条形 Banner-03

Producten

Metatranscriptoomsequencing

Leveraging Illumina Sequencing Technology, BMKgene's metatranscriptome sequencing -service onthult de dynamische genexpressie van een diverse reeks microben, die eukaryoten overspannen tot prokaryoten en virussen, binnen natuurlijke omgevingen zoals bodem, water, zee, zee, ontlasting en de darm. Onze uitgebreide service stelt onderzoekers in staat om zich te verdiepen in de complete genexpressieprofielen van complexe microbiële gemeenschappen. Naast de taxonomische analyse vergemakkelijkt onze metatranscriptoomsequencing -service de exploratie naar functionele verrijking, waardoor licht wordt werpt op differentieel tot expressie gebrachte genen en hun rollen. Ontdek een schat aan biologische inzichten terwijl u door de complexe landschappen van genexpressie, taxonomische diversiteit en functionele dynamiek binnen deze diverse omgevingsniches navigeert.


Servicegegevens

Bio -informatica

Demo -resultaten

Uitgelichte publicaties

Servicefuncties

● RRNA -uitputting gevolgd door de voorbereiding van het directionele mRNA -bibliotheek.

● Sequencing op Illumina Novaseq.

Servicevoordelen

Bestudeer de veranderingen van complexe microbiële gemeenschappen:Dit gebeurt op transcriptioneel niveau en verken potentiële nieuwe genen.

Het uitleggen van microbiële gemeenschapsinteracties met de gastheer of omgeving.

Uitgebreide bioinformatische analyse: Dit biedt inzichten in de taxonomische en functionele composities van de gemeenschap, evenals differentiële genexpressieanalyse.

Uitgebreide genannotatie:Het gebruik van up-to-date genfunctiedatabases voor informatieve genexpressie-informatie van microbiële gemeenschappen.

Post-sales ondersteuning:Onze toewijding gaat verder dan de voltooiing van het project met een serviceperiode van 3 maanden na verkoop. Gedurende deze tijd bieden we projecten follow-up, hulp bij het oplossen van problemen en Q & A-sessies om alle vragen met betrekking tot de resultaten aan te pakken.

Servicespecificaties

Sequencing platform

Sequencing -strategie

Gegevens aanbevolen

Gegevenskwaliteitscontrole

Illumina novaseq

PE150

12 GB

Q30 ≥85%

Voorbeeldvereisten

Concentratie (ng/µl)

Totale hoeveelheid (µg)

Volume (µl)

OD260/280

OD260/230

Rin

≥50

≥1.0

≥20

1.8-2.0

1.0-2.5

≥6,5

 

 

 

Service -werkstroom

voorbeeldafgifte

Voorbeeldafgifte

Bibliotheekvoorbereiding

Bibliotheekconstructie

Volgorde

Volgorde

Gegevensanalyse

Gegevensanalyse

After Sale Services

After-Sale Services


  • Vorig:
  • Volgende:

  • 流程图 7-01

    Bevat de volgende analyse:

    ● Controle van de gegevenskwaliteit sequenceren

    ● Transcriptassemblage

    ● Taxonomische annotatie en overvloed

    ● Functionele annotatie en overvloed

    ● Kwantificering van expressie en differentiële analyse

    Taxonomische verdeling van elke steekproef:

     

     图片 73

     

    Beta Diversity Analysis: UPGMA

     

    图片 74 

     

      

    Functionele annotatie - Go Abundance

     

    图片 75 

     

    Differentiële taxonomie overvloed - lefse

     

     图片 76

     

    Verken de vooruitgang die wordt gefaciliteerd door BMKgene's Meta Transcriptomics Sequencing Services via een samengestelde verzameling publicaties.

    Lu, Z. et al. (2023) 'Zuurtolerantie van lactaat-utiliserende bacteriën van de orde bacteroidales draagt ​​bij aan de preventie van ruminale acidose bij geiten aangepast aan een dieet met een hoog concentratie',Diervoeding, 14, pp. 130–140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.

    Song, Z. et al. (2017) '' Functionele microbiota van de kern in traditionele fermentatie van vaste toestand ontrafelen door amplicons met high-throughput en metatranscriptomics sequencing ',Frontiers in microbiologie, 8 (juli). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/full.

    Wang, W. et al. (2022) 'Nieuwe mycovirussen ontdekt uit een metatranscriptomics -onderzoek van de fytopathogene alternaria -schimmel',Virussen, 14 (11), p. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.

    Wei, J. et al. (2022) 'Parallelle metatranscriptoomanalyse onthult afbraak van planten secundaire metabolieten door kevers en hun darmsymbionten',Moleculair Ecologie, 31 (15), pp. 3999–4016. doi: 10.1111/mec.16557.

    Krijg een citaat

    Schrijf hier uw bericht en stuur het naar ons

    Stuur uw bericht naar ons: