Metabolomikk
Funksjoner
●Ikke-målrettet metabolomikk (Discovery Metabolomics)
Basert på væskekromatografi-massespektrometri (LC-MS)-teknologi, muliggjør ikke-målrettet metabolomikk objektiv deteksjon av så mange småmolekylære metabolitter som mulig i biologiske prøver som celler, vev, organer eller kroppsvæsker. Den utfører sammenlignende analyser mellom eksperimentelle og kontrollgrupper, og screener differensielle metabolitter gjennom statistisk analyse.
● Ikke-målrettet metabolomikk for lipider
Utnytter teknologien for væskekromatografi og massespektrometri (LC-MS),nMålrettet metabolomikk for lipider oppnår objektiv deteksjon av så mange lipidmolekyler som mulig i biologiske prøver, inkludert celler, vev, organer eller kroppsvæsker.
● Bred-Målrettet metabolomikk
Denne tjenesten kombinerer på en perfekt måte fordelene med høy oppløsning og bred dekning ved ikke-målrettet teknologi med den høye følsomheten og nøyaktige kvantifiseringsmulighetene til målrettet MRM-teknologi (Multiple Reaction Monitoring). Arbeidsflyten er som følger: Først brukes høyoppløselig massespektrometri til å utføre MS²-skanning med ultrahøy dekning på prøver for å oppnå MS²-spektre av "alle" metabolitter. Deretter utføres nøyaktig metabolittidentifikasjon ved å kombinere med et MS²-bibliotek med høy oppløsning (som dekker over 25 000 metabolitter, med flere standard MS²-spektre med høy oppløsning for hver metabolitt). Deretter ekstraheres MRM-ioneparinformasjon fra massespektrene for å etablere et spesifikt bibliotek for prøver. Til slutt brukes trippel kvadrupolmassespektrometri med MRM-teknologi for nøyaktig kvantifisering.
● Målrettet metabolomikk
Målrettet metabolomikk fokuserer på flere målforbindelser eller alle/delvise metabolitter involvert i en spesifikk metabolittvei. Ved å bruke standardstoffer etablerer den en deteksjonsmetode med sterk spesifisitet, høy sensitivitet og god repeterbarhet for kvantifisering og analyse av målforbindelser. Den bruker ekstern standard kombinert med intern standard for absolutt kvantifisering, med lineariteten til standardkurven som når over 0,99 og sensitiviteten opp til ng/ml-nivå.
Fordeler
●Avansert deteksjonsplattform
-Utstyrt med høyoppløselige massespektrometre og trippelkvadrupolmassespektrometre av toppklasse, som muliggjør samtidig deteksjon og analyse av tusenvis av metabolitter.
●Omfattende databaser
- Offentlige databaser: Dekker METLIN, KEGG, HMDB, NP Atlas og Lipidmaps, som omfatter over 500 000 metabolitter.
- InterntPlantespesifikk database: Inneholder over 25 000 metabolitter, inkludert primære og sekundære metabolitter.
- InterntDyre-/medisinspesifikk database: Inkluderer over 12 000 metabolitter.
●Strengt kvalitetskontrollsystem
-Strenge kvalitetskontroller som dekker instrumentstabilitet, stoffrester, QC-prøve-PCA og korrelasjonsanalyse for å sikre pålitelig datakvalitet.
●Høy metabolittdeteksjonskapasitet
- Ikke-Målrettet metabolomikk: Oppdager i gjennomsnitt over 4200 metabolitter per kjøring, ideelt for å utforske ukjente metabolitter i prøver og identifisere metabolitter i komplekse prøver.
- Bred-Målrettet metabolomikk (plante): Oppdager i gjennomsnitt over 2410 metabolitter per kjøring, inkludert primære og sekundære metabolitter.
- Bred-Målrettet metabolomikk (dyr): Oppdager i gjennomsnitt over 1250 metabolitter per kjøring.
- Målrettet metabolomikk: Panelertilflere metabolittkategorier.
●Omfattende analyse
-Tilbyr mer enn 10 analyseelementer og over 20 visualiseringsdiagrammer.
●Gjennomtenkt ettersalgsservice
-Tilbyr konsultasjon etter salg og støtte i tolkningen av sluttrapporter.
Tjenestespesifikasjoner
| Løsning | Plattform | Anbefalte biologiske replikater |
|---|---|---|
| Ikke-målrettet metabolomikk | UHPLC-TOF-MS (Waters Xevo G2-XS QTof) | Plante- og mikrobiell prøve: ≥ 6 Dyreprøve: ≥ 10 Klinisk prøve: ≥ 30 Alle biologiske replikatprøver analysert uavhengig. |
| Bredt målrettet metabolomikk | Vann Xevo G2-XS QTOF + AB Sciex QTRAP 6500+ | Planteprøve: ≥ 3 |
| Målrettet metabolomikk | UHPLC-QQQ-MS (AB Sciex QTRAP 6500+) GC-MS (Agilent 7890-5977, Agilent 7820-5977) | Planteprøve: ≥ 3 Dyreprøve: ≥ 6 |
Krav til prøveeksempler
Lurer du på om prøvene dine oppfyller kriteriene våre? Klikk her for å få vårenyeste prøvekrav.
