-
PacBio-पूर्ण-लम्बाइ 16S/18S/ITS एम्प्लिकन अनुक्रमण
Amplicon (16S/18S/ITS) प्लेटफर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषणमा वर्षौंको अनुभवको साथ विकसित गरिएको छ, जसमा मानकीकृत आधारभूत विश्लेषण र व्यक्तिगत विश्लेषण समावेश छ: आधारभूत विश्लेषणले वर्तमान माइक्रोबियल अनुसन्धानको मुख्यधारा विश्लेषण सामग्रीलाई समेट्छ, विश्लेषण सामग्री समृद्ध र व्यापक छ, र विश्लेषण परिणामहरू परियोजना रिपोर्टहरूको रूपमा प्रस्तुत गरिन्छ; व्यक्तिगत विश्लेषण को सामग्री विविध छ। नमूनाहरू चयन गर्न सकिन्छ र आधारभूत विश्लेषण रिपोर्ट र अनुसन्धान उद्देश्य अनुसार प्यारामिटरहरू लचिलो रूपमा सेट गर्न सकिन्छ, व्यक्तिगत आवश्यकताहरू महसुस गर्न। विन्डोज अपरेटिङ सिस्टम, सरल र छिटो।
-
PacBio-पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोम (गैर-संदर्भ)
प्यासिफिक बायोसाइन्सेस (PacBio) Isoform अनुक्रमण डेटा इनपुटको रूपमा लिएर, यो एपले पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्ट अनुक्रमहरू (असेंब्ली बिना) पहिचान गर्न सक्षम छ। सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध पूर्ण-लम्बाइ अनुक्रमहरू म्याप गरेर, ट्रान्सक्रिप्टहरू ज्ञात जीनहरू, ट्रान्सक्रिप्टहरू, कोडिङ क्षेत्रहरू, आदि द्वारा अनुकूलित गर्न सकिन्छ। यस अवस्थामा, वैकल्पिक स्प्लिसिङ, आदि जस्ता mRNA संरचनाहरूको थप सटीक पहिचान हासिल गर्न सकिन्छ। NGS ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमण डेटाको साथ संयुक्त विश्लेषणले ट्रान्सक्रिप्ट स्तरमा अभिव्यक्तिमा थप व्यापक एनोटेशन र अधिक सटीक मात्रालाई सक्षम बनाउँछ, जसले ठूलो मात्रामा डाउनस्ट्रीम विभेदक अभिव्यक्ति र कार्यात्मक विश्लेषणलाई फाइदा पुर्याउँछ।
-
टूलकिटहरू
BMKCloud जीनोमिक कार्यक्रमहरूको लागि एक-स्टप समाधान प्रदान गर्ने एक अग्रणी बायोइन्फर्मेटिक प्लेटफर्म हो, जुन चिकित्सा, कृषि, वातावरणीय, इत्यादि लगायत विभिन्न क्षेत्रका अनुसन्धानकर्ताहरूद्वारा व्यापक रूपमा विश्वास गरिन्छ। , कम्प्युटिङ स्रोतहरू, सार्वजनिक डाटाबेस, जैव सूचनात्मक अनलाइन पाठ्यक्रमहरू, आदि। BMKCloud सँग विभिन्न जीन एनोटेसन, इभोलुसनरी जेनेटिक टूल्स, एनसीआरएनए, डाटा क्वालिटी कन्ट्रोल, एसेम्बली, अलाइनमेन्ट, डाटा एक्स्ट्र्याक्सन, म्युटेसन, स्ट्याटिक्स, फिगर जेनेरेटर, सिक्वेन्स एनालिसिस, इत्यादि सहितको बारम्बार प्रयोग हुने जैव सूचनात्मक उपकरणहरू।
-
सानो आरएनए
