BMKCloud Log in
Ik ben banner-03

Producten

Schimmelgenoom

Biomarker Technologies bieden genoomonderzoek, fijn genoom en pene-compleet genoom van schimmels, afhankelijk van het specifieke onderzoeksdoel.Genoomsequencing, -assemblage en functionele annotatie kunnen worden bereikt door het combineren van sequencing van de volgende generatie + sequencing van de derde generatie om genoomassemblage op hoog niveau te bereiken.Hi-C-technologie kan ook worden gebruikt om de assemblage van het genoom op chromosoomniveau te vergemakkelijken.

Platform:PacBio-vervolg II

Nanopore PromethION P48

Illumina NovaSeq-platform


Servicedetails

Demoresultaten

Servicevoordelen

● Meerdere sequentiestrategieën beschikbaar voor verschillende onderzoeksdoelen

● Zeer ervaren in de assemblage van het genoom van schimmels, met meer dan 10.000 geassembleerde penen-compleet genoom.

● Professioneel technisch ondersteuningsteam na verkoop dat voldoet aan meer specifieke onderzoeksbehoeften.

Servicespecificaties

Dienst

Sequentiestrategie

Kwaliteit gegarandeerd

Geschatte doorlooptijd

Schimmel fijne kaart

Illumina 50X+Nanoporiën 100X

Contig N50≥2 Mb

35 werkdagen

PacBio HiFi 30X

Schimmelpene-complete kaart

Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X

Chromosoomverankeringsverhouding >90%

45 werkdagen

Bio-informatica analyses

● Kwaliteitscontrole van ruwe gegevens

● Genoomassemblage

● Analyse van genoomcomponenten

● Genfunctieannotatie

● Vergelijkende genomische analyse

2

Monstervereisten en levering

Voorbeeldvereisten:

VoorDNA-extracten:

Voorbeeldtype

Hoeveelheid

Concentratie

Puurheid

DNA-extracten

> 1,2 µg

> 20 ng/μl

OD260/280= 1,6-2,5

Voor weefselmonsters:

Voorbeeldtype Aanbevolen monsterbehandeling Monsteropslag en verzending
Eencellige schimmel Observeer gist onder de microscoop en verzamel ze in hun exponentiële fase

Breng de cultuur (die ongeveer 3-4,5e9 cellen bevat) over in een eppendorf van 1,5 of 2 ml.(Blijf op ijs)

Centrifugeer de buis gedurende 1 minuut bij 14.000 g om bacteriën te verzamelen en verwijder het supernatant voorzichtig

Sluit de buis af en bevries de bacteriën in vloeibare stikstof gedurende minimaal 1-3 uur.Bewaar de tube in een koelkast van -80 ℃.

Bevries de monsters in vloeibare stikstof gedurende 3-4 uur en bewaar ze in vloeibare stikstof of -80 graden tot langetermijnreservering.Verzending van monsters met droogijs is vereist.
Macro-schimmel Weefsel in de actieve groeifase wordt aanbevolen.

Spoel het weefsel af met endotoxinevrij water en vervolgens met 70% ethonal.

Bewaar het monster in cryobuizen.

Servicewerkstroom

monster levering

Levering van monsters

Voorbereiding bibliotheek

Bouw van bibliotheek

Volgorde aanbrengen in

Volgorde aanbrengen in

Gegevensanalyse

Gegevensanalyse

Dienst na verkoop

After-sales diensten


  • Vorig:
  • Volgende:

  • 1. Circosdiagram over genomische componenten van schimmels

    3

    2.Vergelijkende genomica-analyse: fylogenetische boom

    4

     

    ontvang een offerte

    Schrijf hier uw bericht en stuur het naar ons

    Stuur uw bericht naar ons: