प्रोकारियोटिक आरएनए अनुक्रमण
विशेषताहरू
● आरएनए नमूना प्रशोधनमा आरआरएनएको कमी समावेश थियो र त्यसपछि दिशात्मक आरएनए पुस्तकालय तयारी गरियो।
● सन्दर्भ जीनोममा पङ्क्तिबद्धताको आधारमा जैविक सूचनात्मक विश्लेषण
● विश्लेषणमा जीन अभिव्यक्ति र DEG हरू समावेश छन् तर ट्रान्सक्रिप्ट संरचना र sRNA विश्लेषण पनि समावेश छ।
सेवाका फाइदाहरू
●कडा गुणस्तर नियन्त्रण: हामी नमूना र पुस्तकालय तयारीदेखि अनुक्रमण र जैव सूचना विज्ञानसम्म सबै चरणहरूमा कोर नियन्त्रण बिन्दुहरू लागू गर्छौं। यो सावधानीपूर्वक अनुगमनले निरन्तर उच्च-गुणस्तरको परिणामहरूको वितरण सुनिश्चित गर्दछ।
●स्ट्र्यान्ड-विशिष्ट अनुक्रम डेटा: आरएनए पुस्तकालय तयारी दिशात्मक भएकोले, एन्टी-सेन्स ट्रान्सक्रिप्टहरूको पहिचान सक्षम पार्दै।
●प्रोकारियोटिक ट्रान्सक्रिप्टोम्स अनुरूप पूर्ण विश्लेषण: बायोइन्फर्मेटिक पाइपलाइनमा जीन अभिव्यक्तिको विश्लेषण मात्र नभई ट्रान्सक्रिप्ट संरचनाको विश्लेषण पनि समावेश छ, जसमा ओपेरोन, UTR र प्रमोटरहरूको पहिचान समावेश छ। यसमा sRNA हरूको विश्लेषण पनि समावेश छ, अर्थात् माध्यमिक संरचना र लक्ष्यहरूको एनोटेसन र भविष्यवाणी।
●बिक्री पछिको समर्थन: हाम्रो प्रतिबद्धता परियोजना पूरा हुनुभन्दा बाहिर ३ महिनाको बिक्री पछिको सेवा अवधिको साथ विस्तारित छ। यस समयमा, हामी परिणामहरूसँग सम्बन्धित कुनै पनि प्रश्नहरूलाई सम्बोधन गर्न परियोजना अनुगमन, समस्या निवारण सहायता, र प्रश्नोत्तर सत्रहरू प्रदान गर्दछौं।
नमूना आवश्यकताहरू र डेलिभरी
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा | गुणस्तर नियन्त्रण |
| rRNA ले दिशात्मक पुस्तकालय घटायो | इलुमिना PE150 | १-२ जीबी | Q30≥85% |
नमूना आवश्यकताहरू:
| संक्षेप (ng/μl) | मात्रा (μg) | शुद्धता | निष्ठा |
| ≥ ५० | ≥ १ | OD260/280=1.8-2.0 को कीवर्डहरू OD260/230=1.0-2.5 को कीवर्डहरू जेलमा सीमित वा कुनै प्रोटिन वा डीएनए प्रदूषण देखाइएको छैन। | RIN≥६.५ |
सिफारिस गरिएको नमुना डेलिभरी
कन्टेनर: २ मिलिलिटर सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (टिन पन्नी सिफारिस गरिँदैन)
नमुना लेबलिङ: समूह+प्रतिकृति जस्तै A1, A2, A3; B1, B2, B3।
ढुवानी:
१. सुख्खा बरफ: नमूनाहरूलाई झोलामा प्याक गर्नुपर्छ र सुख्खा बरफमा गाड्नुपर्छ।
२. आरएनए स्थिर ट्यूबहरू: आरएनए नमूनाहरू आरएनए स्थिरीकरण ट्यूब (जस्तै आरएनए स्थिर®) मा सुकाउन सकिन्छ र कोठाको तापक्रममा पठाउन सकिन्छ।
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
जैविक सूचना विश्लेषण कार्यप्रवाह
निम्न विश्लेषण समावेश गर्दछ:
● कच्चा डेटा गुणस्तर नियन्त्रण
● सन्दर्भ जीनोममा पङ्क्तिबद्धता
● पुस्तकालय गुणस्तर मूल्याङ्कन: आरएनए खण्डन अनियमितता, सम्मिलित आकार र अनुक्रम संतृप्ति
● भविष्यवाणी गरिएको कोडिङ जीनको कार्यात्मक एनोटेसन
● अभिव्यक्ति विश्लेषण: सहसम्बन्ध र प्रमुख घटक विश्लेषण (PCA)
● भिन्न जीन अभिव्यक्ति (DEGs)
● DEG हरूको कार्यात्मक एनोटेसन र संवर्धन
● sRNA विश्लेषण: भविष्यवाणी, एनोटेसन, लक्ष्य, र माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी
● ट्रान्सक्रिप्ट संरचना विश्लेषण: ओपेरोन, सुरुवात र अन्त्य स्थितिहरू, अनुवाद नगरिएको क्षेत्र (UTS), प्रमोटर, र SNP/InDel विश्लेषण
अनुक्रमण संतृप्ति
कोडिङ जीनको कार्यात्मक एनोटेसन
नमूनाहरू बीचको सहसम्बन्ध
भिन्नता व्यक्त जीन (DEGs) विश्लेषण
कार्यात्मक संवर्धन विश्लेषण
sRNA एनोटेसन
यस विशेष प्रकाशनमा BMKGene को Nanopore पूर्ण-लम्बाइको mRNA अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा सहजीकरण गरिएका प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
गुआन, सीपी एट अल। (२०१८) 'सोफोरिया एलोपेक्युरोइड्सको कुल अल्कालोइडहरूलाई प्रतिक्रिया दिने बायोफिल्म-फर्मिङ स्टेफिलोकोकस एपिडर्मिडिसको विश्वव्यापी ट्रान्सक्रिप्टोम परिवर्तनहरू',पोलिश जर्नल अफ माइक्रोबायोलोजी, ६७(२), पृ। 223. doi: 10.21307/PJM-2018-024।
