16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS |
ସେବା ସୁବିଧା
Øପରିବେଶ ନମୁନାରେ ମାଇକ୍ରୋବାୟାଲ୍ ଗଠନର ଅଲଗା ଏବଂ ମୁକ୍ତ ଚିହ୍ନଟ |
Øପରିବେଶ ନମୁନାରେ କମ୍ ପ୍ରଚୁର ଉପାଦାନଗୁଡ଼ିକରେ ଉଚ୍ଚ ରେଜୋଲୁସନ |
Øଡାଟାବେସ୍, ଟିପ୍ପଣୀ, OTU / ASV ଦୃଷ୍ଟିରୁ ବିଭିନ୍ନ ବିଶ୍ଳେଷଣ ସହିତ ସର୍ବଶେଷ QIIME2 ପ୍ରବାହକୁ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରେ |
Øଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପୁଟ, ଉଚ୍ଚ ସଠିକତା |
Øବିଭିନ୍ନ ମାଇକ୍ରୋବାୟାଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟ ଅଧ୍ୟୟନ ପାଇଁ ପ୍ରଯୁଜ୍ୟ |
ØBMK 100,000 ରୁ ଅଧିକ ନମୁନା ସହିତ ବର୍ଷକୁ soil ମାଟି, ଜଳ, ଗ୍ୟାସ୍, କାଦୁଅ, ମଳ, ଅନ୍ତନଳୀ, ଚର୍ମ, ଫେମେଣ୍ଟେସନ ବ୍ରଥ, କୀଟପତଙ୍ଗ, ଉଦ୍ଭିଦ ଇତ୍ୟାଦି ସହିତ ବ୍ୟାପକ ଅଭିଜ୍ଞତାର ମାଲିକ |
ØBMKCloud 45 ବ୍ୟକ୍ତିଗତ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଉପକରଣ ଧାରଣ କରିଥିବା ତଥ୍ୟ ବ୍ୟାଖ୍ୟାକୁ ସହଜ କରିଥାଏ |
ସେବା ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟକରଣ |
| କ୍ରମପ୍ଲାଟଫର୍ମ | | ଲାଇବ୍ରେରୀ | | ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ତଥ୍ୟ ଉତ୍ପାଦନ | | ଆନୁମାନିକ ଟର୍ନ-ଟର୍ନ ସମୟ | |
| ଇଲୁମିନା ନୋଭା ସେକ୍ 6000 | | PE250 | 50K / 100K / 300K ଟ୍ୟାଗ୍ | | 30 ଦିନ |
ବାୟୋନ୍ଫର୍ମାଟିକ୍ସ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରେ |
üକଞ୍ଚା ତଥ୍ୟ ଗୁଣବତ୍ତା ନିୟନ୍ତ୍ରଣ |
üOTU କ୍ଲଷ୍ଟରିଙ୍ଗ / ଡି-ଶବ୍ଦ (ASV)
üOTU ଟିପ୍ପଣୀ |
üଆଲଫା ବିବିଧତା |
üବିଟା ବିବିଧତା |
üଆନ୍ତ group- ଗୋଷ୍ଠୀ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
üପରୀକ୍ଷାମୂଳକ କାରଣଗୁଡିକ ବିରୁଦ୍ଧରେ ଆସୋସିଏସନ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
üକାର୍ଯ୍ୟ ଜିନ୍ ଭବିଷ୍ୟବାଣୀ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା ଏବଂ ବିତରଣ |
ନମୁନା ଆବଶ୍ୟକତା:
ପାଇଁଡିଏନ୍ଏ ନିର୍ବାହ |:
| ନମୁନା ପ୍ରକାର | | ପରିମାଣ | ଏକାଗ୍ରତା | | ଶୁଦ୍ଧତା |
| ଡିଏନ୍ଏ ନିର୍ବାହ | | ＞ 30 ng | Ng 1 ng / μl | OD260 / 280 = 1.6-2.5 |
ପରିବେଶ ନମୁନା ପାଇଁ:
