-
Volledige lengte mRNA-sequencing-Nanopore
RNA-sequencing is een hulpmiddel van onschatbare waarde geweest voor uitgebreide transcriptoomanalyse.Ongetwijfeld heeft de traditionele short-read sequencing hier tal van belangrijke ontwikkelingen doorgemaakt.Desalniettemin ontmoet het vaak beperkingen bij isovormidentificaties van volledige lengte, kwantificering en PCR-bias.
Nanopore-sequencing onderscheidt zich van andere sequencing-platforms doordat de nucleotiden direct zonder DNA-synthese worden uitgelezen en long-read genereert bij tientallen kilobasen.Dit maakt directe uitlezing mogelijk door volledige transcripties te kruisen en de uitdagingen in studies op isoform-niveau aan te pakken.
PlatformikNanopore PromethION
Bibliotheek:cDNA-PCR
-
De novo Transcriptoomsequencing van volledige lengte -PacBio
nieuwvolledige transcriptoomsequencing, ook bekend alsnieuwIso-Seq maakt gebruik van de voordelen van PacBio-sequencer in leeslengte, waardoor sequencing van cDNA-moleculen van volledige lengte zonder onderbrekingen mogelijk is.Dit vermijdt volledig alle fouten die worden gegenereerd in stappen voor het samenstellen van transcripten en construeert unigene sets met resolutie op isovormniveau.Deze unigene-sets bieden krachtige genetische informatie als "referentiegenoom" op transcriptoomniveau.Bovendien maakt deze service, in combinatie met sequentiegegevens van de volgende generatie, een nauwkeurige kwantificering van expressie op isovormniveau mogelijk.
Platform： PacBio Vervolg IIBibliotheek: SMRT-belbibliotheek -
Eukaryotische mRNA-sequencing-Illumina
mRNA-sequencing maakt profilering mogelijk van alle mRNA's die onder specifieke omstandigheden uit cellen zijn getranscribeerd.Het is een krachtige technologie voor het onthullen van genexpressieprofielen, genstructuren en moleculaire mechanismen van bepaalde biologische processen.Tot op heden is mRNA-sequencing op grote schaal toegepast in fundamenteel onderzoek, klinische diagnostiek, de ontwikkeling van geneesmiddelen, enz.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Niet-referentie gebaseerde mRNA-sequencing-Illumina
mRNA-sequencing maakt gebruik van next-generation sequencing-techniek (NGS) om het boodschapper-RNA (mRNA) van eukaryote te vangen in een specifieke periode dat sommige speciale functies worden geactiveerd.Het langste gesplitste transcript werd 'Unigene' genoemd en werd gebruikt als de referentiesequentie voor daaropvolgende analyse, wat een effectief middel is om het moleculaire mechanisme en het regulerende netwerk van de soort zonder referentie te bestuderen.
Na assemblage van transcriptoomgegevens en unigene functionele annotatie
(1) SNP-analyse, SSR-analyse, CDS-voorspelling en genstructuur zullen worden uitgevoerd.
(2) Kwantificering van unigene expressie in elk monster zal worden uitgevoerd.
(3) Differentieel tot expressie gebrachte unigenen tussen monsters (of groepen) zullen worden ontdekt op basis van unigene expressie
(4) Clustering, functionele annotatie en verrijkingsanalyse van differentieel tot expressie gebrachte unigenen zullen worden uitgevoerd
-
Lange niet-coderende sequencing-Illumina
Lange niet-coderende RNA's (lncRNA's) zijn een type RNA-moleculen met een lengte van meer dan 200 nt, die worden gekenmerkt door een extreem laag coderend vermogen.LncRNA, als een sleutelelement in niet-coderende RNA's, wordt voornamelijk gevonden in de kern en het plasma.De ontwikkeling in sequencing-technologie en bio-informtica maakt de identificatie van talrijke nieuwe lncRNA's mogelijk en associeert deze met biologische functies.Accumulatief bewijs suggereert dat lncRNA op grote schaal betrokken is bij epigenetische regulatie, transcriptieregulatie en post-transcriptieregulatie.
-
Kleine RNA-sequencing-Illumina
Klein RNA verwijst naar een klasse van niet-coderende RNA-moleculen die gewoonlijk minder dan 200 nt lang zijn, waaronder micro-RNA (miRNA), klein-interferentie-RNA (siRNA) en piwi-interactief RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) is een klasse van endogeen klein RNA met een lengte van ongeveer 20-24nt, die een verscheidenheid aan belangrijke regulerende rollen in cellen speelt.miRNA is betrokken bij veel levensprocessen die weefsel - specifiek en stadium - specifieke expressie onthullen en in hoge mate geconserveerd zijn in verschillende soorten.
-
circRNA-sequencing-Illumina
Hele transcriptoomsequencing is ontworpen om alle soorten RNA-moleculen te profileren, inclusief coderende (mRNA) en niet-coderende RNA's (inclusief lncRNA, circRNA en miRNA) die op een bepaald moment door specifieke cellen worden getranscribeerd.Hele transcriptoomsequencing, ook wel "total RNA-sequencing" genoemd, is gericht op het onthullen van uitgebreide regulerende netwerken op transcriptoomniveau.Door gebruik te maken van NGS-technologie zijn sequenties van volledige transcriptoomproducten beschikbaar voor ceRNA-analyse en gezamenlijke RNA-analyse, wat de eerste stap vormt naar functionele karakterisering.Onthullend regulerend netwerk van op circRNA-miRNA-mRNA gebaseerd ceRNA.
-
Gehele transcriptoomsequencing - Illumina
Hele transcriptoomsequencing is ontworpen om alle soorten RNA-moleculen te profileren, inclusief coderende (mRNA) en niet-coderende RNA's (inclusief lncRNA, circRNA en miRNA) die op een bepaald moment door specifieke cellen worden getranscribeerd.Hele transcriptoomsequencing, ook wel "total RNA-sequencing" genoemd, is gericht op het onthullen van uitgebreide regulerende netwerken op transcriptoomniveau.Door gebruik te maken van NGS-technologie zijn sequenties van volledige transcriptoomproducten beschikbaar voor ceRNA-analyse en gezamenlijke RNA-analyse, wat de eerste stap vormt naar functionele karakterisering.Onthullend regulerend netwerk van op circRNA-miRNA-mRNA gebaseerd ceRNA.
-
Prokaryotische RNA-sequencing
Prokaryotische RNA-sequencing maakt gebruik van next generation sequencing (NGS) om de aanwezigheid en hoeveelheid RNA op een bepaald moment te onthullen, door het veranderende cellulaire transcriptoom te analyseren.De prokaryotische RNA-sequencing van ons bedrijf is specifiek gericht op prokaryoten met referentiegenomen, en biedt u transcriptoomprofilering, genstructuuranalyse, enz. Het is op grote schaal toegepast op fundamenteel wetenschappelijk onderzoek, geneesmiddelenonderzoek en -ontwikkeling, en meer.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Metatranscriptoomsequencing
Metatranscriptoomsequencing identificeert genexpressie van microben (zowel eukaryoten als prokaryoten) in natuurlijke omgevingen (dwz bodem, water, zee, uitwerpselen en darmen). Deze service stelt u in het bijzonder in staat om volledige genexpressieprofilering te verkrijgen van complexe microbiële gemeenschappen, taxonomische analyse van soorten, functionele verrijkingsanalyse van verschillend tot expressie gebrachte genen, en meer.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