साना RNA हरू miRNA, siRNA र piRNA सहित 18-30 nt को औसत लम्बाइ भएको छोटो गैर-कोडिङ RNA को प्रकार हुन्। यी साना आरएनएहरू विभिन्न जैविक प्रक्रियाहरू जस्तै mRNA डिग्रेडेसन, ट्रान्सलेसन इन्हिबिसन, हेटेरोक्रोमेटिन गठन, इत्यादिमा संलग्न रहेको रिपोर्ट गरिएको छ। सानो आरएनए अनुक्रमण विश्लेषण जनावर/बिरुवाको विकास, रोग, भाइरस, इत्यादिको अध्ययनमा व्यापक रूपमा लागू गरिएको छ। अनुक्रम विश्लेषण प्लेटफर्म मानक विश्लेषण र उन्नत डाटा खनन समावेश गर्दछ। RNA-seq डाटाको आधारमा, मानक विश्लेषणले miRNA पहिचान र भविष्यवाणी, miRNA लक्ष्य जीन भविष्यवाणी, एनोटेशन र अभिव्यक्ति विश्लेषण प्राप्त गर्न सक्छ। उन्नत विश्लेषणले अनुकूलित miRNA खोज र निकासी, Venn रेखाचित्र उत्पादन, miRNA र लक्ष्य जीन नेटवर्क निर्माण सक्षम गर्दछ।
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS एक सम्पूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण विश्लेषण प्लेटफर्म हो, जुन बायोमार्कर टेक्नोलोजीहरूमा समृद्ध अनुभवको आधारमा विकसित गरिएको हो। यो प्रयोग गर्न सजिलो प्लेटफर्मले केवल केही आधारभूत प्यारामिटरहरू सेट गरेर एकीकृत विश्लेषण कार्यप्रवाहको द्रुत पेश गर्न अनुमति दिन्छ, जुन इलुमिना प्लेटफर्म र BGI अनुक्रमणिका प्लेटफर्म दुवैबाट उत्पन्न DNA अनुक्रमण डेटाका लागि फिट हुन्छ। यो प्लेटफर्म उच्च प्रदर्शन कम्प्युटिङ सर्भरमा तैनात गरिएको छ, जसले धेरै सीमित समयमा अत्यधिक कुशल डेटा विश्लेषणलाई सशक्त बनाउँछ। पर्सनलाइज्ड डाटा माइनिङ मानक विश्लेषणको आधारमा उपलब्ध छ, जसमा उत्परिवर्तित जीन क्वेरी, PCR प्राइमर डिजाइन, आदि समावेश छ।
-
mRNA (सन्दर्भ)
ट्रान्सक्रिप्टोम जीनोमिक आनुवंशिक जानकारी र जैविक प्रकार्यको प्रोटोम बीचको लिङ्क हो। ट्रान्सक्रिप्शनल स्तर नियमन जीवहरूको सबैभन्दा महत्त्वपूर्ण र सबैभन्दा व्यापक रूपमा अध्ययन गरिएको नियमन मोड हो। ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रमणले ट्रान्सक्रिप्टोमलाई कुनै पनि समयमा वा कुनै पनि अवस्थामा, एकल न्यूक्लियोटाइडमा सही रिजोल्युसनको साथ अनुक्रम गर्न सक्छ। यसले जीन ट्रान्सक्रिप्शनको स्तरलाई गतिशील रूपमा प्रतिबिम्बित गर्न सक्छ, एकै साथ दुर्लभ र सामान्य ट्रान्सक्रिप्टहरू पहिचान गर्न र मात्रा निर्धारण गर्न सक्छ, र संरचनात्मक जानकारी प्रदान गर्दछ। नमूना विशिष्ट ट्रान्सक्रिप्टहरू।
वर्तमानमा, ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजी कृषि विज्ञान, चिकित्सा र अन्य अनुसन्धान क्षेत्रहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ, जसमा पशु र वनस्पति विकास नियमन, वातावरणीय अनुकूलन, प्रतिरक्षा अन्तरक्रिया, जीन स्थानीयकरण, प्रजाति आनुवंशिक विकास र ट्युमर र आनुवंशिक रोग पत्ता लगाउने।
-
Metagenomics (NGS)
