Illumina kant-en-klare bibliotheken
Functies
●Platformen:Illumina NovaSeq 6000 en NovaSeq X Plus
●Sequentiemodi:PE150 en PE250
●Kwaliteitscontrole van bibliotheken vóór sequencing
●Sequentiegegevens QC en levering:levering van QC-rapport en onbewerkte gegevens in fastq-formaat na demultiplexing en filtering van Q30-lezingen
Servicevoordelen
●Veelzijdigheid van sequencing-services:de klant kan ervoor kiezen om te sorteren op rijstrook, stroomcel of op basis van de vereiste hoeveelheid gegevens (gedeeltelijke rijstrooksequencing).
●Uitgebreide ervaring met het Illumina-sequencingplatform:met duizenden gesloten projecten met verschillende soorten.
●Levering van het QC-rapport voor sequencing:met kwaliteitsstatistieken, gegevensnauwkeurigheid en algehele prestaties van het sequencingproject.
●Volwassen sequencingproces:met een korte doorlooptijd.
●Strenge kwaliteitscontrole: wij hanteren strikte QC-eisen om de levering van resultaten van consistent hoge kwaliteit te garanderen.
Voorbeeldplatforms
| Platform | Stroomcel | Sequencing-modus | Eenheid | Geschatte productie |
| NovaSeq X | 10B (8 rijstroken) | PE150 | Enkele rijstrook Gedeeltelijke steeg | 375Gb/baan |
| 25B (8 rijstroken) | PE150 | Enkele rijstrook Gedeeltelijke steeg | 1000 Gb/baan | |
| NovaSeq 6000 | SP Flowcel (2 rijstroken) | PE250 | Stroomcel Enkele rijstrook Gedeeltelijke steeg | 325-400 M leest / Lane |
| S4 Flowcel (4 rijstroken) | PE150 | Stroomcel Enkele rijstrook Gedeeltelijke steeg | ~800 Gb/baan |
Voorbeeldvereisten
| Gegevenshoeveelheid (X) | Concentratie (qPCR/nM) | Volume | |
| Gedeeltelijke rijstrookvolgorde
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 GB < X ≤ 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 GB | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Rijstrookvolgorde | Per laan | ≥ 1,5 nM / Bibliotheekpool | ≥ 25 μl / bibliotheekpool |
Naast concentratie en totale hoeveelheid is ook een geschikt piekpatroon vereist.
Opmerking: Lane-sequencing van bibliotheken met lage diversiteit vereist PhiX-spike-in om robuuste basisaanroepen te garanderen.
We raden u aan vooraf samengevoegde bibliotheken als voorbeelden in te dienen. Als u BMKGENE nodig heeft om bibliotheekpooling uit te voeren, raadpleeg dan
de bibliotheekvereisten voor gedeeltelijke lane-sequencing.
Bibliotheekgrootte (piekkaart)
De hoofdpiek moet binnen 300-450 bp liggen.
Bibliotheken moeten één enkele hoofdpiek hebben, geen adapterverontreiniging en geen primerdimeren.
Neem contact met ons op als uw monsters niet voldoen aan de uitgangsmateriaalvereisten.
Serviceworkflow
Kwaliteitscontrole van de bibliotheek
Sequencing
Controle van de gegevenskwaliteit
Projectoplevering
QC-rapport van de bibliotheek
Er wordt een rapport over de kwaliteit van de bibliotheek verstrekt voordat de sequentie wordt bepaald, het bibliotheekaantal en de fragmentatie worden beoordeeld.
Sequencing QC-rapport
Tabel 1. Statistieken over sequentiegegevens.
| Monster-ID | BMKID | Rauw leest | Ruwe gegevens (bp) | Schone metingen (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 uur | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figuur 1. Kwaliteitsverdeling langs metingen in elk voorbeeld
Figuur 2. Distributie van basisinhoud
Figuur 3. Verdeling van de gelezen inhoud in sequencing-gegevens