| ନମୁନା ପ୍ରକାର | | ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ନମୁନା ପ୍ରକ୍ରିୟା | |
| ମାଟି | ନମୁନା ପରିମାଣ: ପାଖାପାଖି |5 g;ଅବଶିଷ୍ଟ ଶୁଖିଲା ପଦାର୍ଥକୁ ଭୂପୃଷ୍ଠରୁ ବାହାର କରିବା ଆବଶ୍ୟକ;ବଡ଼ ଖଣ୍ଡଗୁଡ଼ିକୁ ଗ୍ରାଇଣ୍ଡ୍ କରନ୍ତୁ ଏବଂ 2 ମିମି ଫିଲ୍ଟର୍ ଦେଇ ଯାଆନ୍ତୁ;ସଂରକ୍ଷଣ ପାଇଁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଇପି-ଟ୍ୟୁବ୍ କିମ୍ବା ସାଇରୋଟ୍ୟୁବରେ ଆଲିକଟ୍ ନମୁନା | |
| ମଳ | ନମୁନା ପରିମାଣ: ପାଖାପାଖି |5 g;ସଂରକ୍ଷଣ ପାଇଁ ନିର୍ଜଳ ଇପି-ଟ୍ୟୁବ୍ କିମ୍ବା କ୍ରାଇଟ୍ୟୁବରେ ନମୁନା ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ | |
| ଅନ୍ତନଳୀ ବିଷୟବସ୍ତୁ | | ଆସେପ୍ଟିକ୍ ଅବସ୍ଥାରେ ନମୁନାଗୁଡିକ ପ୍ରକ୍ରିୟାକରଣ କରାଯିବା ଆବଶ୍ୟକ |ସଂଗୃହିତ ଟିସୁକୁ PBS ସହିତ ଧୋଇ ଦିଅ;ପିବିଏସ୍ କୁ ସେଣ୍ଟ୍ରିଫୁଗ୍ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ଇପି-ଟ୍ୟୁବରେ ପୂର୍ବଜଳ ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ | |
| କାଦୁଅ | | ନମୁନା ପରିମାଣ: ପାଖାପାଖି |5 g;ସଂରକ୍ଷଣ ପାଇଁ ଷ୍ଟେରାଇଲ୍ ଇପି-ଟ୍ୟୁବ୍ କିମ୍ବା କ୍ରାଇଟ୍ୟୁବରେ ସ୍ଲାଇଜ୍ ନମୁନା ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ | |
| ଜଳବାୟୁ | ସୀମିତ ପରିମାଣର ମାଇକ୍ରୋବାୟାଲ୍ ସହିତ ନମୁନା ପାଇଁ, ଯେପରିକି ଟ୍ୟାପ୍ ୱାଟର୍, କୂଅ ପାଣି ଇତ୍ୟାଦି, ଅତି କମରେ 1 L ପାଣି ସଂଗ୍ରହ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ମେମ୍ବ୍ରେନ୍ ଉପରେ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ସମୃଦ୍ଧ କରିବା ପାଇଁ 0.22 μm ଫିଲ୍ଟର ଦେଇ ଯାଆନ୍ତୁ |ମେମ୍ବ୍ରାନକୁ ଷ୍ଟେରାଇଲ୍ ଟ୍ୟୁବରେ ରଖନ୍ତୁ | |
| ଚର୍ମ | ଚର୍ମ ପୃଷ୍ଠକୁ ଯତ୍ନର ସହିତ ନିର୍ଜଳ ସୂତା ସ୍ ab ାବ୍ କିମ୍ବା ସର୍ଜିକାଲ୍ ବ୍ଲେଡ୍ ସହିତ ସ୍କ୍ରାପ୍ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ଏହାକୁ ନିର୍ଜଳ ଟ୍ୟୁବରେ ରଖନ୍ତୁ | |
ସୁପାରିଶ କରାଯାଇଥିବା ନମୁନା ବିତରଣ |
ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନରେ ନମୁନାକୁ 3-4 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ ଫ୍ରିଜ୍ କରନ୍ତୁ ଏବଂ ତରଳ ନାଇଟ୍ରୋଜେନ୍ କିମ୍ବା -80 ଡିଗ୍ରୀରେ ଦୀର୍ଘକାଳୀନ ସଂରକ୍ଷଣ ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସଂରକ୍ଷଣ କରନ୍ତୁ |ଶୁଖିଲା ବରଫ ସହିତ ନମୁନା ପରିବହନ ଆବଶ୍ୟକ |