यो विश्लेषण प्लेटफर्म वर्षौंको अनुभवको आधारमा शटगन मेटाजेनोमिक डेटा विश्लेषणको लागि डिजाइन गरिएको हो। यसमा डेटा प्रशोधन, प्रजाति-स्तर अध्ययन, जीन प्रकार्य-स्तर अध्ययन, मेटाजेनोम बिनिङ, इत्यादि सहित विभिन्न सामान्य रूपमा आवश्यक मेटाजेनोमिक्स विश्लेषणहरू समावेश गरी एकीकृत कार्यप्रवाह समावेश हुन्छ। साथै, जीन र प्रजाति क्वेरी सहित मानक विश्लेषण कार्यप्रवाहमा अनुकूलित डाटा माइनिङ उपकरणहरू उपलब्ध छन्। , प्यारामिटर सेटिङ, व्यक्तिगत फिगर उत्पादन, आदि।
-
LncRNA
लामो गैर-कोडिङ RNAs (lncRNA) 200 nt भन्दा लामो लम्बाइ भएको ट्रान्सक्रिप्टहरूको एक प्रकार हो, जसले प्रोटिनहरू कोड गर्न असमर्थ हुन्छन्। संचयी प्रमाणहरूले सुझाव दिन्छ कि धेरै जसो lncRNAs कार्यात्मक हुने सम्भावना छ। हाई-थ्रुपुट सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजीहरू र बायोइन्फर्मेटिक विश्लेषण उपकरणहरूले हामीलाई lncRNA अनुक्रमहरू र स्थिति जानकारी अझ प्रभावकारी रूपमा प्रकट गर्न र महत्त्वपूर्ण नियामक कार्यहरू सहित lncRNAs पत्ता लगाउन नेतृत्व गर्दछ। BMKCloud हाम्रा ग्राहकहरूलाई छिटो, भरपर्दो र लचिलो lncRNA विश्लेषण प्राप्त गर्नको लागि lncRNA अनुक्रम विश्लेषण प्लेटफर्म प्रदान गर्न पाउँदा गर्व छ।
-
GWAS
जीनोम-वाइड एसोसिएशन स्टडी (GWAS) को उद्देश्य आनुवंशिक भिन्नताहरू (जीनोटाइप) पहिचान गर्नु हो जुन विशिष्ट विशेषताहरू (फेनोटाइप) सँग सम्बन्धित छ। GWA अध्ययनहरूले आनुवंशिक मार्करहरूले ठूलो संख्यामा व्यक्तिहरूको सम्पूर्ण जीनोम पार गर्दछ र जनसंख्या स्तरमा सांख्यिकीय विश्लेषणद्वारा जीनोटाइप-फेनोटाइप संघहरूको भविष्यवाणी गर्दछ। सम्पूर्ण-जीनोम रिस्वेन्सिङले सम्भावित रूपमा सबै आनुवंशिक भिन्नताहरू पत्ता लगाउन सक्छ। फेनोटाइपिक डेटाको साथ युग्मन, GWAS लाई फेनोटाइप सम्बन्धित SNPs, QTLs र उम्मेद्वार जीनहरू पहिचान गर्न प्रशोधन गर्न सकिन्छ, जसले आधुनिक जनावर/बिरुवा प्रजननलाई कडा रूपमा ब्याकअप गर्दछ। SLAF एक आत्म-विकसित सरलीकृत जीनोम अनुक्रमण रणनीति हो, जसले जीनोम-व्यापी वितरित मार्करहरू, SNP पत्ता लगाउँदछ। यी SNPs, आणविक आनुवंशिक मार्करहरूको रूपमा, लक्षित लक्षणहरूसँग एसोसिएशन अध्ययनहरूको लागि प्रशोधन गर्न सकिन्छ। यो जटिल विशेषताहरु सम्बन्धित आनुवंशिक भिन्नताहरु को पहिचान मा एक लागत प्रभावी रणनीति हो।
-
नानोपोर पूर्ण-लम्बाइ ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स
जीवहरूमा जटिल र चर वैकल्पिक आइसोफर्महरू जीन अभिव्यक्ति र प्रोटीन विविधतालाई विनियमित गर्नका लागि महत्त्वपूर्ण आनुवंशिक संयन्त्रहरू हुन्। ट्रान्सक्रिप्ट संरचनाहरूको सही पहिचान जीन अभिव्यक्ति नियमन ढाँचाहरूको गहिरो अध्ययनको लागि आधार हो। नानोपोर सिक्वेन्सिङ प्लेटफर्मले ट्रान्सक्रिप्टोमिक अध्ययनलाई आइसोफर्म-स्तरमा सफलतापूर्वक ल्याएको छ। यो विश्लेषण प्लेटफर्म नानोपोर प्लेटफर्ममा उत्पन्न भएको RNA-Seq डाटालाई सन्दर्भ जीनोमको आधारमा विश्लेषण गर्न डिजाइन गरिएको हो, जसले जीन स्तर र ट्रान्सक्रिप्ट स्तर दुवैमा गुणात्मक र मात्रात्मक विश्लेषणहरू प्राप्त गर्दछ।
