Bacteriële en schimmel hele genoom requencing
Bacteriële en schimmelrequencing-projecten voor gehele genoom zijn cruciaal voor het bevorderen van microbiële genomics door de voltooiing en vergelijking van microbiële genomen mogelijk te maken. Dit vergemakkelijkt fermentatie -engineering, de optimalisatie van industriële processen en de verkenning van secundaire metabolisme -routes. Bovendien is schimmel- en bacteriële re-sequencing cruciaal voor het begrijpen van milieu-aanpassing, het optimaliseren van stammen en het onthullen van genetische evolutiedynamiek, met brede implicaties in geneeskunde, landbouw en milieuwetenschappen.
Servicevoordelen
●Bioinformatische analyse omvat variantaanroepen:Het bieden van functionele inzichten in de heropdracht genomen.
● Uitgebreide expertise: Met duizenden microbiële requencing-projecten die jaarlijks worden uitgevoerd, brengen we een decennium ervaring, een zeer bekwaam analyseteam, uitgebreide inhoud en uitstekende post-sales-ondersteuning.
●Post-sales ondersteuning:Onze toewijding gaat verder dan de voltooiing van het project met een serviceperiode van 3 maanden na verkoop. Gedurende deze tijd bieden we projecten follow-up, hulp bij het oplossen van problemen en Q & A-sessies om alle vragen met betrekking tot de resultaten aan te pakken.
Servicespecificaties
| Sequencing platform | Sequencing -strategie | Gegevens aanbevolen | Kwaliteitscontrole |
| Illumina novaseq | PE150 | Diepte van 100x | Q30 ≥85% |
Voorbeeldvereisten
| Concentratie (ng/µl) | Totaal bedrag (NG) | Volume (µl) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bacteriën: ≥1x107 cellen
Uncellulaire schimmels: ≥5x106-1x107 cellen
Macro -schimmels: ≥4g
Service -werkstroom
Voorbeeldafgifte
Bibliotheekconstructie
Volgorde
Gegevensanalyse
After-Sale Services
Bevat de volgende analyse:
- Sequencing Data Quality Control
- Afstemming op het referentiegenoom
- Variantaanroepen: SNP en INDEL
- Variant annotatie
Variantaanroepen: SNP -typen
Variantaanroepen: indellengteverdeling
Ontdek de vooruitgang die wordt gefaciliteerd door BMKgene's Microbial Genome Requencing Services via een samengestelde verzameling publicaties.
Jia, Y. et al. (2023) 'Het combineren van transcriptoom en hele genoom requencing om ziektebestendigheidsgenen te screenen voor tarwe dwerg bunt',International Journal of Molecular Sciences, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicilline-gecontroleerd glucosemetabolisme manipuleert de overgang van tolerantie naar resistentie in bacteriën',De wetenschap vordert, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina Halalkaliphila sp. nov., Een haloalkaliphilische bacterie geïsoleerd uit een frisdrankmeer in de autonome regio van de binnenolie, China ', int. J. Syst. Evol.Microbiol, 72, p. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. en Wang, G.-H. (2024) 'Genoomsequentie van Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, geïsoleerd uit Nasonia vitripennis',Aankondigingen van microbiologie resource. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
