ਲੰਬੀ ਗੈਰ-ਕੋਡਿੰਗ ਕ੍ਰਮ-ਇਲੁਮਿਨਾ
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
● ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
● ਸੈਲੂਲਰ ਅਤੇ ਟਿਸ਼ੂ ਖਾਸ
● ਖਾਸ ਪੜਾਅ ਗਤੀਸ਼ੀਲ ਸਮੀਕਰਨ ਤਬਦੀਲੀ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਪੇਸ਼ ਕਰਦਾ ਹੈ
● ਸਮੇਂ ਅਤੇ ਸਪੇਸ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਸਟੀਕ ਪੈਟਰਨ
● mRNA ਡੇਟਾ ਦੇ ਨਾਲ ਸੰਯੁਕਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ।
● BMKCloud-ਆਧਾਰਿਤ ਨਤੀਜਾ ਡਿਲੀਵਰੀ: ਪਲੇਟਫਾਰਮ 'ਤੇ ਕਸਟਮਾਈਜ਼ਡ ਡਾਟਾ ਮਾਈਨਿੰਗ ਉਪਲਬਧ ਹੈ।
● ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਪੂਰਾ ਹੋਣ 'ਤੇ 3 ਮਹੀਨਿਆਂ ਲਈ ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ ਵੈਧ ਹੁੰਦੀਆਂ ਹਨ
ਨਮੂਨਾ ਲੋੜਾਂ ਅਤੇ ਡਿਲਿਵਰੀ
| ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ | ਪਲੇਟਫਾਰਮ | ਸਿਫ਼ਾਰਸ਼ੀ ਡੇਟਾ | ਡਾਟਾ QC |
| rRNA ਦੀ ਕਮੀ | ਇਲੁਮਿਨਾ PE150 | 10 ਜੀ.ਬੀ | Q30≥85% |
| Conc.(ng/μl) | ਮਾਤਰਾ (μg) | ਸ਼ੁੱਧਤਾ | ਇਮਾਨਦਾਰੀ |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 ਜੈੱਲ 'ਤੇ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਜਾਂ ਡੀਐਨਏ ਗੰਦਗੀ ਨਹੀਂ ਹੈ। | ਪੌਦਿਆਂ ਲਈ: RIN≥6.5; ਜਾਨਵਰਾਂ ਲਈ: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ਸੀਮਤ ਜਾਂ ਕੋਈ ਬੇਸਲਾਈਨ ਉਚਾਈ ਨਹੀਂ |
ਨਿਊਕਲੀਓਟਾਈਡਸ:
ਟਿਸ਼ੂ: ਭਾਰ (ਸੁੱਕਾ): ≥1 ਗ੍ਰਾਮ
*5 ਮਿਲੀਗ੍ਰਾਮ ਤੋਂ ਛੋਟੇ ਟਿਸ਼ੂ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਫਲੈਸ਼ ਫਰੋਜ਼ਨ (ਤਰਲ ਨਾਈਟ੍ਰੋਜਨ ਵਿੱਚ) ਟਿਸ਼ੂ ਨਮੂਨੇ ਭੇਜਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਸੈੱਲ ਮੁਅੱਤਲ: ਸੈੱਲ ਗਿਣਤੀ = 3×107
*ਅਸੀਂ ਜੰਮੇ ਹੋਏ ਸੈੱਲ ਲਾਈਸੇਟ ਨੂੰ ਭੇਜਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।ਜੇਕਰ ਸੈੱਲ 5×10 ਤੋਂ ਘੱਟ ਗਿਣਦਾ ਹੈ5, ਤਰਲ ਨਾਈਟ੍ਰੋਜਨ ਵਿੱਚ ਫਲੈਸ਼ ਜੰਮਣ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।
ਖੂਨ ਦੇ ਨਮੂਨੇ:
PA×geneBloodRNATube;
6mLTRIzol ਅਤੇ 2mL ਖੂਨ(TRIzol:Blood=3:1)
ਸਿਫਾਰਸ਼ੀ ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਕੰਟੇਨਰ: 2 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਟਿਊਬ (ਟਿਨ ਫੁਆਇਲ ਦੀ ਸਿਫਾਰਸ਼ ਨਹੀਂ ਕੀਤੀ ਜਾਂਦੀ)
ਨਮੂਨਾ ਲੇਬਲਿੰਗ: ਸਮੂਹ + ਨਕਲ ਜਿਵੇਂ ਕਿ A1, A2, A3;B1, B2, B3...
