-
ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਇਮਯੂਨੋਪ੍ਰੀਸੀਪੀਟੇਸ਼ਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ChIP-seq)
ChIP-Seq ਹਿਸਟੋਨ ਸੋਧ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਕਾਰਕਾਂ, ਅਤੇ ਹੋਰ ਡੀਐਨਏ-ਸਬੰਧਤ ਪ੍ਰੋਟੀਨ ਲਈ ਡੀਐਨਏ ਟੀਚਿਆਂ ਦੀ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।ਇਹ ਖਾਸ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਡੀਐਨਏ ਕੰਪਲੈਕਸਾਂ ਨੂੰ ਮੁੜ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਲਈ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਇਮਯੂਨੋ-ਪ੍ਰੀਪੀਟੇਸ਼ਨ (ChIP) ਦੀ ਚੋਣ ਨੂੰ ਜੋੜਦਾ ਹੈ, ਜਿਸ ਨਾਲ ਬਰਾਮਦ ਕੀਤੇ ਗਏ ਡੀਐਨਏ ਦੇ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁਟ ਕ੍ਰਮ ਲਈ ਅਗਲੀ ਪੀੜ੍ਹੀ ਦੇ ਕ੍ਰਮ (NGS) ਦੀ ਸ਼ਕਤੀ ਹੈ।ਇਸ ਤੋਂ ਇਲਾਵਾ, ਕਿਉਂਕਿ ਪ੍ਰੋਟੀਨ-ਡੀਐਨਏ ਕੰਪਲੈਕਸ ਜੀਵਿਤ ਸੈੱਲਾਂ ਤੋਂ ਬਰਾਮਦ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸੈੱਲ ਕਿਸਮਾਂ ਅਤੇ ਟਿਸ਼ੂਆਂ ਵਿੱਚ, ਜਾਂ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਸਥਿਤੀਆਂ ਵਿੱਚ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ।ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨਲ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟਲ ਪਾਥਵੇਅਜ਼ ਤੋਂ ਲੈ ਕੇ ਬਿਮਾਰੀ ਦੇ ਮਕੈਨਿਜ਼ਮ ਤੱਕ ਅਤੇ ਇਸ ਤੋਂ ਵੀ ਅੱਗੇ ਹਨ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ -ਐਨ.ਜੀ.ਐਸ
ਮੈਟਾਜੀਨੋਮ ਜੀਵਾਣੂਆਂ ਦੇ ਮਿਸ਼ਰਤ ਸਮੂਹ ਦੇ ਕੁੱਲ ਜੈਨੇਟਿਕ ਸਾਮੱਗਰੀ ਦੇ ਸੰਗ੍ਰਹਿ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਵਾਤਾਵਰਣਕ ਮੈਟਾਜੀਨੋਮ, ਮਨੁੱਖੀ ਮੈਟਾਜੀਨੋਮ, ਆਦਿ। ਇਸ ਵਿੱਚ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਅਤੇ ਗੈਰ ਕਾਸ਼ਤਯੋਗ ਸੂਖਮ ਜੀਵਾਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਇੱਕ ਅਣੂ ਟੂਲ ਹੈ ਜੋ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਤੋਂ ਕੱਢੇ ਗਏ ਮਿਸ਼ਰਤ ਜੀਨੋਮਿਕ ਪਦਾਰਥਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਅਤੇ ਭਰਪੂਰਤਾ, ਆਬਾਦੀ ਦੀ ਬਣਤਰ, ਫਾਈਲੋਜੈਨੀਟਿਕ ਸਬੰਧ, ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣਕ ਕਾਰਕਾਂ ਦੇ ਨਾਲ ਸਬੰਧਾਂ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਵਿੱਚ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਜਾਣਕਾਰੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ:Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-ਨੈਨੋਪੋਰ
ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਇੱਕ ਅਣੂ ਟੂਲ ਹੈ ਜੋ ਵਾਤਾਵਰਣ ਦੇ ਨਮੂਨਿਆਂ ਤੋਂ ਕੱਢੇ ਗਏ ਮਿਸ਼ਰਤ ਜੀਨੋਮਿਕ ਪਦਾਰਥਾਂ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਕਰਨ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਅਤੇ ਭਰਪੂਰਤਾ, ਆਬਾਦੀ ਦੀ ਬਣਤਰ, ਫਾਈਲੋਜੈਨੇਟਿਕ ਸਬੰਧ, ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਜੀਨਾਂ ਅਤੇ ਵਾਤਾਵਰਣਕ ਕਾਰਕਾਂ ਨਾਲ ਸਬੰਧਾਂ ਦੇ ਨੈਟਵਰਕ ਆਦਿ ਵਿੱਚ ਵਿਸਤ੍ਰਿਤ ਜਾਣਕਾਰੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ। ਨੈਨੋਪੋਰ ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ ਪਲੇਟਫਾਰਮਾਂ ਨੇ ਹਾਲ ਹੀ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤਾ ਹੈ। metagenomic ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ.ਪੜ੍ਹਨ ਦੀ ਲੰਬਾਈ ਵਿੱਚ ਇਸਦੀ ਸ਼ਾਨਦਾਰ ਕਾਰਗੁਜ਼ਾਰੀ ਨੇ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਡਾਊਨ ਸਟ੍ਰੀਮ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਮੇਟਾਜੇਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਨੂੰ ਵਧਾਇਆ ਹੈ।ਰੀਡ-ਲੰਬਾਈ ਦਾ ਫਾਇਦਾ ਉਠਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, ਨੈਨੋਪੋਰ-ਅਧਾਰਿਤ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕ ਅਧਿਐਨ ਸ਼ਾਟ-ਗਨ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਨਿਰੰਤਰ ਅਸੈਂਬਲੀ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਹੈ।ਇਹ ਪ੍ਰਕਾਸ਼ਿਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ ਕਿ ਨੈਨੋਪੋਰ-ਅਧਾਰਤ ਮੈਟਾਜੇਨੋਮਿਕਸ ਨੇ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਓਮਜ਼ (ਮੌਸ, ਈ.ਐਲ., ਏਟ. ਅਲ,ਕੁਦਰਤ ਬਾਇਓਟੈਕ, 2020)
ਪਲੇਟਫਾਰਮ:ਨੈਨੋਪੋਰ ਪ੍ਰੋਮੇਥੀਅਨ ਪੀ 48
-
ਪੂਰਾ ਜੀਨੋਮ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ
ਸਾਇਟੋਸਾਈਨ (5-mC) ਵਿੱਚ ਪੰਜਵੇਂ ਸਥਾਨ 'ਤੇ ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਦਾ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਸੈਲੂਲਰ ਗਤੀਵਿਧੀ 'ਤੇ ਇੱਕ ਬੁਨਿਆਦੀ ਪ੍ਰਭਾਵ ਹੈ।ਅਸਧਾਰਨ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਪੈਟਰਨ ਕਈ ਹਾਲਤਾਂ ਅਤੇ ਬਿਮਾਰੀਆਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਕੈਂਸਰ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਹੋਏ ਹਨ।WGBS ਸਿੰਗਲ ਬੇਸ ਰੈਜ਼ੋਲਿਊਸ਼ਨ 'ਤੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਾਈਡ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਦਾ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ ਸੋਨੇ ਦਾ ਮਿਆਰ ਬਣ ਗਿਆ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
ਹਾਈ ਥ੍ਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ (ATAC-seq) ਦੇ ਨਾਲ ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਜ਼-ਪਹੁੰਚਯੋਗ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਲਈ ਪਰਖ
