सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट सिक्वेन्सिंग (WGBS)
यो प्रविधि, डिएनएको बिसल्फाइट उपचारमा आधारित छ जसले मिथाइलेटेड साइटोसिनहरूलाई युरासिल (C देखि U) मा रूपान्तरण गर्न प्रेरित गर्दछ, जबकि मिथाइलेटेड साइटोसिनहरूलाई अपरिवर्तित छोड्छ, डीएनए मिथाइलेसनको गहन अन्वेषणको लागि सुनौलो-मानक विधिको रूपमा खडा हुन्छ, विशेष गरी साइटोसिन (5-mC) मा पाँचौं स्थान, जीन अभिव्यक्ति र सेलुलर गतिविधिको एक प्रमुख नियामक।
यो प्रविधिले एकल-आधार रिजोल्युसन प्रदान गर्दछ, जसले अनुसन्धानकर्ताहरूलाई मिथाइलमको व्यापक रूपमा अनुसन्धान गर्न र नमूनाहरू भित्र असामान्य मिथाइलेशन ढाँचाहरू पत्ता लगाउन अनुमति दिन्छ। WGBS प्रयोग गरेर, वैज्ञानिकहरूले जीनोम-व्यापी मिथाइलेशन परिदृश्यहरूमा अतुलनीय अन्तर्दृष्टि प्राप्त गर्न सक्छन्, जसले विविध जैविक प्रक्रियाहरू र रोगहरूलाई निहित गर्ने एपिजेनेटिक संयन्त्रहरूको सूक्ष्म बुझाइ प्रदान गर्दछ।
सेवा सुविधाहरू
● इलुमिना नोभासेकमा अनुक्रमण।
● सन्दर्भ जीनोम आवश्यक पर्दछ।
● बिसल्फाइट रूपान्तरण दक्षता निगरानी गर्न ल्याम्ब्डा डीएनए थपिएको छ।
सेवाका फाइदाहरू
●डीएनए मिथाइलेशन अनुसन्धानको लागि स्वर्ण मानक: यो परिपक्व प्रविधिमा उच्च शुद्धता र राम्रो प्रजनन क्षमता छ।
●फराकिलो कभरेज र एकल-आधार रिजोल्युसन:मिथाइलेशन साइटहरूको पहिचान जीनोम-व्यापी स्तरमा हुन्छ।
●पूरा प्लेटफर्म:हामी नमूना प्रशोधन, पुस्तकालय निर्माण, अनुक्रमणदेखि जैविक सूचना विज्ञान विश्लेषणसम्म एक-स्टप सेवा प्रदान गर्दछौं।
●व्यापक विशेषज्ञता: हामीसँग विभिन्न प्रजातिहरूमा सम्पन्न परियोजनाहरूको विस्तृत दायरा छ। BMKGENE ले एक दशक भन्दा बढीको अनुभव, उच्च कुशल विश्लेषण टोली, व्यापक सामग्री, र उत्कृष्ट बिक्री पछिको समर्थन ल्याउँछ।
●ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स विश्लेषणमा सामेल हुने सम्भावना: RNA-seq जस्ता अन्य ओमिक्स डेटासँग WGBS को एकीकृत विश्लेषणको लागि अनुमति दिँदै।
नमूना निर्दिष्टीकरणहरू
| पुस्तकालय | अनुक्रम रणनीति | सिफारिस गरिएको डेटा आउटपुट | गुणस्तर नियन्त्रण |
| बिसल्फाइट उपचार गरियो | इलुमिना PE150 | ३० गुणा गहिराइ | Q30 ≥ ८५% बिसल्फाइट रूपान्तरण > ९९% |
नमूना आवश्यकताहरू
| एकाग्रता (ng/µL) | कुल मात्रा (µg) | थप आवश्यकताहरू | |
| जीनोमिक डीएनए | ≥ ५ | ≥ ४०० नगद | सीमित क्षय वा प्रदूषण |
सेवा कार्य प्रवाह
नमुना डेलिभरी
डीएनए निकासी
पुस्तकालय निर्माण
अनुक्रमण
तथ्याङ्क विश्लेषण
डेटा डेलिभरी
सेवामा निम्न विश्लेषण समावेश छन्:
● कच्चा अनुक्रमण गुणस्तर नियन्त्रण;
● सन्दर्भ जीनोममा नक्साङ्कन गर्ने;
● ५mC मिथाइलयुक्त आधारहरूको पहिचान;
● मिथाइलेशन वितरण र एनोटेसनको विश्लेषण;
● भिन्नतापूर्वक मिथाइल गरिएको क्षेत्र (DMRs) को विश्लेषण;
● DMR सँग सम्बन्धित जीनहरूको कार्यात्मक एनोटेसन।
५mC मिथाइलेशन पत्ता लगाउने: मिथाइलेटेड साइटहरूको प्रकार
मिथाइलेशन नक्सा। ५ मिलिसेन्स मिथाइलेशन जीनोम-व्यापी वितरण
अत्यधिक मिथाइलयुक्त क्षेत्रहरूको एनोटेसन
भिन्न मिथाइलेटेड क्षेत्रहरू: सम्बन्धित जीनहरू
भिन्नतापूर्वक मिथाइलेटेड क्षेत्रहरू: सम्बन्धित जीनहरूको एनोटेसन (जीन ओन्टोलोजी)
BMKGene को सम्पूर्ण जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण सेवाहरूद्वारा प्रकाशनहरूको क्युरेट गरिएको संग्रह मार्फत सहजीकरण गरिएको अनुसन्धान प्रगतिहरूको अन्वेषण गर्नुहोस्।
फ्यान, वाई. एट अल. (२०२०) 'पूर्ण-जीनोम बिसल्फाइट अनुक्रमण प्रयोग गरेर भेडाको कंकाल मांसपेशी विकासको क्रममा डीएनए मिथाइलेशन प्रोफाइलहरूको विश्लेषण',बीएमसी जीनोमिक्स, 21(1), पृ. 1-15। doi: 10.1186/S12864-020-6751-5।
झाओ, एक्स. एट अल. (२०२२) 'भिनाइल क्लोराइडको सम्पर्कमा आउने कामदारहरूमा नोभेल डिअक्सिराइबोन्यूक्लिक एसिड मिथाइलेशन गडबडी',विष विज्ञान र औद्योगिक स्वास्थ्य, ३८(७), पृष्ठ ३७७–३८८। doi: 10.1177/07482337221098600
जुओ, जे. एट अल. (२०२०) 'पाक्ने गोलभेडाको फलमा जीनोम मिथाइलेशन, नन-कोडिङ आरएनए, एमआरएनए र मेटाबोलाइट्सको स्तर बीचको सम्बन्ध',द प्लान्ट जर्नल, 103(3), पृ. 980-994। doi: 10.1111/TPJ.14778।
