-
ମେଟେଜେନୋମିକ୍ କ୍ରମ (NGS)
ମେଟେଜେନୋମ ଜୀବଜନ୍ତୁର ମିଶ୍ରିତ ସମ୍ପ୍ରଦାୟର ସମୁଦାୟ ଜେନେଟିକ ସାମଗ୍ରୀର ସଂଗ୍ରହକୁ ବୁ refers ାଏ, ଯେପରିକି ପରିବେଶ ମେଟେଜେନୋମ, ମାନବ ମେଟେଜେନୋମ ଇତ୍ୟାଦି ଏଥିରେ ଉଭୟ ଚାଷ ଯୋଗ୍ୟ ଏବଂ ଅଣସଂଗଠିତ ମାଇକ୍ରୋଅର୍ଗାନ୍ସର ଜିନୋମ ଧାରଣ କରିଥାଏ |ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ ହେଉଛି ଏକ ମଲିକୁଲାର ଉପକରଣ ଯାହାକି ପରିବେଶ ନମୁନାରୁ ବାହାର କରାଯାଇଥିବା ମିଶ୍ରିତ ଜେନୋମିକ୍ ସାମଗ୍ରୀକୁ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବା ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ, ଯାହା ପ୍ରଜାତିର ବିବିଧତା ଏବଂ ପ୍ରଚୁରତା, ଜନସଂଖ୍ୟା ଗଠନ, ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ସମ୍ପର୍କ, କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଜିନ୍ ଏବଂ ସମ୍ପର୍କ ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ନେଟୱାର୍କରେ ବିସ୍ତୃତ ସୂଚନା ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：Illumina NovaSeq6000 |
-
ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ-ନାନୋପୋର |
ମେଟେଜେନୋମିକ୍ସ ହେଉଛି ଏକ ମଲିକୁଲାର ଉପକରଣ ଯାହାକି ପରିବେଶ ନମୁନାରୁ ବାହାର କରାଯାଇଥିବା ମିଶ୍ରିତ ଜେନୋମିକ୍ ସାମଗ୍ରୀକୁ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବା ପାଇଁ ବ୍ୟବହୃତ ହୁଏ, ଯାହାକି ପ୍ରଜାତିର ବିବିଧତା ଏବଂ ପ୍ରଚୁରତା, ଜନସଂଖ୍ୟା ଗଠନ, ଫାଇଲୋଜେନେଟିକ୍ ସମ୍ପର୍କ, କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଜିନ୍ ଏବଂ ପରିବେଶ କାରକ ସହିତ ସମ୍ପର୍କ ନେଟୱାର୍କ ଇତ୍ୟାଦି ବିଷୟରେ ବିସ୍ତୃତ ସୂଚନା ପ୍ରଦାନ କରିଥାଏ | ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ଅଧ୍ୟୟନ ପାଇଁ |ପଠନ ଦ length ର୍ଘ୍ୟରେ ଏହାର ଉଲ୍ଲେଖନୀୟ କାର୍ଯ୍ୟଦକ୍ଷତା ମୁଖ୍ୟତ down ଡାଉନ୍ ଷ୍ଟ୍ରିମ୍ ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ଆନାଲିସିସ୍, ବିଶେଷତ met ମେଟେଜେନୋମ୍ ଆସେମ୍ବଲିକୁ ବ anced ାଇଥାଏ |ପଠନ-ଦ length ର୍ଘ୍ୟର ସୁବିଧା ଗ୍ରହଣ କରି, ନାନୋପୋର-ଆଧାରିତ ମେଟେଜେନୋମିକ୍ ଅଧ୍ୟୟନ ଶଟ-ବନ୍ଧୁକ ମେଟେଜେନୋମିକ୍ସ ତୁଳନାରେ ଅଧିକ ନିରନ୍ତର ସମାବେଶ ହାସଲ କରିବାକୁ ସକ୍ଷମ ଅଟେ |ଏହା ପ୍ରକାଶିତ ହୋଇଛି ଯେ ନାନୋପୋର-ଆଧାରିତ ମେଟେଜେନୋମିକ୍ସ ସଫଳତାର ସହିତ ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମରୁ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଏବଂ ବନ୍ଦ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଜେନୋମ ସୃଷ୍ଟି କରିଛି (ମୋସ୍, ଏଲ୍, ଇତ୍ୟାଦି,ପ୍ରକୃତି ବାୟୋଟେକ୍ |, 2020)
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：Nanopore PromethION P48 |
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-PacBio |
16S ଏବଂ 18S rRNA ରେ ଥିବା ସବନିଟ୍, ଉଭୟ ଅତ୍ୟଧିକ ସଂରକ୍ଷିତ ଏବଂ ହାଇପର-ଭେରିଏବଲ୍ ଅଞ୍ଚଳ ଧାରଣ କରିଥିବା ପ୍ରୋକାରିଓଟିକ୍ ଏବଂ ଇଉକାରିଓଟିକ୍ ଜୀବ ଚିହ୍ନଟ ପାଇଁ ଏକ ଉପଯୁକ୍ତ ମଲିକୁଲାର ଫିଙ୍ଗର ପ୍ରିଣ୍ଟ |ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗର ଲାଭ ଉଠାଇ, ସଂରକ୍ଷିତ ଅଂଶଗୁଡିକ ଉପରେ ଆଧାର କରି ଏହି ଆମ୍ପଲିକନ୍ଗୁଡ଼ିକୁ ଟାର୍ଗେଟ୍ କରାଯାଇପାରିବ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ବିବିଧତା ବିଶ୍ଳେଷଣ, ଟ୍ୟାକ୍ସୋନୋମି, ଫାଇଲୋଜେନି ଇତ୍ୟାଦି ଅଧ୍ୟୟନକୁ ସାହାଯ୍ୟ କରୁଥିବା ହାଇପର-ଭେରିଏବଲ୍ ଅଞ୍ଚଳଗୁଡିକ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଭାବରେ ବର୍ଣ୍ଣିତ ହୋଇପାରିବ | ଏକକ-ଅଣୁଗୁଡ଼ିକ ରିଅଲ୍-ଟାଇମ୍ (SMRT) | ) PacBio ପ୍ଲାଟଫର୍ମର ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଅତି ସଠିକ୍ ଲମ୍ବା ପଠନ ପାଇବାକୁ ସକ୍ଷମ କରିଥାଏ, ଯାହା ପୂର୍ଣ୍ଣ ଦ length ର୍ଘ୍ୟ ଆମ୍ପଲିକନ୍ (ପାଖାପାଖି 1.5 Kb) କୁ ଆବୃତ କରିପାରେ |ଜେନେଟିକ୍ କ୍ଷେତ୍ରର ବିସ୍ତୃତ ଦୃଶ୍ୟ ଜୀବାଣୁ କିମ୍ବା କବକ ସମ୍ପ୍ରଦାୟରେ ପ୍ରଜାତିର ଟିପ୍ପଣୀରେ ରେଜୋଲୁସନକୁ ବହୁଗୁଣିତ କରିଥିଲା |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：PacBio Sequel II |
-
16S / 18S / ITS Amplicon Sequencing-NGS |
16S / 18S / ITS ଆମ୍ପଲିକନ୍ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଙ୍ଗ୍ ଏକ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ସମ୍ପ୍ରଦାୟରେ ଫାଇଲୋଜେନ୍, ଟ୍ୟାକ୍ସୋନୋମି ଏବଂ ପ୍ରଜାତିର ପ୍ରଚୁରତାକୁ ପ୍ରକାଶ କରିବା ପାଇଁ ଲକ୍ଷ୍ୟ ରଖିଛି ଯାହା ଗୃହରକ୍ଷୀ ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କର PCR ଉତ୍ପାଦଗୁଡିକ ଯାଞ୍ଚ କରିଥାଏ ଯାହା ଉଭୟ ଅତ୍ୟଧିକ ବାର୍ତ୍ତାଳାପ ଏବଂ ହାଇପରଭାରିଏବଲ୍ ଅଂଶ ଧାରଣ କରିଥାଏ |Woeses et al, (1977) ଦ୍ perfect ାରା ଏହି ସିଦ୍ଧ ମଲିକୁଲାର ଫିଙ୍ଗର ପ୍ରିଣ୍ଟର ପରିଚୟ, ବିଚ୍ଛିନ୍ନତା ମୁକ୍ତ ମାଇକ୍ରୋବିଓମ ପ୍ରୋଫାଇଲକୁ ଶକ୍ତି ପ୍ରଦାନ କରେ |16S (ଜୀବାଣୁ), 18S (ଫଙ୍ଗି) ଏବଂ ଆଭ୍ୟନ୍ତରୀଣ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପଡ୍ ସ୍ପେସର୍ (ITS, ଫଙ୍ଗି) ର କ୍ରମ ଉଭୟ ପ୍ରଚୁର ପ୍ରଜାତିର ତଥା ବିରଳ ତଥା ଅଜ୍ଞାତ ପ୍ରଜାତିର ଚିହ୍ନଟ କରିବାକୁ ଅନୁମତି ଦିଏ |ଏହି ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ବିଭିନ୍ନ ପରିବେଶରେ ଭିନ୍ନ ଭିନ୍ନ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ରଚନା ଚିହ୍ନଟ କରିବାରେ ଏକ ବ୍ୟାପକ ପ୍ରୟୋଗ ଏବଂ ପ୍ରମୁଖ ଉପକରଣ ହୋଇପାରିଛି, ଯେପରିକି ମାନବ ମୁଖ, ଅନ୍ତନଳୀ, ମଳ ଇତ୍ୟାଦି |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：Illumina NovaSeq6000 |
-
ଜୀବାଣୁ ଏବଂ ଫଙ୍ଗଲ୍ ପୁରା ଜେନୋମ୍ ପୁନ - କ୍ରମ |
ଜଣାଶୁଣା ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଏବଂ କବକଗୁଡିକର ଜିନୋମକୁ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ କରିବା ସହିତ ଏକାଧିକ ଜିନୋମକୁ ତୁଳନା କରିବା କିମ୍ବା ନୂତନ ଜୀବମାନଙ୍କର ଜେନୋମ ମାନଚିତ୍ର କରିବା ପାଇଁ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଏବଂ ଫଙ୍ଗଲ୍ ପୁରା ଜିନୋମ୍ ପୁନ - କ୍ରମ ଏକ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ଉପକରଣ |ସଠିକ୍ ରେଫରେନ୍ସ ଜେନୋମ ସୃଷ୍ଟି କରିବା, ମାଇକ୍ରୋବାୟାଲ୍ ଆଇଡେଣ୍ଟିଫିକେସନ୍ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ତୁଳନାତ୍ମକ ଜେନୋମ ଅଧ୍ୟୟନ କରିବା ପାଇଁ ଜୀବାଣୁ ଏବଂ ଫୁଙ୍ଗିର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜେନୋମଗୁଡିକୁ କ୍ରମରେ ରଖିବା ଅତ୍ୟନ୍ତ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ: ଇଲୁମିନା ନୋଭା ସେକ୍ 6000 |
-
ଫଙ୍ଗଲ୍ ଜେନୋମ୍ |
ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଅନୁସନ୍ଧାନ ଲକ୍ଷ୍ୟ ଉପରେ ନିର୍ଭର କରି ବାୟୋମାର୍କର ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ଜିନୋମ ସର୍ଭେ, ସୂକ୍ଷ୍ମ ଜିନୋମ ଏବଂ ଫଙ୍ଗଲର ପେନ୍-ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ ପ୍ରଦାନ କରେ |ଜେନୋମ ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ, ଆସେମ୍ବଲି ଏବଂ ଫଙ୍କସନାଲ ଟିପ୍ପଣୀ ପରବର୍ତ୍ତୀ ପି generation ଼ିର ସିକ୍ୱେନ୍ସିଂ + ତୃତୀୟ ପି generation ଼ିର କ୍ରମକୁ ଉଚ୍ଚ ସ୍ତରୀୟ ଜିନୋମ ଆସେମ୍ବଲି ମିଶ୍ରଣ କରି ହାସଲ କରାଯାଇପାରିବ |କ୍ରୋମୋଜୋମ୍ ସ୍ତରରେ ଜିନୋମ୍ ଆସେମ୍ବଲିକୁ ସୁଗମ କରିବା ପାଇଁ ହାଇ-ସି ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ମଧ୍ୟ ନିୟୋଜିତ ହୋଇପାରିବ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：PacBio Sequel II |
Nanopore PromethION P48 |
ଇଲୁମିନା ନୋଭା ସେକ୍ 6000 |
-
ଜୀବାଣୁ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜେନୋମ |
ବାୟୋମାର୍କର ଟେକ୍ନୋଲୋଜି ଶୂନ୍ୟ ବ୍ୟବଧାନରେ ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ ନିର୍ମାଣ ଉପରେ କ୍ରମାନ୍ୱୟରେ ସେବା ପ୍ରଦାନ କରେ |ଜୀବାଣୁ ସଂପୂର୍ଣ୍ଣ ଜିନୋମ ନିର୍ମାଣର ମୁଖ୍ୟ କାର୍ଯ୍ୟ ପ୍ରବାହରେ ତୃତୀୟ ପି generation ଼ିର କ୍ରମ, ସମାବେଶ, କାର୍ଯ୍ୟକ୍ଷମ ଟିପ୍ପଣୀ ଏବଂ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ଅନୁସନ୍ଧାନ ଲକ୍ଷ୍ୟ ପୂରଣ କରୁଥିବା ଉନ୍ନତ ଜ o ବ ସୂଚନା ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ବିଶ୍ଳେଷଣ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ |ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆ ଜିନୋମର ଏକ ବିସ୍ତୃତ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ସେମାନଙ୍କର ଜ ological ବିକ ପ୍ରକ୍ରିୟାଗୁଡ଼ିକର ମ fundamental ଳିକ ଯନ୍ତ୍ରକ reve ଶଳର ପ୍ରକାଶନକୁ ସଶକ୍ତ କରିଥାଏ, ଯାହା ଉଚ୍ଚ ଇଉକାରିଓଟିକ୍ ପ୍ରଜାତିର ଜେନୋମିକ୍ ଅନୁସନ୍ଧାନ ପାଇଁ ମଧ୍ୟ ମୂଲ୍ୟବାନ ସନ୍ଦର୍ଭ ପ୍ରଦାନ କରିପାରିବ |
ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ：Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000 |
PacBio Sequel II |