ਸ਼ਿਪਮੈਂਟ:
1. ਡਰਾਈ-ਬਰਫ਼: ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਬੈਗਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਕ ਕਰਨ ਅਤੇ ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼ ਵਿੱਚ ਦਫ਼ਨਾਉਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
2.RNAstable ਟਿਊਬ: RNA ਨਮੂਨੇ RNA ਸਥਿਰਤਾ ਟਿਊਬ (ਜਿਵੇਂ ਕਿ RNAstable®) ਵਿੱਚ ਸੁਕਾਏ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਕਮਰੇ ਦੇ ਤਾਪਮਾਨ ਵਿੱਚ ਭੇਜੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ।
ਸੇਵਾ ਕਾਰਜ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਪ੍ਰਯੋਗ ਡਿਜ਼ਾਈਨ
ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਆਰਐਨਏ ਕੱਢਣ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਉਸਾਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ
ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕਸ
1.LncRNA ਵਰਗੀਕਰਨ
ਉਪਰੋਕਤ ਚਾਰ ਸਾਫਟਵੇਅਰਾਂ ਦੁਆਰਾ ਅਨੁਮਾਨਿਤ LncRNA ਨੂੰ 4 ਸ਼੍ਰੇਣੀਆਂ ਵਿੱਚ ਸ਼੍ਰੇਣੀਬੱਧ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ: lincRNA, ਐਂਟੀ-ਸੈਂਸ-LncRNA, intronic-LncRNA;ਭਾਵਨਾ-LncRNA.LncRNA ਵਰਗੀਕਰਨ ਹੇਠਾਂ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ ਵਿੱਚ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਸੀ।
LncRNA ਵਰਗੀਕਰਣ
2. DE-lncRNA ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਸੀਆਈਐਸ-ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਵਾਲੇ ਜੀਨ
ਕਲੱਸਟਰਪ੍ਰੋਫਾਈਲਰ ਨੂੰ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ, ਅਣੂ ਫੰਕਸ਼ਨਾਂ ਅਤੇ ਸੈਲੂਲਰ ਭਾਗਾਂ ਦੇ ਸੰਦਰਭ ਵਿੱਚ, ਵਿਭਿੰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਗਏ lncRNA (DE-lncRNA) ਦੇ ਸੀਆਈਐਸ-ਟਾਰਗੇਟਡ ਜੀਨਾਂ 'ਤੇ ਜੀਓ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਨਿਯੁਕਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।GO ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਵਿੱਚ ਡੀਈਜੀ-ਨਿਰਦੇਸ਼ਿਤ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਭਰਪੂਰ GO ਸ਼ਬਦਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆ ਹੈ।ਸੰਪੂਰਨ ਸ਼ਬਦਾਂ ਨੂੰ ਹਿਸਟੋਗ੍ਰਾਮ, ਬਬਲ ਚਾਰਟ, ਆਦਿ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਹੇਠਾਂ ਦਿਖਾਇਆ ਗਿਆ ਹੈ।
DE-lncRNA ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਸੀਆਈਐਸ-ਨਿਸ਼ਾਨਾਬੱਧ ਜੀਨ - ਬੁਲਬੁਲਾ ਚਾਰਟ
3. mRNA ਅਤੇ lncRNA ਦੀ ਲੰਬਾਈ, ਐਕਸੋਨ ਨੰਬਰ, ORF ਅਤੇ ਸਮੀਕਰਨ ਦੀ ਮਾਤਰਾ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਕੇ, ਅਸੀਂ ਉਹਨਾਂ ਵਿਚਕਾਰ ਬਣਤਰ, ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਇਸ ਤਰ੍ਹਾਂ ਦੇ ਅੰਤਰਾਂ ਨੂੰ ਸਮਝ ਸਕਦੇ ਹਾਂ, ਅਤੇ ਇਹ ਵੀ ਪੁਸ਼ਟੀ ਕਰ ਸਕਦੇ ਹਾਂ ਕਿ ਕੀ ਸਾਡੇ ਦੁਆਰਾ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕੀਤੀ ਗਈ ਨਾਵਲ lncRNA ਆਮ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾਵਾਂ ਦੇ ਅਨੁਕੂਲ ਹੈ ਜਾਂ ਨਹੀਂ।
