DNBSEQ ferdiglagde biblioteker
Funksjoner
●Plattform:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvenseringsmodus:PE150
●Overføring av Illumina -biblioteker tilMGI:muliggjøre sekvensering av høye datamengder til lave kostnader.
●Kvalitetskontroll av biblioteker før sekvensering.
●Sekvenseringsdata QC og levering:Levering av QC -rapport og rå data i FASTQ -format etter demultiplexing og filtrering av Q30 leser.
Fordeler
●Allsidigheten av sekvenseringstjenester:Kunden kan velge å sekvensere etter bane eller datamengde.
●Høy datautgang:1500 GB/bane
●Levering av sekvensering av QC -rapport:Med kvalitetsmålinger, datakurs og generell ytelse av sekvenseringsprosjektet.
●Moden sekvenseringsprosess:med kort turn-tid.
●Streng kvalitetskontroll: Vi implementerer strenge QC-krav for å garantere levering av gjennomgående resultater av høy kvalitet.
Prøvekrav
| Datamengde (x) | Konsentrasjon (qPCR/nm) | Volum | |
| Delvis bane
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
| Enkeltbane | Per bane | ≥ 1,5 nm / bibliotekbasseng | ≥ 25 μl / bibliotekbasseng |
I tillegg til konsentrasjon og total mengde, er det også nødvendig med et passende toppmønster.
Merk: Lane-sekvensering av biblioteker med lite mangfold krever Phix Spike-in for å sikre robust basisanrop.
Vi anbefaler å sende inn forhåndsbelagte biblioteker som prøver. Hvis du trenger Bmkgene for å utføre bibliotek -sammenslåing, kan du henvise til
Bibliotekskrav for delvis banesekvensering.
Bibliotekstørrelse (toppkart)
Hovedtoppen skal være innen 300-450 bp.
Biblioteker skal ha en enkelt hovedtopp, ingen adapterforurensning og ingen primerdimerer.
Tjenestearbeidsflyt
Bibliotek QC -rapport
En rapport om bibliotekets kvalitet er gitt før sekvensering, vurdering av bibliotekbeløp og fragmentering.
Sekvensering av QC -rapport
Tabell 1. Statistikk om sekvenseringsdata.
| Prøve -id | BMKID | Raw leser | Rå data (BP) | Clean Reads (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
Figur 1. Kvalitetsfordeling langs leser i hver prøve
Figur 2.. Baseinnholdsfordeling
Figur 3. Distribusjon av leseinnhold i sekvenseringsdata
