DNBSEQ forhåndslagde biblioteker
Funksjoner
●Plattform:MGI-DNBSEQ-T7
●Sekvenseringsmoduser:PE150
●Overføring av Illumina-biblioteker tilMGI:muliggjør sekvensering av store datamengder til lave kostnader.
●Kvalitetskontroll av biblioteker før sekvensering.
●Sekvenseringsdata QC og levering:levering av QC-rapport og rådata i fastq-format etter demultipleksing og filtrering av Q30-avlesninger.
Fordeler
●Allsidigheten til sekvenseringstjenester:Kunden kan velge å sekvensere etter kjørefelt eller datamengde.
●Høy datautgang:1500 Gb/fil
●Levering av QC-rapport for sekvensering:med kvalitetsmålinger, datanøyaktighet og generell ytelse for sekvenseringsprosjektet.
●Moden sekvenseringsprosess:med kort behandlingstid.
●Streng kvalitetskontrollVi implementerer strenge kvalitetskontrollkrav for å garantere levering av resultater av gjennomgående høy kvalitet.
Krav til prøveeksempler
| Datamengde (X) | Konsentrasjon (qPCR/nM) | Volum | |
| Delvis kjørefelt
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Enkeltfelt | Per kjørefelt | ≥ 1,5 nM / Bibliotekpool | ≥ 25 μl / bibliotekpool |
I tillegg til konsentrasjon og totalmengde kreves også et passende toppmønster.
Merk: Filsekvensering av biblioteker med lavt mangfold krever PhiX-spike-in for å sikre robust basekall.
Vi anbefaler å sende inn forhåndssamlede biblioteker som eksempler. Hvis du trenger at BMKGENE skal utføre biblioteksamling, se
bibliotekkrav for delvis kjørefeltsekvensering.
Bibliotekstørrelse (toppkart)
Hovedtoppen bør være innenfor 300–450 bp.
Biblioteker bør ha én hovedtopp, ingen adapterforurensning og ingen primerdimerer.
Tjenestens arbeidsflyt
Bibliotekets kvalitetskontrollrapport
En rapport om bibliotekets kvalitet gis før sekvensering, vurdering av bibliotekmengde og fragmentering.
Sekvenserings-QC-rapport
Tabell 1. Statistikk over sekvenseringsdata.
| Eksempel-ID | BMKID | Rå lesninger | Rådata (bp) | Rene avlesninger (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37,08 |
Figur 1. Kvalitetsfordeling langs avlesningene i hver prøve
Figur 2. Fordeling av basisinnhold
Figur 3. Fordeling av lest innhold i sekvenseringsdata
