-
କ୍ରୋମାଟିନ୍ ଇମ୍ୟୁନୋପ୍ରେସିପିଟେସନ୍ କ୍ରମ (ChIP-seq)
ChIP-Seq ହିଷ୍ଟୋନ୍ ରୂପାନ୍ତର, ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପସନ୍ ଫ୍ୟାକ୍ଟର୍ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ DNA- ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ପ୍ରୋଟିନ୍ ପାଇଁ DNA ଟାର୍ଗେଟର ଜିନୋମ-ୱାଇଡ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ପ୍ରଦାନ କରେ |ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ପ୍ରୋଟିନ୍-ଡିଏନ୍ଏ କମ୍ପ୍ଲେକ୍ସଗୁଡିକ ପୁନରୁଦ୍ଧାର ପାଇଁ କ୍ରୋମାଟିନ୍ ଇମ୍ୟୁନୋ-ବୃଷ୍ଟିପାତ (ChIP) ର ଚୟନକର୍ତ୍ତା ପୁନରୁଦ୍ଧାର DNA ର ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପ୍ କ୍ରମ ପାଇଁ ପରବର୍ତ୍ତୀ ପି generation ଼ିର ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ (NGS) ର ଶକ୍ତି ସହିତ ମିଶ୍ରଣ କରେ |ଅତିରିକ୍ତ ଭାବରେ, କାରଣ ପ୍ରୋଟିନ୍-ଡିଏନ୍ଏ କମ୍ପ୍ଲେକ୍ସଗୁଡିକ ଜୀବନ୍ତ କୋଷରୁ ପୁନରୁଦ୍ଧାର ହୋଇଥିବାରୁ, ବାନ୍ଧିବା ସ୍ଥାନଗୁଡିକ ବିଭିନ୍ନ କୋଷ ପ୍ରକାର ଏବଂ ଟିସୁରେ କିମ୍ବା ବିଭିନ୍ନ ଅବସ୍ଥାରେ ତୁଳନା କରାଯାଇପାରେ |ପ୍ରୟୋଗଗୁଡ଼ିକ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପସନ୍ ରେଗୁଲେସନ୍ ଠାରୁ ବିକାଶ ପଥ ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ରୋଗ ଯନ୍ତ୍ରକ and ଶଳ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: ଇଲୁମିନା ନୋଭା ସେକ୍ 6000 |
-
ସମ୍ପୁର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ ବିସୁଲ୍ କ୍ରମ |
ସାଇଟୋସିନ୍ (5-mC) ର ପଞ୍ଚମ ସ୍ଥାନରେ DNA ମିଥାଇଲେସନ୍ ଜିନ୍ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଏବଂ ସେଲୁଲାର୍ କାର୍ଯ୍ୟକଳାପ ଉପରେ ଏକ ମ fundamental ଳିକ ପ୍ରଭାବ ପକାଇଥାଏ |ଅସ୍ୱାଭାବିକ ମିଥାଇଲେସନ୍ s ାଞ୍ଚାଗୁଡ଼ିକ ବିଭିନ୍ନ ଅବସ୍ଥା ଏବଂ ରୋଗ ଯେପରିକି କର୍କଟ ଭଳି ଜଡିତ |ସିଙ୍ଗଲ୍ ବେସ୍ ରିଜୋଲ୍ୟୁସନ୍ରେ ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ ମିଥାଇଲେସନ୍ ଅଧ୍ୟୟନ ପାଇଁ WGBS ସୁନାର ମାନକ ହୋଇପାରିଛି |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: Illumina NovaSeq6000 |
-
ହାଇ ଥ୍ରୋପପୁଟ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ (ATAC-seq) ସହିତ ଟ୍ରାନ୍ସପୋସେଜ୍-ଆକ୍ସେସିବଲ୍ କ୍ରୋମାଟିନ୍ ପାଇଁ ଆସେ |
ଜେନୋମ-ୱାଇଡ୍ କ୍ରୋମାଟିନ୍ ଆକ୍ସେସିବିଲିଟିର ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ ATAC-seq ହେଉଛି ଏକ ଉଚ୍ଚ-ଥ୍ରୋପୁଟ କ୍ରମ ପ୍ରଣାଳୀ, ଯାହା ଜିନ୍ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତିର ବିଶ୍ global ସ୍ତରୀୟ ଏପିଜେନେଟିକ୍ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ପାଇଁ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ |ହାଇପରାକ୍ଟିଭ୍ Tn5 ଟ୍ରାନ୍ସପୋସେଜ୍ ଦ୍ୱାରା ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ଆଡାପ୍ଟରଗୁଡିକ ଖୋଲା କ୍ରୋମାଟିନ୍ ଅଞ୍ଚଳରେ ଭର୍ତ୍ତି କରାଯାଇଛି |PCR ବିସ୍ତାର ପରେ, ଏକ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ ଲାଇବ୍ରେରୀ ନିର୍ମାଣ କରାଯାଏ |ସମସ୍ତ ଖୋଲା କ୍ରୋମାଟିନ୍ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡିକ ଏକ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ସ୍ପେସ୍ ଟାଇମ୍ ଅବସ୍ଥାରେ ପ୍ରାପ୍ତ ହୋଇପାରିବ, କେବଳ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପସନ୍ ଫ୍ୟାକ୍ଟରର ବାଇଣ୍ଡିଂ ସାଇଟ୍ କିମ୍ବା ଏକ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ହିଷ୍ଟୋନ୍ ପରିବର୍ତ୍ତିତ ଅଞ୍ଚଳରେ ସୀମିତ ନୁହେଁ |
-
ହ୍ରାସ ହୋଇଥିବା ପ୍ରତିନିଧୀ ବିସୁଲଫାଇଟ୍ କ୍ରମ (RRBS)
ରୋଗ ଅନୁସନ୍ଧାନରେ DNA ମିଥାଇଲେସନ୍ ଗବେଷଣା ସର୍ବଦା ଏକ ହଟ ପ୍ରସଙ୍ଗ ହୋଇ ରହିଥାଏ ଏବଂ ଜିନ୍ ଅଭିବ୍ୟକ୍ତି ଏବଂ ଫେନୋ-ଟାଇପିକ୍ ଗୁଣ ସହିତ ନିବିଡ ଭାବରେ ଜଡିତ |ଡିଏନ୍ଏ ମିଥାଇଲେସନ୍ ଗବେଷଣା ପାଇଁ RRBS ଏକ ସଠିକ, ଦକ୍ଷ ଏବଂ ଅର୍ଥନ method ତିକ ପଦ୍ଧତି |ଏନଜାଇମାଟିକ୍ କ୍ଲାଭେଜ୍ (Msp I) ଦ୍ prom ାରା ପ୍ରୋମୋଟର୍ ଏବଂ ସିପିଜି ଦ୍ୱୀପପୁଞ୍ଜର ସମୃଦ୍ଧତା, ବିସୁଲଫାଇଟ୍ କ୍ରମ ସହିତ ମିଳିତ ହୋଇ ଉଚ୍ଚ ରେଜୋଲୁସନ DNA ମିଥାଇଲେସନ୍ ଚିହ୍ନଟ ପ୍ରଦାନ କରେ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: ଇଲୁମିନା ନୋଭା ସେକ୍ 6000 |