BMK ਕੇਸ
KRAS-G12D ਪਰਿਵਰਤਨ ਅਤੇ P53 ਨਾਕਆਊਟ ਦੇ ਨਾਲ ਮਾਊਸ ਫੇਫੜਿਆਂ ਦੇ ਐਡੀਨੋਕਾਰਸੀਨੋਮਾਸ ਵਿੱਚ ਡੀਨਿਯਮਿਤ lncRNA ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ
ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ:ਜਰਨਲ ਆਫ਼ ਸੈਲੂਲਰ ਐਂਡ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਮੈਡੀਸਨ,2019
ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ
ਇਲੁਮਿਨਾ
ਨਮੂਨਾ ਸੰਗ੍ਰਹਿ
NONMMUT015812-ਨੌਕਡਾਊਨ KP (shRNA-2) ਸੈੱਲ ਅਤੇ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਨਿਯੰਤਰਣ (sh-Scr) ਸੈੱਲ ਇੱਕ ਖਾਸ ਵਾਇਰਲ ਲਾਗ ਦੇ 6ਵੇਂ ਦਿਨ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ।
ਮੁੱਖ ਨਤੀਜੇ
ਇਹ ਅਧਿਐਨ P53 ਨਾਕਆਊਟ ਅਤੇ KrasG12D ਪਰਿਵਰਤਨ ਦੇ ਨਾਲ ਮਾਊਸ ਦੇ ਫੇਫੜੇ ਦੇ ਐਡੀਨੋਕਾਰਸੀਨੋਮਾ ਵਿੱਚ ਅਸਪਸ਼ਟ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਗਏ lncRNAs ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਦਾ ਹੈ।
1.6424 lncRNAs ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਗਏ ਸਨ (≥ 2-ਗੁਣਾ ਤਬਦੀਲੀ, P <0.05)।
2. ਸਾਰੇ 210 lncRNAs(FC≥8) ਵਿੱਚੋਂ, 11 lncRNAs ਦੇ ਸਮੀਕਰਨ ਨੂੰ P53 ਦੁਆਰਾ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, 33 lncRNAs ਦੁਆਰਾ KRAS ਅਤੇ 13 lncRNAs ਨੂੰ ਪ੍ਰਾਇਮਰੀ ਕੇਪੀ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਹਾਈਪੌਕਸਿਆ ਦੁਆਰਾ, ਕ੍ਰਮਵਾਰ।
3.NONMMUT015812, ਜੋ ਕਿ ਮਾਊਸ ਦੇ ਫੇਫੜੇ ਦੇ ਐਡੀਨੋਕਾਰਸੀਨੋਮਾ ਵਿੱਚ ਅਨੋਖੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ ਅਤੇ P53 ਰੀ-ਐਕਸਪ੍ਰੇਸ਼ਨ ਦੁਆਰਾ ਨਕਾਰਾਤਮਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਇਸਦੇ ਸੈਲੂਲਰ ਫੰਕਸ਼ਨ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਖੋਜਿਆ ਗਿਆ ਸੀ।
4. shRNAs ਦੁਆਰਾ NONMMUT015812 ਦੇ ਨਾਕਡਾਊਨ ਨਾਲ KP ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਪ੍ਰਸਾਰ ਅਤੇ ਮਾਈਗ੍ਰੇਸ਼ਨ ਯੋਗਤਾਵਾਂ ਵਿੱਚ ਕਮੀ ਆਈ ਹੈ।NONMMUT015812 ਇੱਕ ਸੰਭਾਵੀ ਓਨਕੋਜੀਨ ਸੀ।
 NONMMUT015812-ਨੌਕਡਾਊਨ KP ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਦਾ KEGG ਮਾਰਗ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ |  NONMMUT015812-ਨੌਕਡਾਊਨ ਕੇਪੀ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਵੱਖਰੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ ਦਾ ਜੀਨ ਓਨਟੋਲੋਜੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ |
ਹਵਾਲਾ
KRAS-G12D ਪਰਿਵਰਤਨ ਅਤੇ P53 ਨਾਕਆਊਟ [J] ਦੇ ਨਾਲ ਮਾਊਸ ਦੇ ਫੇਫੜੇ ਦੇ ਐਡੀਨੋਕਾਰਸੀਨੋਮਾਸ ਵਿੱਚ ਨਿਯੰਤ੍ਰਿਤ lncRNA ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲ।ਜਰਨਲ ਆਫ਼ ਸੈਲੂਲਰ ਐਂਡ ਮੋਲੀਕਿਊਲਰ ਮੈਡੀਸਨ, 2019, 23(10)।DOI: 10.1111/jcmm.14584
