BMKCloud Log in
Ik ben banner-03

Producten

DNA/RNA-sequencing – Illumina-sequencer

Illumina-sequencingtechnologie, sequencing by synthese (SBS), is wereldwijd een algemeen aanvaarde next-generation sequencing-technologie (NGS), die verantwoordelijk is voor het genereren van meer dan 90% van 's werelds sequencing-gegevens.Een fluorescent gelabelde omkeerbare terminator wordt afgebeeld terwijl elke dNTP wordt toegevoegd, en vervolgens gesplitst om opname van de volgende base mogelijk te maken.Omdat alle vier de omkeerbare terminator-gebonden dNTP's aanwezig zijn tijdens elke sequencingcyclus, minimaliseert natuurlijke concurrentie de incorporatiebias.De methode elimineert vrijwel alle fouten en gemiste oproepen die verband houden met reeksen herhaalde nucleotiden (homopolymeren).Illumina-sequencing door synthesetechnologie ondersteunt zowel single-read als paired-end bibliotheken.SBS-technologie biedt een mogelijkheid tot paired-end met korte inserts voor genoomsequencing met hoge resolutie, evenals reads met gepaarde uiteinden met lange inserts voor efficiënte sequentie-assemblage, de novo-sequencing en meer.De combinatie van korte inserts en langere reads vergroot het vermogen om elk genoom volledig te karakteriseren.


Servicedetails

Demoresultaat

Servicedetails Kenmerken

Platform

Sequencing-modus

Toepassingen

Illumina Nova-systeem

SE50

PE50

PE150

PE250

1. Sequentieer snel hele genomen

2. Zoom in om doelgebieden diepgaand te sequencen

3. Gebruik RNA-sequencing (RNA-Seq) om nieuwe RNA-varianten en splitsingsplaatsen te ontdekken, of mRNA's te kwantificeren voor analyse van genexpressie

4. Analyseer epigenetische factoren zoals genoombrede DNA-methylatie en DNA-eiwitinteracties

5. Sequentie van kankermonsters om zeldzame somatische varianten, tumorsubklonen en meer te bestuderen. Bestudeer de microbiële diversiteit bij mensen of in het milieu

Servicevoordelen

● Uitgebreide ervaring op het Illumina-sequencingplatform met duizenden gesloten projecten met verschillende soorten.
● Volwassen sequencingproces met korte doorlooptijd.
● Volledige downstream bio-informatica-analysediensten.
● Strikt kwaliteitscontrolesysteem: strikte QC-standaard voor sequencing-gegevens.

Voorbeeldvereisten*

Sequentieplatform &

Sequentiestrategie

Gegevenshoeveelheid

 

Concentratie
(Thermo Life Qubit 3.0)

 

Volume

Hoeveelheid

QC-resultaat

Novaseq-systeem,

gepaarde uiteinde 150bp

X≤30Gb

≥1ng/μl

≥20 μl

≥20ng

Gekwalificeerd

30 Gb < X≤100 Gb

≥1ng/μl

≥25 μl

≥30ng

X>100Gb

≥2ng/μl

≥25 μl

≥50ng

Opmerking:
  • Naast concentratie en totale hoeveelheid is ook een geschikt piekpatroon vereist.

Enkele rijstrook (Illumina)

Platform

 

 

Concentratie
(qPCR nM)

 

Volume

QC-resultaat

HiseqXten

≥2,5 nM

≥20μL

Gekwalificeerd

NovaSeq 6000 S4

≥2nM

≥30μL

Nova Seg 6000 SP

≥2nM

≥30μL

 

Neem contact met ons op als uw monsters niet voldoen aan de uitgangsmateriaalvereisten.

Serviceworkflow

voorbereiding van het monster

Kwaliteitscontrole van de bibliotheek

Volgorde aanbrengen in

Volgorde aanbrengen in

Gegevensanalyse

Controle van de gegevenskwaliteit

Voorbeeld-QC

Projectoplevering


  • Vorig:
  • Volgende:

  • Gegevenskwaliteitsbeoordeling van RNA-monster

    Tabel 1. Statistieken over sequentiegegevens.

    Monster-ID

    BMKID

    Rauw leest

    Ruwe gegevens (bp)

    Schone metingen (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94,85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00 uur

    98,95

    93,89

    37.08

    Figuur 1. Kwaliteitsverdeling langs metingen in elk voorbeeld

    A9

    Figuur 2. Distributie van basisinhoud

    A10

    Figuur 3. Verdeling van de gelezen inhoud in sequencing-gegevens

    A11

    ontvang een offerte

    Schrijf hier uw bericht en stuur het naar ons

    Stuur uw bericht naar ons: