ਵਿਸ਼ੇਸ਼-ਲੋਕਸ ਐਂਪਲੀਫਾਈਡ ਫ੍ਰੈਗਮੈਂਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (SLAF-Seq)
ਸੇਵਾ ਵੇਰਵੇ
ਤਕਨੀਕੀ ਸਕੀਮ
ਕੰਮ ਦਾ ਪ੍ਰਵਾਹ
ਸੇਵਾ ਦੇ ਫਾਇਦੇ
ਉੱਚ ਮਾਰਕਰ ਖੋਜ ਕੁਸ਼ਲਤਾ- ਉੱਚ-ਥਰੂਪੁੱਟ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਤਕਨਾਲੋਜੀ SLAF-Seq ਨੂੰ ਪੂਰੇ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਅੰਦਰ ਸੈਂਕੜੇ ਹਜ਼ਾਰਾਂ ਟੈਗਾਂ ਦੀ ਖੋਜ ਕਰਨ ਵਿੱਚ ਸਹਾਇਤਾ ਕਰਦੀ ਹੈ।
ਜੀਨੋਮ 'ਤੇ ਘੱਟ ਨਿਰਭਰਤਾ- ਇਹ ਸਪੀਸੀਜ਼ 'ਤੇ ਜਾਂ ਤਾਂ ਹਵਾਲਾ ਜੀਨੋਮ ਦੇ ਨਾਲ ਜਾਂ ਬਿਨਾਂ ਲਾਗੂ ਕੀਤਾ ਜਾ ਸਕਦਾ ਹੈ।
ਲਚਕਦਾਰ ਸਕੀਮ ਡਿਜ਼ਾਈਨ- ਸਿੰਗਲ-ਐਨਜ਼ਾਈਮ, ਡੁਅਲ-ਐਨਜ਼ਾਈਮ, ਮਲਟੀ-ਐਨਜ਼ਾਈਮ ਪਾਚਨ ਅਤੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਕਿਸਮ ਦੇ ਪਾਚਕ, ਸਾਰੇ ਵੱਖ-ਵੱਖ ਖੋਜ ਟੀਚਿਆਂ ਜਾਂ ਸਪੀਸੀਜ਼ ਨੂੰ ਪੂਰਾ ਕਰਨ ਲਈ ਚੁਣੇ ਜਾ ਸਕਦੇ ਹਨ।ਸਿਲੀਕੋ ਵਿੱਚ ਪੂਰਵ-ਮੁਲਾਂਕਣ ਇੱਕ ਅਨੁਕੂਲ ਐਨਜ਼ਾਈਮ ਡਿਜ਼ਾਈਨ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਵਰਤਿਆ ਜਾਂਦਾ ਹੈ।
ਕੁਸ਼ਲ ਪਾਚਕ ਪਾਚਨ- ਪੂਰਵ-ਪ੍ਰਯੋਗ ਹਾਲਤਾਂ ਨੂੰ ਅਨੁਕੂਲ ਬਣਾਉਣ ਲਈ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ, ਜੋ ਰਸਮੀ ਪ੍ਰਯੋਗ ਨੂੰ ਸਥਿਰ ਅਤੇ ਭਰੋਸੇਮੰਦ ਬਣਾਉਂਦਾ ਹੈ।ਫ੍ਰੈਗਮੈਂਟ ਕਲੈਕਸ਼ਨ ਕੁਸ਼ਲਤਾ 95% ਤੋਂ ਵੱਧ ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰ ਸਕਦੀ ਹੈ।
ਸਮਾਨ ਰੂਪ ਵਿੱਚ SLAF ਟੈਗ ਵੰਡੇ ਗਏ- SLAF ਟੈਗਸ ਸਭ ਤੋਂ ਵੱਧ ਹੱਦ ਤੱਕ ਸਾਰੇ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਵਿੱਚ ਬਰਾਬਰ ਵੰਡੇ ਜਾਂਦੇ ਹਨ, ਔਸਤਨ 1 SLAF ਪ੍ਰਤੀ 4 kb ਪ੍ਰਾਪਤ ਕਰਦੇ ਹਨ।
ਦੁਹਰਾਉਣ ਤੋਂ ਪ੍ਰਭਾਵੀ ਪਰਹੇਜ਼- SLAF-Seq ਡੇਟਾ ਵਿੱਚ ਦੁਹਰਾਉਣ ਵਾਲਾ ਕ੍ਰਮ 5% ਤੋਂ ਘੱਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਹੈ, ਖਾਸ ਤੌਰ 'ਤੇ ਉੱਚ ਪੱਧਰੀ ਦੁਹਰਾਓ ਵਾਲੀਆਂ ਨਸਲਾਂ ਵਿੱਚ, ਜਿਵੇਂ ਕਿ ਕਣਕ, ਮੱਕੀ, ਆਦਿ।
ਵਿਆਪਕ ਅਨੁਭਵ- ਪੌਦਿਆਂ, ਥਣਧਾਰੀ ਜਾਨਵਰਾਂ, ਪੰਛੀਆਂ, ਕੀੜੇ-ਮਕੌੜਿਆਂ, ਜਲ-ਜੀਵਾਂ ਆਦਿ ਨੂੰ ਕਵਰ ਕਰਨ ਵਾਲੀਆਂ ਸੈਂਕੜੇ ਕਿਸਮਾਂ 'ਤੇ 2000 ਤੋਂ ਵੱਧ ਬੰਦ SLAF-Seq ਪ੍ਰੋਜੈਕਟ।
ਸਵੈ-ਵਿਕਸਤ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕ ਵਰਕਫਲੋ- ਅੰਤਿਮ ਆਉਟਪੁੱਟ ਦੀ ਭਰੋਸੇਯੋਗਤਾ ਅਤੇ ਸ਼ੁੱਧਤਾ ਨੂੰ ਯਕੀਨੀ ਬਣਾਉਣ ਲਈ BMKGENE ਦੁਆਰਾ SLAF-Seq ਲਈ ਇੱਕ ਏਕੀਕ੍ਰਿਤ ਬਾਇਓਇਨਫੋਰਮੈਟਿਕ ਵਰਕਫਲੋ ਤਿਆਰ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸੀ।
ਸੇਵਾ ਨਿਰਧਾਰਨ
| ਪਲੇਟਫਾਰਮ | Conc.(ng/gl) | ਕੁੱਲ (ug) | OD260/280 |
| ਇਲੂਮਿਨਾ ਨੋਵਾਸੇਕ | >35 | >1.6(ਵਾਲਮ>15μl) | 1.6-2.5 |
ਸਿਫਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ ਰਣਨੀਤੀ
ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਡੂੰਘਾਈ: 10X/ਟੈਗ
| ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਆਕਾਰ | ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੇ SLAF ਟੈਗਸ |
| < 500 Mb | 100K ਜਾਂ WGS |
| 500 Mb- 1 Gb | 100 ਕੇ |
| 1 ਜੀ.ਬੀ.-2 ਜੀ.ਬੀ | 200 ਕੇ |
| ਵਿਸ਼ਾਲ ਜਾਂ ਗੁੰਝਲਦਾਰ ਜੀਨੋਮ | 300 - 400K |
| ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ
| ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕੀਤੀ ਆਬਾਦੀ ਦਾ ਪੈਮਾਨਾ
| ਲੜੀਬੱਧ ਰਣਨੀਤੀ ਅਤੇ ਡੂੰਘਾਈ
| |
| ਡੂੰਘਾਈ
| ਟੈਗ ਨੰਬਰ
| ||
| ਜੀ.ਡਬਲਿਊ.ਏ.ਐੱਸ
| ਨਮੂਨਾ ਨੰਬਰ ≥ 200
| 10 ਐਕਸ
|
ਇਸਦੇ ਅਨੁਸਾਰ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਆਕਾਰ
|
| ਜੈਨੇਟਿਕ ਈਵੇਲੂਸ਼ਨ
| ਹਰੇਕ ਦੇ ਵਿਅਕਤੀ ਉਪ ਸਮੂਹ ≥ 10; ਕੁੱਲ ਨਮੂਨੇ ≥ 30
| 10 ਐਕਸ
| |
ਸਿਫਾਰਸ਼ੀ ਨਮੂਨਾ ਡਿਲੀਵਰੀ
ਕੰਟੇਨਰ: 2 ਮਿਲੀਲੀਟਰ ਸੈਂਟਰਿਫਿਊਜ ਟਿਊਬ
ਜ਼ਿਆਦਾਤਰ ਨਮੂਨਿਆਂ ਲਈ, ਅਸੀਂ ਈਥਾਨੌਲ ਵਿੱਚ ਸੁਰੱਖਿਅਤ ਨਾ ਰੱਖਣ ਦੀ ਸਿਫ਼ਾਰਿਸ਼ ਕਰਦੇ ਹਾਂ।
ਨਮੂਨਾ ਲੇਬਲਿੰਗ: ਨਮੂਨੇ ਨੂੰ ਸਪਸ਼ਟ ਤੌਰ 'ਤੇ ਲੇਬਲ ਕੀਤਾ ਜਾਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ ਅਤੇ ਨਮੂਨਾ ਜਾਣਕਾਰੀ ਫਾਰਮ ਜਮ੍ਹਾਂ ਕਰਾਉਣ ਲਈ ਸਮਾਨ ਹੋਣਾ ਚਾਹੀਦਾ ਹੈ।
ਸ਼ਿਪਮੈਂਟ: ਡਰਾਈ-ਬਰਫ਼: ਨਮੂਨਿਆਂ ਨੂੰ ਪਹਿਲਾਂ ਬੈਗਾਂ ਵਿੱਚ ਪੈਕ ਕਰਨ ਅਤੇ ਸੁੱਕੀ ਬਰਫ਼ ਵਿੱਚ ਦਫ਼ਨਾਉਣ ਦੀ ਲੋੜ ਹੁੰਦੀ ਹੈ।
ਸਰਵਿਸ ਵਰਕਫਲੋ
ਨਮੂਨਾ QC
ਪਾਇਲਟ ਪ੍ਰਯੋਗ
SLAF-ਪ੍ਰਯੋਗ
ਲਾਇਬ੍ਰੇਰੀ ਦੀ ਤਿਆਰੀ
ਕ੍ਰਮਬੱਧ
ਡਾਟਾ ਦਾ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ
ਵਿਕਰੀ ਤੋਂ ਬਾਅਦ ਦੀਆਂ ਸੇਵਾਵਾਂ
1. ਨਕਸ਼ੇ ਦੇ ਨਤੀਜੇ ਦੇ ਅੰਕੜੇ
2. SLAF ਮਾਰਕਰ ਵਿਕਾਸ
3. ਪਰਿਵਰਤਨ ਐਨੋਟੇਸ਼ਨ
| ਸਾਲ | ਰਸਾਲਾ | IF | ਸਿਰਲੇਖ | ਐਪਲੀਕੇਸ਼ਨਾਂ |
| 2022 | ਕੁਦਰਤ ਸੰਚਾਰ | 17.694 | ਗੀਗਾ-ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮਜ਼ ਦਾ ਜੀਨੋਮਿਕ ਆਧਾਰ ਅਤੇ ਟ੍ਰੀ ਪੀਓਨੀ ਦੇ ਗੀਗਾ-ਜੀਨੋਮ ਪਾਓਨੀਆ ਓਸਟੀ | SLAF-GWAS |
| 2015 | ਨਵਾਂ ਫਾਈਟੋਲੋਜਿਸਟ | ੭.੪੩੩ | ਵਿੱਚ ਖੇਤੀ ਵਿਗਿਆਨਿਕ ਮਹੱਤਤਾ ਵਾਲੇ ਜੀਨੋਮਿਕ ਖੇਤਰਾਂ ਵਿੱਚ ਘਰੇਲੂ ਪੈਰਾਂ ਦੇ ਨਿਸ਼ਾਨ ਹਨ ਸੋਇਆਬੀਨ | SLAF-GWAS |