ATAC-seq ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਅਸੈਸਬਿਲਟੀ ਦੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਲਈ ਇੱਕ ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਵਿਧੀ ਹੈ, ਜੋ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਦੇ ਗਲੋਬਲ ਐਪੀਜੇਨੇਟਿਕ ਨਿਯੰਤਰਣ ਲਈ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਅਡਾਪਟਰ ਹਾਈਪਰਐਕਟਿਵ Tn5 ਟ੍ਰਾਂਸਪੋਸੇਸ ਦੁਆਰਾ ਖੁੱਲੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਪਾਏ ਜਾਂਦੇ ਹਨ।ਪੀਸੀਆਰ ਐਂਪਲੀਫੀਕੇਸ਼ਨ ਤੋਂ ਬਾਅਦ, ਇੱਕ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਬਣਾਈ ਜਾਂਦੀ ਹੈ।ਸਾਰੇ ਖੁੱਲੇ ਕ੍ਰੋਮੈਟਿਨ ਖੇਤਰ ਇੱਕ ਖਾਸ ਸਪੇਸ-ਟਾਈਮ ਸਥਿਤੀ ਦੇ ਅਧੀਨ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ, ਨਾ ਸਿਰਫ ਇੱਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਸ਼ਨ ਕਾਰਕ ਦੀਆਂ ਬਾਈਡਿੰਗ ਸਾਈਟਾਂ, ਜਾਂ ਇੱਕ ਖਾਸ ਹਿਸਟੋਨ ਸੰਸ਼ੋਧਿਤ ਖੇਤਰ ਤੱਕ ਸੀਮਿਤ ਨਹੀਂ।
-
16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-PacBio
16S ਅਤੇ 18S rRNA 'ਤੇ ਸਬ-ਯੂਨਿਟ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਅਤੇ ਹਾਈਪਰ-ਵੇਰੀਏਬਲ ਖੇਤਰ ਹੁੰਦੇ ਹਨ, ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਅਤੇ ਯੂਕੇਰੀਓਟਿਕ ਜੀਵਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਲਈ ਇੱਕ ਸੰਪੂਰਨ ਅਣੂ ਫਿੰਗਰਪ੍ਰਿੰਟ ਹੈ।ਕ੍ਰਮ ਦਾ ਫਾਇਦਾ ਉਠਾਉਂਦੇ ਹੋਏ, ਇਹਨਾਂ ਐਂਪਲੀਕਨਾਂ ਨੂੰ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਹਿੱਸਿਆਂ ਦੇ ਅਧਾਰ ਤੇ ਨਿਸ਼ਾਨਾ ਬਣਾਇਆ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਹਾਈਪਰ-ਵੇਰੀਏਬਲ ਖੇਤਰਾਂ ਨੂੰ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ, ਵਰਗੀਕਰਨ, ਫਾਈਲੋਜਨੀ, ਆਦਿ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਨ ਵਾਲੇ ਅਧਿਐਨਾਂ ਵਿੱਚ ਯੋਗਦਾਨ ਪਾਉਣ ਵਾਲੇ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਪਛਾਣ ਲਈ ਪੂਰੀ ਤਰ੍ਹਾਂ ਵਿਸ਼ੇਸ਼ਤਾ ਦਿੱਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ। ਸਿੰਗਲ-ਮੌਲੀਕਿਊਲ ਰੀਅਲ-ਟਾਈਮ (SMRT ) PacBio ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਦੀ ਕ੍ਰਮਬੱਧਤਾ ਬਹੁਤ ਹੀ ਸਹੀ ਲੰਬੇ ਰੀਡਜ਼ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਬਣਾਉਂਦੀ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਵਾਲੇ ਐਂਪਲੀਕਨ (ਲਗਭਗ 1.5 Kb) ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ।ਜੈਨੇਟਿਕ ਫੀਲਡ ਦੇ ਵਿਆਪਕ ਦ੍ਰਿਸ਼ਟੀਕੋਣ ਨੇ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਜਾਂ ਫੰਜਾਈ ਭਾਈਚਾਰੇ ਵਿੱਚ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਵਿੱਚ ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਨੂੰ ਬਹੁਤ ਵਧਾਇਆ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ:PacBio ਸੀਕਵਲ II
