Bakteriell og sopp hele genom-sekvensering
Bakterielle og sopp-genom-sekvenseringsprosjekter er sentrale for å fremme mikrobiell genomikk ved å muliggjøre fullføring og sammenligning av mikrobielle genomer. Dette letter gjæringsteknikk, optimalisering av industrielle prosesser og utforsking av sekundære metabolismeveier. Videre er sopp og bakteriell sekvensering avgjørende for å forstå miljømessig tilpasning, optimalisere stammer og avsløre genetisk evolusjonsdynamikk, med brede implikasjoner innen medisin, landbruk og miljøvitenskap.
Tjenestefordeler
●Bioinformatisk analyse inkluderer variantanrop:Gir funksjonell innsikt i de re-sekvenserte genomene.
● Omfattende kompetanse: Med tusenvis av mikrobielle re-sekvenseringsprosjekter gjennomført årlig, bringer vi over et tiår med erfaring, et meget dyktig analyseteam, omfattende innhold og utmerket støtte etter salg.
●Støtte etter salg:Vår forpliktelse strekker seg utover prosjektets fullføring med en 3-måneders serviceperiode etter salg. I løpet av denne tiden tilbyr vi prosjektoppfølging, feilsøkingshjelp og spørsmål og spørsmål for å adressere spørsmål relatert til resultatene.
Servicespesifikasjoner
| Sekvenseringsplattform | Sekvenseringsstrategi | Data anbefalt | Kvalitetskontroll |
| Illumina Novaseq | PE150 | Dybde på 100 ganger | Q30≥85% |
Prøvekrav
| Konsentrasjon (ng/ul) | Totalt beløp (NG) | Volum (μL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bakterier: ≥1x107 celler
Encellede sopp: ≥5x106-1x107 celler
Makro sopp: ≥4g
Servicearbeidsflyt
Eksempellevering
Bibliotekskonstruksjon
Sekvensering
Dataanalyse
Etter salgstjenester
Inkluderer følgende analyse:
- Sekvensering av datakvalitetskontroll
- Justering til referansegenomet
- Variantanrop: SNP og Indel
- Variant merknad
Variantanrop: SNP -typer
Variantanrop: Indel Lengde Distribution
Utforsk fremskrittene som BMKGENEs mikrobielle genom skal sequencing Services gjennom en kuratert samling av publikasjoner.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kombinere transkriptom og hele genom-sekvensering for å screene sykdomsresistensgener for hvetedwarf bunt',International Journal of Molecular Sciences, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-kontrollert glukosemetabolisme manipulerer overgangen fra toleranse til resistens i bakterier',Vitenskapen går videre, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. Nov., en haloalkalifil bakterie isolert fra en brus -innsjø i indre Mongolia autonome region, Kina ', int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, s. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. og Wang, G.-H. (2024) 'Genomsekvens av Staphylococcus nepalensis ZZ-2023A, isolert fra Nasonia Vitripennis',Mikrobiologiske ressurs kunngjøringer. doi: 10.1128/mra.00802-23.
