्तिहरूको सम्पूर्ण जीनोमलाई पार गर्ने आनुवंशिक मार्करहरूको अनुसन्धान गर्दछ र जनसंख्या स्तरमा तथ्याङ्कीय विश्लेषणद्वारा जीनोटाइप-फेनोटाइप एसोसिएशनहरूको भविष्यवाणी गर्दछ। सम्पूर्ण-जीनोम रिसेक्सेन्सिङले सम्भावित रूपमा सबै आनुवंशिक भेरियन्टहरू पत्ता लगाउन सक्छ। फेनोटाइपिक डेटासँग जोडेर, GWAS लाई फेनोटाइपसँग सम्बन्धित SNPs, QTLs र उम्मेदवार जीनहरू पहिचान गर्न प्रशोधन गर्न सकिन्छ, जसले आधुनिक जनावर/बिरुवा प्रजननलाई बलियो रूपमा समर्थन गर्दछ। SLAF एक स्व-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रमण रणनीति हो, जसले जीनोम-वाइड वितरित मार्करहरू, SNP पत्ता लगाउँछ। यी SNP हरू, आणविक आनुवंशिक मार्करहरूको रूपमा, लक्षित विशेषताहरूसँग सम्बन्धित जटिल विशेषताहरू पहिचान गर्न एक लागत-प्रभावी रणनीति हो।
-
नानोपोर पूर्ण-लम्बाइको ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स
जीवहरूमा जटिल र परिवर्तनशील वैकल्पिक आइसोफर्महरू जीन अभिव्यक्ति र प्रोटीन विविधतालाई नियमन गर्न महत्त्वपूर्ण आनुवंशिक संयन्त्रहरू हुन्। ट्रान्सक्रिप्ट संरचनाहरूको सही पहिचान जीन अभिव्यक्ति नियमन ढाँचाहरूको गहन अध्ययनको लागि आधार हो। नानोपोर अनुक्रमण प्लेटफर्मले ट्रान्सक्रिप्टोमिक अध्ययनलाई आइसोफर्म-स्तरमा सफलतापूर्वक ल्याएको छ। यो विश्लेषण प्लेटफर्म सन्दर्भ जीनोमको आधारमा नानोपोर प्लेटफर्ममा उत्पन्न आरएनए-सेक डेटा विश्लेषण गर्न डिजाइन गरिएको हो, जसले जीन स्तर र ट्रान्सक्रिप्ट स्तर दुवैमा गुणात्मक र मात्रात्मक विश्लेषणहरू प्राप्त गर्दछ।
-
सर्कल-आरएनए
गोलाकार आरएनए (सर्कलआरएनए) एक प्रकारको गैर-कोडिङ आरएनए हो, जुन हालै विकास, वातावरणीय प्रतिरोध, आदिमा संलग्न नियामक नेटवर्कहरूमा महत्त्वपूर्ण भूमिका खेल्ने पाइएको छ। रेखीय आरएनए अणुहरू, जस्तै mRNA, lncRNA बाट फरक, सर्कलआरएनएको 3′ र 5′ छेउहरू एकसाथ जोडिएका हुन्छन् जसले गोलाकार संरचना बनाउँछ, जसले तिनीहरूलाई एक्सोन्यूक्लिजको पाचनबाट बचाउँछ र धेरैजसो रेखीय आरएनए भन्दा बढी स्थिर हुन्छ। जीन अभिव्यक्तिलाई नियमन गर्न CircRNA मा विविध कार्यहरू भएको पाइएको छ। CircRNA ले ceRNA को रूपमा कार्य गर्न सक्छ, जसले miRNA लाई प्रतिस्पर्धात्मक रूपमा बाँध्छ, जसलाई miRNA स्पन्ज भनिन्छ। CircRNA अनुक्रमण विश्लेषण प्लेटफर्मले circRNA संरचना र अभिव्यक्ति विश्लेषण, लक्ष्य भविष्यवाणी र अन्य प्रकारका RNA अणुहरूसँग संयुक्त विश्लेषणलाई सशक्त बनाउँछ।
-
बीएसए
बल्क गरिएको सेग्रेगेन्ट विश्लेषण प्लेटफर्ममा एक-चरण मानक विश्लेषण र अनुकूलित प्यारामिटर सेटिङको साथ उन्नत विश्लेषण समावेश हुन्छ। BSA फेनोटाइपसँग सम्बन्धित आनुवंशिक मार्करहरू द्रुत रूपमा पहिचान गर्न प्रयोग गरिने प्रविधि हो। BSA को मुख्य कार्यप्रवाहमा समावेश छ: १. अत्यन्तै विपरीत फेनोटाइप भएका व्यक्तिहरूको दुई समूहहरू चयन गर्ने; २. DNA को दुई थोक बनाउन सबै व्यक्तिहरूको DNA, RNA वा SLAF-seq (बायोमार्करद्वारा विकसित) लाई एकत्रित गर्ने; ३. सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध वा बीचमा भिन्न अनुक्रमहरू पहिचान गर्ने, ४. ED र SNP-सूचकांक एल्गोरिथ्मद्वारा उम्मेदवारसँग जोडिएका क्षेत्रहरूको भविष्यवाणी गर्ने; ५. उम्मेदवार क्षेत्रहरूमा जीनहरूमा कार्यात्मक विश्लेषण र संवर्धन, आदि। आनुवंशिक मार्कर स्क्रिनिङ र प्राइमर डिजाइन सहित डेटामा थप उन्नत खनन पनि उपलब्ध छन्।
-
एम्पलिकन (१६एस/१८एस/आईटीएस)
एम्पलिकन (१६एस/१८एस/आईटीएस) प्लेटफर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषणमा वर्षौंको अनुभवको साथ विकसित गरिएको हो, जसमा मानकीकृत आधारभूत विश्लेषण र व्यक्तिगत विश्लेषण समावेश छ: आधारभूत विश्लेषणले हालको माइक्रोबियल अनुसन्धानको मुख्यधारा विश्लेषण सामग्रीलाई समेट्छ, विश्लेषण सामग्री समृद्ध र व्यापक छ, र विश्लेषण परिणामहरू परियोजना रिपोर्टहरूको रूपमा प्रस्तुत गरिन्छ; व्यक्तिगत विश्लेषणको सामग्री विविध छ। नमूनाहरू चयन गर्न सकिन्छ र व्यक्तिगत आवश्यकताहरू पूरा गर्न आधारभूत विश्लेषण रिपोर्ट र अनुसन्धान उद्देश्य अनुसार लचिलो रूपमा प्यारामिटरहरू सेट गर्न सकिन्छ। विन्डोज अपरेटिङ सिस्टम, सरल र छिटो।