-
16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ-NGS
16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕਵੈਂਸਿੰਗ ਦਾ ਉਦੇਸ਼ ਹਾਊਸਕੀਪਿੰਗ ਜੈਨੇਟਿਕ ਮਾਰਕਰਾਂ ਦੇ ਪੀਸੀਆਰ ਉਤਪਾਦਾਂ ਦੀ ਜਾਂਚ ਕਰਕੇ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਕਮਿਊਨਿਟੀ ਵਿੱਚ ਫਾਈਲੋਜੀਨੀ, ਵਰਗੀਕਰਨ, ਅਤੇ ਪ੍ਰਜਾਤੀਆਂ ਦੀ ਬਹੁਤਾਤ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਨਾ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਬਹੁਤ ਜ਼ਿਆਦਾ ਪਰਿਵਰਤਿਤ ਅਤੇ ਹਾਈਪਰਵੇਰੀਏਬਲ ਦੋਵੇਂ ਹਿੱਸੇ ਹੁੰਦੇ ਹਨ।Woeses et al, (1977) ਦੁਆਰਾ ਇਹਨਾਂ ਸੰਪੂਰਨ ਅਣੂ ਫਿੰਗਰਪ੍ਰਿੰਟ ਦੀ ਸ਼ੁਰੂਆਤ ਆਈਸੋਲੇਸ਼ਨ-ਮੁਕਤ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਓਮ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ।16S (ਬੈਕਟੀਰੀਆ), 18S (ਫੰਜਾਈ) ਅਤੇ ਅੰਦਰੂਨੀ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਡ ਸਪੇਸਰ (ITS, ਫੰਜਾਈ) ਦੀ ਕ੍ਰਮਬੱਧਤਾ ਭਰਪੂਰ ਕਿਸਮਾਂ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਦੁਰਲੱਭ ਅਤੇ ਅਣਪਛਾਤੀ ਕਿਸਮਾਂ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੀ ਇਜਾਜ਼ਤ ਦਿੰਦੀ ਹੈ।ਇਹ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਵਿਭਿੰਨ ਵਾਤਾਵਰਣਾਂ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਮਨੁੱਖੀ ਮੂੰਹ, ਅੰਤੜੀਆਂ, ਮਲ, ਆਦਿ ਵਿੱਚ ਵਿਭਿੰਨ ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਰਚਨਾ ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲਾਗੂ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮੁੱਖ ਸਾਧਨ ਬਣ ਗਈ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ:Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਫੰਗਲ ਹੋਲ ਜੀਨੋਮ ਰੀ-ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ
ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਫੰਗਲ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਰੀ-ਸੀਕੈਂਸਿੰਗ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਫੰਜਾਈ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਕਈ ਜੀਨੋਮ ਦੀ ਤੁਲਨਾ ਕਰਨ ਜਾਂ ਨਵੇਂ ਜੀਵਾਣੂਆਂ ਦੇ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕਰਨ ਲਈ ਇੱਕ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਸਾਧਨ ਹੈ।ਸਹੀ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਤਿਆਰ ਕਰਨ, ਮਾਈਕ੍ਰੋਬਾਇਲ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਹੋਰ ਤੁਲਨਾਤਮਕ ਜੀਨੋਮ ਅਧਿਐਨ ਕਰਨ ਲਈ ਬੈਕਟੀਰੀਆ ਅਤੇ ਫੰਜਾਈ ਦੇ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਨੂੰ ਕ੍ਰਮਬੱਧ ਕਰਨਾ ਬਹੁਤ ਮਹੱਤਵਪੂਰਨ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