Tjenestens arbeidsflyt
Prøvesamling
Metabolittutvinning
Datainnsamling
Dataanalyse
Datalevering
1. Bakgrunnsstøy og lavkvalitets databehandling av rådata
2. Vurdering av datakvalitet
2.1 Hovedkomponentanalyse
2.2 Vurdering av reproduserbarhet
3. Metabolittannotasjon
3.1 KEGG-databaseannotering
3.2 HMDB-databaseannotering
3.3 Lipidmaps-databaseannotering
4. Analyse av data for prøvegruppering (biologiske replikater≥3)
4.1 Analyse av konsernets hovedkomponenter
4.2 Ortogonal partiell minste kvadraters diskriminantanalyse (OPLS-DA)
4.3 Analyse av gruppedifferensialmetabolitt
5. Differensiell metabolittseleksjon (biologiske replikater≥3)
5.1 Differensiell fold-endringsanalyse
5.2 Plott av differensiell metabolittvulkan
5.3 Differensiell metabolittklyngingsvarmekart
5.4 Korrelasjonsplott for differensiell metabolitt
5.5 Z-score-plott for differensiell metabolitt
5.6 Analyse av radarplott for differensielle metabolitter
5.7 Differensiell metabolittfiolinplott
5.8 Boksplott for differensiell metabolitt
5.9 Differensiell metabolitt KEGG funksjonell annotasjon og anrikningsanalyse
5.10 ROC-kurveanalyse
5.11 Differensiell metabolitt k-gjennomsnittsklynging
5.12 Venn-diagram for differensiell metabolitt
1. Vurdering av datakvalitet
↑Ckorrelasjonsanalyse(Testprøve/QC-prøve)
↑Hovedkomponentanalyse ↑Analyse av metabolittklynger
2. Metabolittannotasjon
↑KEGG-databaseannotering↑HMDB-databaseannotering
↑Lipidmaps-databaseannotering
3. Analyse av data for prøvegruppering (biologiske replikater≥3)
↑Analyse av hovedkomponenter i gruppen(2D/3D)
↑Ortogonal partiell minste kvadraters diskriminantanalyse (OPLS-DA)
4. Differensiell metabolittseleksjon (biologiske replikater≥3)
↑Differensiell fold-endringsanalyse↑Differensiell metabolitt vulkanplott
↑Differensiell metabolittklyngevarmekart↑Differensiell metabolittkorrelasjonsplott
↑Differensiell metabolitt Z-score plott↑Differensiell metabolitt radar plottanalyse
↑Differensiell metabolittfiolinplott↑Differensiell metabolittboksplott
↑Differensiell metabolitt KEGG funksjonell annotasjon og berikelsesanalyse
↑ROC-kurveanalyse↑Differensiell metabolitt k-gjennomsnittsklynging
↑Differensiell metabolitt Venn-diagram
Wang X, Wang D, Liu X, Zhang H, Chen G, Xu M, Shen X, You C. BEL1-lignende homeodomene transkripsjonsfaktor SAWTOOTH1 (MdSAW1) i Malus domestica øker toleransen til transgenisk eple og Arabidopsis for sinkoverskuddsstress. Int J Biol Macromol. 2025 mai;307(Pt 3):141948. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2025.141948. Epub 2025 mars 10. PMID: 40074134.
Ain QU, Hussain HA, Rahman L, Zhang Q, Rehman A, Hussain S, Uddin S, Imran A. Interaktiv effekt av Moringa oleifera-medierte grønne nanopartikler og arbuskulære mykorrhizalsopper på vekst, rotsystemarkitektur og næringsopptak i mais (Zea mays L.). Plant Physiol Biochem. 2025 sep;226:110063. doi: 10.1016/j.plaphy.2025.110063. Epub 2025 24. mai. PMID: 40441096.
Wang X, Luo J, Wang Q, Zhang Q, Zhao T, Liu Y, Li T, Liu X, Jiang J. Jasmonat aktiverer en SlJAZ2/3-SlMYC3-lignende modul som regulerer K+-opptak i tomatrespons på lav K+-stress. J Integr Plant Biol. 2025 aug.;67(8):2058-2077. doi: 10.1111/jipb.13941. Epub 2025 28. mai. PMID: 40432500.
