mRNA-seq (NGS) – ਨਵਾਂ

mRNA ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਖਾਸ ਹਾਲਤਾਂ ਵਿੱਚ ਸੈੱਲਾਂ ਵਿੱਚ ਸਾਰੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਦੀ ਆਗਿਆ ਦਿੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਇਹ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੋਜ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਵਰਤੀ ਜਾਣ ਵਾਲੀ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਹੈ। BMKCloud De novo mRNA-seq ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਪੌਲੀ-ਏ ਐਨਰਿਚਡ ਸੀਕੁਐਂਸਿੰਗ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀਆਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ ਜਦੋਂ ਕੋਈ ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਉਪਲਬਧ ਨਹੀਂ ਹੁੰਦਾ। ਪਾਈਪਲਾਈਨ ਗੁਣਵੱਤਾ ਨਿਯੰਤਰਣ ਨਾਲ ਸ਼ੁਰੂ ਹੁੰਦੀ ਹੈ, ਜਿਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦਨਵਾਂ ਕੀ ਹੈਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਯੂਨੀਜੀਨ ਸੈੱਟ ਚੋਣ। ਯੂਨੀਜੀਨ ਬਣਤਰ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕੋਡਿੰਗ ਕ੍ਰਮ (CDS) ਅਤੇ ਸਧਾਰਨ ਕ੍ਰਮ ਦੁਹਰਾਓ (SSR) ਦੀ ਭਵਿੱਖਬਾਣੀ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਵਿਭਿੰਨ ਪ੍ਰਗਟਾਵੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟੈਸਟ ਕੀਤੀਆਂ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਤੌਰ 'ਤੇ ਪ੍ਰਗਟ ਕੀਤੇ ਜੀਨਾਂ (DEGs) ਨੂੰ ਲੱਭਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਜੈਵਿਕ ਸੂਝਾਂ ਨੂੰ ਕੱਢਣ ਲਈ DEGs ਦਾ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਸੰਸ਼ੋਧਨ ਕੀਤਾ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।