PacBio-ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ 16S/18S/ITS ਐਂਪਲੀਕਨ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ
ਐਮਪਲੀਕਨ (16S/18S/ITS) ਪਲੇਟਫਾਰਮ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਵਿਭਿੰਨਤਾ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਵਿੱਚ ਸਾਲਾਂ ਦੇ ਤਜ਼ਰਬੇ ਨਾਲ ਵਿਕਸਤ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਮਿਆਰੀ ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸ਼ਾਮਲ ਹਨ: ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਮੌਜੂਦਾ ਮਾਈਕਰੋਬਾਇਲ ਖੋਜ ਦੀ ਮੁੱਖ ਧਾਰਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਮੱਗਰੀ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਦਾ ਹੈ, ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਸਮੱਗਰੀ ਅਮੀਰ ਅਤੇ ਵਿਆਪਕ ਹੈ, ਅਤੇ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ ਰਿਪੋਰਟਾਂ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਪੇਸ਼ ਕੀਤੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ;ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ ਵਿਭਿੰਨ ਹੈ.ਨਮੂਨੇ ਚੁਣੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ ਅਤੇ ਵਿਅਕਤੀਗਤ ਲੋੜਾਂ ਨੂੰ ਮਹਿਸੂਸ ਕਰਨ ਲਈ, ਬੁਨਿਆਦੀ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਰਿਪੋਰਟ ਅਤੇ ਖੋਜ ਉਦੇਸ਼ ਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਮਾਪਦੰਡਾਂ ਨੂੰ ਲਚਕਦਾਰ ਢੰਗ ਨਾਲ ਸੈੱਟ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।ਵਿੰਡੋਜ਼ ਓਪਰੇਟਿੰਗ ਸਿਸਟਮ, ਸਧਾਰਨ ਅਤੇ ਤੇਜ਼।
-
PacBio-ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮ (ਗੈਰ-ਸੰਦਰਭ)
ਪੈਸੀਫਿਕ ਬਾਇਓਸਾਇੰਸਸ (PacBio) ਆਈਸੋਫਾਰਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਨੂੰ ਇਨਪੁਟ ਦੇ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲੈ ਕੇ, ਇਹ ਐਪ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਕ੍ਰਮ (ਅਸੈਂਬਲੀ ਤੋਂ ਬਿਨਾਂ) ਦੀ ਪਛਾਣ ਕਰਨ ਦੇ ਯੋਗ ਹੈ।ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਵਿਰੁੱਧ ਪੂਰੀ-ਲੰਬਾਈ ਦੇ ਕ੍ਰਮਾਂ ਨੂੰ ਮੈਪ ਕਰਕੇ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਨੂੰ ਜਾਣੇ-ਪਛਾਣੇ ਜੀਨਾਂ, ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ, ਕੋਡਿੰਗ ਖੇਤਰਾਂ, ਆਦਿ ਦੁਆਰਾ ਅਨੁਕੂਲਿਤ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ। ਇਸ ਸਥਿਤੀ ਵਿੱਚ, mRNA ਬਣਤਰਾਂ ਦੀ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਪਛਾਣ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਵਿਕਲਪਕ ਸਪਲੀਸਿੰਗ, ਆਦਿ, ਪ੍ਰਾਪਤ ਕੀਤੀ ਜਾ ਸਕਦੀ ਹੈ।