| 2022 | ਜਰਨਲ ਆਫ਼ ਐਡਵਾਂਸਡ ਰਿਸਰਚ | 12.822 | G. ਹਿਰਸੁਟਮ ਵਿੱਚ ਗੌਸੀਪੀਅਮ ਬਾਰਬਾਡੈਂਸ ਦੇ ਜੀਨੋਮ-ਵਿਆਪਕ ਨਕਲੀ ਘੁਸਪੈਠ ਕਪਾਹ ਦੇ ਫਾਈਬਰ ਦੀ ਗੁਣਵੱਤਾ ਅਤੇ ਉਪਜ ਦੇ ਨਾਲ-ਨਾਲ ਸੁਧਾਰ ਲਈ ਉੱਤਮ ਸਥਾਨ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰੋ ਗੁਣ | SLAF- ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਜੈਨੇਟਿਕਸ |
| 2019 | ਅਣੂ ਪੌਦਾ | 10.81 | ਜਨਸੰਖਿਆ ਜੀਨੋਮਿਕ ਵਿਸ਼ਲੇਸ਼ਣ ਅਤੇ ਡੀ ਨੋਵੋ ਅਸੈਂਬਲੀ ਵੇਡੀ ਦੀ ਉਤਪਤੀ ਨੂੰ ਦਰਸਾਉਂਦੀ ਹੈ ਇੱਕ ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਖੇਡ ਦੇ ਰੂਪ ਵਿੱਚ ਚੌਲ | SLAF- ਵਿਕਾਸਵਾਦੀ ਜੈਨੇਟਿਕਸ |
| 2019 | ਕੁਦਰਤ ਜੈਨੇਟਿਕਸ | 31.616 | ਆਮ ਕਾਰਪ, ਸਾਈਪ੍ਰਿਨਸ ਕਾਰਪੀਓ ਦੀ ਜੀਨੋਮ ਕ੍ਰਮ ਅਤੇ ਜੈਨੇਟਿਕ ਵਿਭਿੰਨਤਾ | SLAF-ਲਿੰਕੇਜ ਨਕਸ਼ਾ |
| 2014 | ਕੁਦਰਤ ਜੈਨੇਟਿਕਸ | 25.455 | ਕਾਸ਼ਤ ਕੀਤੀ ਮੂੰਗਫਲੀ ਦਾ ਜੀਨੋਮ ਫਲੀਦਾਰ ਕੈਰੀਓਟਾਈਪ, ਪੌਲੀਪਲੋਇਡ ਦੀ ਸਮਝ ਪ੍ਰਦਾਨ ਕਰਦਾ ਹੈ ਵਿਕਾਸ ਅਤੇ ਫਸਲ ਪਾਲਤੂਤਾ। | SLAF-ਲਿੰਕੇਜ ਨਕਸ਼ਾ |
| 2022 | ਪਲਾਂਟ ਬਾਇਓਟੈਕਨਾਲੋਜੀ ਜਰਨਲ | 9. 803 | ST1 ਦੀ ਪਛਾਣ ਇੱਕ ਚੋਣ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੀ ਹੈ ਜਿਸ ਵਿੱਚ ਬੀਜ ਰੂਪ ਵਿਗਿਆਨ ਦੀ ਹਿਚਹਾਈਕਿੰਗ ਸ਼ਾਮਲ ਹੁੰਦੀ ਹੈ ਅਤੇ ਸੋਇਆਬੀਨ ਦੇ ਪਾਲਣ ਦੌਰਾਨ ਤੇਲ ਦੀ ਸਮੱਗਰੀ | SLAF-ਮਾਰਕਰ ਵਿਕਾਸ |
| 2022 | ਅਣੂ ਵਿਗਿਆਨ ਦਾ ਅੰਤਰਰਾਸ਼ਟਰੀ ਜਰਨਲ | 6.208 | ਕਣਕ-ਲੇਮਸ ਮੋਲਿਸ 2Ns (2D) ਲਈ ਪਛਾਣ ਅਤੇ ਡੀਐਨਏ ਮਾਰਕਰ ਵਿਕਾਸ ਡਿਸੋਮਿਕ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ ਬਦਲ | SLAF-ਮਾਰਕਰ ਵਿਕਾਸ |
