कम प्रतिनिधित्व बिसल्फाइट अनुक्रमण (RRBS)
कम प्रतिनिधित्व बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (RRBS) MspI क्लीभेजद्वारा CpG टापु-समृद्ध क्षेत्रहरूको संवर्धनमा निर्भर गर्दछ र त्यसपछि २००-५००/६०० bps टुक्राहरूको आकार चयन गरिन्छ। फलस्वरूप, CpG टापुहरूको नजिकका क्षेत्रहरू मात्र अनुक्रमित हुन्छन्, जबकि टाढाको CpG टापुहरू भएका क्षेत्रहरूलाई विश्लेषणबाट बहिष्कृत गरिन्छ। यो प्रक्रिया, बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङसँग मिलेर, DNA मिथाइलेशनको उच्च-रिजोल्युसन पत्ता लगाउन अनुमति दिन्छ, र अनुक्रमण दृष्टिकोण, PE150, विशेष गरी मध्यको सट्टा इन्सर्ट्सको छेउमा केन्द्रित हुन्छ, जसले मिथाइलेशन प्रोफाइलिङको दक्षता बढाउँछ।
यो प्रविधि डीएनए मिथाइलेशन अनुसन्धानमा होल जीनोम बिसल्फाइट सिक्वेन्सिङ (WGBS) को लागत-प्रभावी र कुशल विकल्पको रूपमा देखा परेको छ। WGBS ले एकल आधार रिजोलुसनमा सम्पूर्ण जीनोमको जाँच गरेर व्यापक अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ, यसको उच्च लागत एक सीमित कारक हुन सक्छ, जुन RRBS ले जीनोमको प्रतिनिधि भागलाई छनौट गरेर यो चुनौतीलाई रणनीतिक रूपमा कम गर्दछ। यो पद्धति एक अमूल्य उपकरण हो जसले लागत-प्रभावी DNA मिथाइलेशन अनुसन्धानलाई सक्षम बनाउँछ र एपिजेनेटिक संयन्त्रहरूको ज्ञानलाई अगाडि बढाउँछ।
सेवा सुविधाहरू
● इलुमिना नोभासेकमा अनुक्रमण।
● सन्दर्भ जीनोम आवश्यक पर्दछ।
● ल्याम्ब्डा डीएनए बिसल्फाइट रूपान्तरण दक्षता निगरानी गर्न प्रयोग गरिन्छ।
● MspI पाचन दक्षताको पनि निगरानी गरिन्छ।
● बिरुवाको नमूनाको लागि दोहोरो इन्जाइम पाचन।
सेवाका फाइदाहरू
●WGBS को लागत-प्रभावी र कुशल विकल्प: यसले कम लागतमा र कम नमूना आवश्यकताहरूसँग विश्लेषण गर्न सक्षम बनाउँछ।
●पूरा प्लेटफर्म:हामी नमूना प्रशोधन, पुस्तकालय निर्माण, र अनुक्रमणदेखि जैव सूचना विज्ञान विश्लेषणसम्म एक-स्टप उत्कृष्ट सेवा प्रदान गर्दछौं।
●व्यापक विशेषज्ञता: हामीले विभिन्न प्रजातिहरूमा सफलता पाएका छौं। BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछिको समर्थन ल्याउँछ।
सेवा निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा आउटपुट | गुणस्तर नियन्त्रण |
| MspI पचाइएको र बिसल्फाइट उपचार गरिएको पुस्तकालय | इलुमिना PE150 | ८ जिबी | Q30 ≥ ८५% बिसल्फाइट रूपान्तरण > ९९% MspI काट्ने दक्षता > ९५% |
नमूना आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल मात्रा (µg) |
| |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ ३० | ≥ १ | सीमित क्षय वा प्रदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू
BI विश्लेषणमा समावेश छन्:
● कच्चा अनुक्रमण गुणस्तर नियन्त्रण;
● सन्दर्भ जीनोममा नक्साङ्कन गर्ने;
● ५mC मिथाइलेटेड आधारहरूको पहिचान र मोटिफ पहिचान;
● मिथाइलेशन वितरण र नमूना तुलनाको विश्लेषण;
● भिन्नतापूर्वक मिथाइल गरिएको क्षेत्र (DMRs) को विश्लेषण;
● DMR सँग सम्बन्धित जीनहरूको कार्यात्मक एनोटेसन।
गुणस्तर नियन्त्रण: पाचन दक्षता (जीनोम म्यापिङमा)
गुणस्तर नियन्त्रण: बिसल्फाइट रूपान्तरण (मिथाइलेशन जानकारी निकासीमा)
मिथाइलेशन नक्सा: ५ मिलिसेन्स मिथाइलेशन जीनोम-व्यापी वितरण
नमुना तुलना: प्रमुख घटक विश्लेषण
डिफरेंशियली मिथाइलेटेड रिजन (DMRs) विश्लेषण: हिटम्याप
BMKGene को सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत सहजीकरण गरिएको अनुसन्धान प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
Li, Z. et al. (२०२२) 'CRISPR सक्रियता र प्याराक्राइन कारकहरूद्वारा लेडिग-जस्तो कोषहरूमा उच्च-विश्वास पुन: प्रोग्रामिंग',PNAS नेक्सस, १(४)। doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179।
टियान, एच. एट अल. (२०२३) 'चिनियाँ मोनोजाइगोटिक जुम्ल्याहाहरूमा शरीर संरचनाको जीनोम-वाइड डीएनए मिथाइलेशन विश्लेषण',युरोपेली जर्नल अफ क्लिनिकल इन्भेस्टिगेशन, 53(11), p। e14055। doi: 10.1111/ECI.14055।
Wu, Y. et al. (२०२२) 'DNA मिथाइलेशन र कम्मर-देखि-किम अनुपात: चिनियाँ मोनोजाइगोटिक जुम्ल्याहाहरूमा एपिजेनोम-व्यापी एसोसिएशन अध्ययन',जर्नल अफ एन्डोक्राइनोलोजिकल इन्भेस्टिगेसन, ४५(१२), पृष्ठ २३६५–२३७६। doi: 10.1007/S40618-022-01878-4।