NGS ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਮ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਡੇਟਾ ਦੇ ਨਾਲ ਸੰਯੁਕਤ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਸਮੀਕਰਨ ਵਿੱਚ ਵਧੇਰੇ ਵਿਆਪਕ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ ਅਤੇ ਵਧੇਰੇ ਸਹੀ ਮਾਤਰਾ ਨੂੰ ਸਮਰੱਥ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ, ਜੋ ਕਿ ਵੱਡੇ ਪੱਧਰ 'ਤੇ ਡਾਊਨਸਟ੍ਰੀਮ ਡਿਫਰੈਂਸ਼ੀਅਲ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਕਾਰਜਸ਼ੀਲ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਨੂੰ ਲਾਭ ਪਹੁੰਚਾਉਂਦਾ ਹੈ।
-
ਘਟੀ ਹੋਈ ਪ੍ਰਤੀਨਿਧਤਾ ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (RRBS)
ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਰੋਗ ਖੋਜ ਵਿੱਚ ਹਮੇਸ਼ਾਂ ਇੱਕ ਗਰਮ ਵਿਸ਼ਾ ਰਿਹਾ ਹੈ, ਅਤੇ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਅਤੇ ਫੀਨੋ-ਟਾਈਪਿਕ ਗੁਣਾਂ ਨਾਲ ਨੇੜਿਓਂ ਸਬੰਧਤ ਹੈ।RRBS DNA ਮੈਥਾਈਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਲਈ ਇੱਕ ਸਹੀ, ਕੁਸ਼ਲ ਅਤੇ ਕਿਫ਼ਾਇਤੀ ਤਰੀਕਾ ਹੈ।ਐਨਜ਼ਾਈਮੈਟਿਕ ਕਲੀਵੇਜ (ਐਮਐਸਪੀ I) ਦੁਆਰਾ ਪ੍ਰਮੋਟਰ ਅਤੇ ਸੀਪੀਜੀ ਟਾਪੂ ਖੇਤਰਾਂ ਦਾ ਸੰਸ਼ੋਧਨ, ਬਿਸਲਫਾਈਟ ਕ੍ਰਮ ਦੇ ਨਾਲ ਮਿਲਾ ਕੇ, ਉੱਚ ਰੈਜ਼ੋਲੂਸ਼ਨ ਡੀਐਨਏ ਮੈਥਿਲੇਸ਼ਨ ਖੋਜ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq ਪਲੇਟਫਾਰਮ
-
ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ mRNA ਕ੍ਰਮ
mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਖਾਸ ਸ਼ਰਤਾਂ ਅਧੀਨ ਸੈੱਲਾਂ ਦੇ ਅੰਦਰ ਸਾਰੇ mRNA ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟਾਂ ਦੀ ਵਿਆਪਕ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਿੰਗ ਨੂੰ ਸ਼ਕਤੀ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦੀ ਹੈ।ਇਹ ਅਤਿ-ਆਧੁਨਿਕ ਤਕਨਾਲੋਜੀ ਇੱਕ ਸ਼ਕਤੀਸ਼ਾਲੀ ਸਾਧਨ ਵਜੋਂ ਕੰਮ ਕਰਦੀ ਹੈ, ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨ ਸਮੀਕਰਨ ਪ੍ਰੋਫਾਈਲਾਂ, ਜੀਨ ਬਣਤਰਾਂ, ਅਤੇ ਵਿਭਿੰਨ ਜੀਵ-ਵਿਗਿਆਨਕ ਪ੍ਰਕਿਰਿਆਵਾਂ ਨਾਲ ਜੁੜੇ ਅਣੂ ਵਿਧੀਆਂ ਦਾ ਪਰਦਾਫਾਸ਼ ਕਰਦੀ ਹੈ।ਬੁਨਿਆਦੀ ਖੋਜ, ਕਲੀਨਿਕਲ ਡਾਇਗਨੌਸਟਿਕਸ, ਅਤੇ ਡਰੱਗ ਡਿਵੈਲਪਮੈਂਟ ਵਿੱਚ ਵਿਆਪਕ ਤੌਰ 'ਤੇ ਅਪਣਾਇਆ ਗਿਆ, mRNA ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਸੈਲੂਲਰ ਡਾਇਨਾਮਿਕਸ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਰੈਗੂਲੇਸ਼ਨ ਦੀਆਂ ਪੇਚੀਦਗੀਆਂ ਵਿੱਚ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ।ਸਾਡੀ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ mRNA ਨਮੂਨਾ ਪ੍ਰੋਸੈਸਿੰਗ ਪ੍ਰੋਕੈਰੀਓਟਿਕ ਟ੍ਰਾਂਸਕ੍ਰਿਪਟੋਮਜ਼ ਲਈ ਤਿਆਰ ਕੀਤੀ ਗਈ ਹੈ, ਜਿਸ ਵਿੱਚ rRNA ਦੀ ਕਮੀ ਅਤੇ ਦਿਸ਼ਾਤਮਕ ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ ਸ਼ਾਮਲ ਹੈ।
ਪਲੇਟਫਾਰਮ: Illumina NovaSeq X