-
सर्कल-आरएनए
सर्कुलर आरएनए (circRNA) एक प्रकारको गैर-कोडिङ आरएनए हो, जुन हालसालै विकास, वातावरणीय प्रतिरोध, इत्यादिमा संलग्न नियामक सञ्जालहरूमा महत्त्वपूर्ण भूमिका खेल्न पाइएको छ। रैखिक आरएनए अणुहरू, जस्तै mRNA, lncRNA, 3′ र 5′ भन्दा भिन्न। circRNA को छेउहरू एकसाथ जोडेर गोलाकार संरचना बनाइन्छ, जसले तिनीहरूलाई पाचन हुनबाट बचाउँछ exonuclease र रैखिक आरएनए भन्दा धेरै स्थिर छन्। CircRNA ले जीन अभिव्यक्ति विनियमित गर्न विभिन्न प्रकार्यहरू फेला पारेको छ। CircRNA ले ceRNA को रूपमा प्रदर्शन गर्न सक्छ, जसले miRNA लाई प्रतिस्पर्धात्मक रूपमा बाँध्छ, जसलाई miRNA स्पन्ज भनिन्छ। CircRNA अनुक्रम विश्लेषण प्लेटफर्मले circRNA संरचना र अभिव्यक्ति विश्लेषण, लक्ष्य भविष्यवाणी र अन्य प्रकारका आरएनए अणुहरूसँग संयुक्त विश्लेषणलाई सशक्त बनाउँछ।
-
BSA
बल्केड सेग्रेगेन्ट विश्लेषण प्लेटफर्मले अनुकूलित प्यारामिटर सेटिङको साथ एक-चरण मानक विश्लेषण र उन्नत विश्लेषण समावेश गर्दछ। BSA एक प्रविधि हो जुन फिनोटाइप सम्बन्धित आनुवंशिक मार्करहरू छिटो पहिचान गर्न प्रयोग गरिन्छ। BSA को मुख्य कार्यप्रवाहले निम्न समावेश गर्दछ: 1. अत्यधिक विरोधी फेनोटाइपहरू भएका व्यक्तिहरूको दुई समूहहरू चयन गर्दै; 2. DNA को दुई थोक बनाउन सबै व्यक्तिहरूको DNA, RNA वा SLAF-seq (बायोमार्करद्वारा विकसित) जम्मा गर्दै; 3. सन्दर्भ जीनोम विरुद्ध वा बीचमा भिन्नता अनुक्रमहरू पहिचान गर्दै, 4. ED र SNP-सूचकांक एल्गोरिथ्म द्वारा उम्मेदवार लिङ्क गरिएका क्षेत्रहरूको भविष्यवाणी गर्दै; 5. उम्मेदवार क्षेत्रहरूमा जीनहरूमा कार्यात्मक विश्लेषण र संवर्धन, आदि। आनुवंशिक मार्कर स्क्रीनिंग र प्राइमर डिजाइन सहित डेटामा थप उन्नत खनन पनि उपलब्ध छन्।
-
एम्प्लिकन (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) प्लेटफर्म माइक्रोबियल विविधता परियोजना विश्लेषणमा वर्षौंको अनुभवको साथ विकसित गरिएको छ, जसमा मानकीकृत आधारभूत विश्लेषण र व्यक्तिगत विश्लेषण समावेश छ: आधारभूत विश्लेषणले वर्तमान माइक्रोबियल अनुसन्धानको मुख्यधारा विश्लेषण सामग्रीलाई समेट्छ, विश्लेषण सामग्री समृद्ध र व्यापक छ, र विश्लेषण परिणामहरू परियोजना रिपोर्टहरूको रूपमा प्रस्तुत गरिन्छ; व्यक्तिगत विश्लेषण को सामग्री विविध छ। नमूनाहरू चयन गर्न सकिन्छ र आधारभूत विश्लेषण रिपोर्ट र अनुसन्धान उद्देश्य अनुसार प्यारामिटरहरू लचिलो रूपमा सेट गर्न सकिन्छ, व्यक्तिगत आवश्यकताहरू महसुस गर्न। विन्डोज अपरेटिङ सिस्टम, सरल र छिटो।