ସେବା କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହ |
ନମୁନା ବିତରଣ |
ଲାଇବ୍ରେରୀ ନିର୍ମାଣ
କ୍ରମ
ତଥ୍ୟ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
ବିକ୍ରୟ ପରେ ସେବା |
1. ପ୍ରଜାତିର ବଣ୍ଟନ |
2. ହଟ୍ ମାନଚିତ୍ର: ସମୃଦ୍ଧତା କ୍ଲଷ୍ଟରିଙ୍ଗ୍ ପ୍ରଜାତିଗୁଡିକ |
3. ବିରଳ ଦଳ ବକ୍ରତା |
4.NMDS ବିଶ୍ଳେଷଣ |
5. ଲେଫ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ |
BMK କେସ୍ |
ଟାଇପ୍-୨ ଡାଇବେଟିସ୍ ସହିତ ଏବଂ ବିନା ମୋଟା ବ୍ୟକ୍ତିମାନେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମତା ଏବଂ ରଚନା ଦେଖାନ୍ତି |
ପ୍ରକାଶିତ:ସେଲ୍ ହୋଷ୍ଟ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବ, 2019
କ୍ରମ କ strategy ଶଳ:
ପତଳା ଅଣ-ମଧୁମେହ (n = 633);ମୋଟାପଣ ଅଣ-ମଧୁମେହ (n = 494);ମୋଟାପଣ-ପ୍ରକାର 2 ମଧୁମେହ (n = 153);
ଲକ୍ଷ୍ୟ ଅଞ୍ଚଳ: 16S rDNA V1-V2 |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: ଇଲୁମିନା ମିସେକ୍ (NGS- ଆଧାରିତ ଆମ୍ପଲିକନ୍ କ୍ରମ)
ଡିଏନ୍ଏ ଏକ୍ସଟ୍ରାକ୍ଟର ସବ୍ସେଟ୍ ଇଲୁମିନା ହିସେକ୍ ଉପରେ ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଅଧୀନରେ ରହିଲା |
ମୁଖ୍ୟ ଫଳାଫଳଗୁଡିକ
ଏହି ମେଟାବୋଲିକ୍ ରୋଗଗୁଡିକର ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ସଫଳତାର ସହିତ ଭିନ୍ନ ହେଲା |
16S କ୍ରମରେ ସୃଷ୍ଟି ହୋଇଥିବା ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ବ features ଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକ ତୁଳନା କରି, ମେଦବହୁଳତା ମାଇକ୍ରୋବାୟାଲ୍ ରଚନା, ବ୍ୟକ୍ତିଗତ ବ features ଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡିକ, ବିଶେଷକରି ଆକାକର୍ମାନସିଆ, ଫେକାଲିବ୍ୟାକ୍ଟେରିୟମ୍, ଓସ୍କିଲିବ୍ୟାକ୍ଟର୍, ଆଲିଷ୍ଟାଇପ୍ ଇତ୍ୟାଦିରେ ହ୍ରାସ ସହିତ ଜଡିତ ଥିବା ଦେଖିବାକୁ ମିଳିଥିଲା | ।
ସନ୍ଦର୍ଭ
ଥିଙ୍ଗହୋଲମ୍, LB, ଇତ୍ୟାଦି |ଟାଇପ୍-୨ ଡାଇବେଟିସ୍ ସହିତ ଏବଂ ମୋଟାପଣ ବିଶିଷ୍ଟ ବ୍ୟକ୍ତିମାନେ ବିଭିନ୍ନ ଗୁଟ୍ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମତା ଏବଂ ରଚନା ଦେଖାନ୍ତି |ସେଲ୍ ହୋଷ୍ଟ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବ୍ |26.2 (2019) |
